| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,722,492 | C→A | 75.4% | T847K (ACG→AAG) | pka → | protein lysine acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,722,492 | 0 | C | A | 75.4% | 162.4 / 63.2 | 97 | T847K (ACG→AAG) | pka | protein lysine acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (11/13); new base A (35/38); total (46/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
GATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGAC > NC_000913/2722349‑2722635 | gATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGc < 6:65672/149‑1 (MQ=255)gATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGc < 1:87915/149‑1 (MQ=255) ccGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCaaa < 3:319046/148‑1 (MQ=255) cTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGt < 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tACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCATAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACATATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTAATACGATGCCAAACAAACGTGCCATGGTGGCGCTACCCCGCAAGCTc > 6:357698/1‑149 (MQ=255) cTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCgg < 1:179734/149‑1 (MQ=255) cTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCgg < 8:137290/149‑1 (MQ=255) gTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACTATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGtt < 4:51637/149‑1 (MQ=255) gTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTgg < 7:370396/119‑1 (MQ=255) gTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTgg > 8:370396/1‑119 (MQ=255) 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aGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg < 4:77673/147‑1 (MQ=255) aGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg < 5:251276/147‑1 (MQ=255) aGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACAGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg < 6:7452/147‑1 (MQ=255) gACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtggtg < 8:365225/92‑1 (MQ=255) gACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtggtg > 7:365225/1‑92 (MQ=255) cGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTgg < 1:188138/149‑1 (MQ=255) 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attgAAAAGTTGAGTACCTATACGCGAGATCACTGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTAc < 6:120707/146‑1 (MQ=255) ggAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGc > 2:384483/1‑149 (MQ=255) aaaaGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCt > 5:351847/1‑148 (MQ=255) gTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCggg > 7:46057/1‑97 (MQ=255) gTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCggg < 8:46057/97‑1 (MQ=255) aTTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGTGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTg < 4:84831/148‑1 (MQ=255) 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aaTGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATg < 4:69704/149‑1 (MQ=255) aaTGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATg > 8:209137/1‑149 (MQ=255) aTGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGt < 6:351847/149‑1 (MQ=255) tGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGTAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGtt < 5:357698/149‑1 (MQ=255) tGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGATCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGtt < 5:234897/149‑1 (MQ=255) tGGTATTAAGATGCCAAACAATCGNTGCNTGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGtt < 6:36455/149‑1 (MQ=255) gTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAACTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAgg > 6:337657/1‑81 (MQ=255) gTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAACTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAgg < 5:337657/81‑1 (MQ=255) tATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGAc < 8:238404/149‑1 (MQ=255) aTTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGa > 4:34668/1‑116 (MQ=255) aTTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGa < 3:34668/116‑1 (MQ=255) ttAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGa < 5:292196/81‑1 (MQ=255) ttAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGa > 6:292196/1‑81 (MQ=255) | GATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGAC > NC_000913/2722349‑2722635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |