| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 329,703 | A→T | 5.9% | K81* (AAG→TAG) | betT → | choline transporter of high affinity |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 329,703 | 0 | A | T | 5.9% | 244.6 / 3.7 | 80 | K81* (AAG→TAG) | betT | choline transporter of high affinity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/34); new base T (2/3); total (43/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.58e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.46e-01 | |||||||||||
AACGATCCTGTTTCGCGACTTCTCGGCCCTGTGGATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGAC > NC_000913/329555‑329850 | aaCGATCCTGTTTCGCGACTTCTCGGCCCTGTGGATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGa < 6:25042/149‑1 (MQ=255) aTCCTGTTTCGCGACTTCTCGGCCCTGTGGATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCt > 7:353599/1‑149 (MQ=255) tCCTGTTTCGCGACTTCTCGGCCCTGTGGATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTc > 1:324854/1‑149 (MQ=255) tCCTGTTTCGCGACTTCTCGGCCCTGTGGATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTc > 7:59958/1‑149 (MQ=255) tGTTTCGCGACTTCTCGGCCCTGTGGATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCggg > 6:11302/1‑149 (MQ=255) tGTTTCGCGACTTCTCGGCCCTGTGGAATGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCggg > 1:274201/1‑149 (MQ=255) tCGCGACTTCTCGGCCCTGTGGATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCa < 2:324854/148‑1 (MQ=255) gcgACTTCTCGGCCCTGTGGATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGaa > 8:82007/1‑149 (MQ=255) gACTTCTCGGCCCTGTGGATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAAc > 6:126226/1‑148 (MQ=255) ctcGGCCCTGTGGATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATcc > 2:68077/1‑148 (MQ=255) tcGGCCCTGTGGATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCa > 2:341927/1‑148 (MQ=255) gATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAAtt > 1:194502/1‑147 (MQ=255) ggCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGcc < 5:11302/148‑1 (MQ=255) gCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATc > 1:343433/1‑130 (MQ=255) gCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATc < 2:343433/130‑1 (MQ=255) ccGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCctgc > 4:124901/1‑149 (MQ=255) ccGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCctgc < 8:59958/149‑1 (MQ=255) cGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAACctgct < 5:60758/149‑1 (MQ=255) tGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTACTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGaa > 5:270313/1‑116 (MQ=255) tGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTACTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGaa < 6:270313/116‑1 (MQ=255) gACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTggg < 1:341927/148‑1 (MQ=255) ggTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTAAATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGa < 5:313938/149‑1 (MQ=255) gTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGAt < 5:126226/149‑1 (MQ=255) tttCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATg < 3:124901/149‑1 (MQ=255) tCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGc < 7:82007/148‑1 (MQ=255) tAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAACCCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGt > 2:384209/1‑149 (MQ=255) tAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGc < 8:223184/124‑1 (MQ=255) tAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGc > 7:223184/1‑124 (MQ=255) tAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGAt > 4:347921/1‑144 (MQ=255) tAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGAt < 3:347921/144‑1 (MQ=255) tAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGt > 7:220872/1‑149 (MQ=255) tAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGt > 2:247557/1‑149 (MQ=255) aaaaCCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGtt > 4:274722/1‑149 (MQ=255) aaaCCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGttt > 3:354646/1‑149 (MQ=255) aCCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTtgc > 3:80042/1‑149 (MQ=255) cTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTtgctg > 2:149719/1‑149 (MQ=255) cGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGcc < 2:194502/148‑1 (MQ=255) ggTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCgg < 1:149719/149‑1 (MQ=255) ggTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCgg > 7:322086/1‑149 (MQ=255) ttGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGTAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGa > 4:212493/1‑149 (MQ=255) ttGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGGGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGa < 1:197795/149‑1 (MQ=255) ggTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGAt < 8:353599/148‑1 (MQ=255) gTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTGTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCg > 1:227269/1‑149 (MQ=255) aCTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAACCCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGATTGCTGCCGGGATCgg > 3:269922/1‑148 (MQ=255) tATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATc < 7:18973/89‑1 (MQ=255) tATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATc < 7:378229/89‑1 (MQ=255) tATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATc > 8:378229/1‑89 (MQ=255) tgcgtgcggcAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGGGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATc < 2:244477/141‑1 (MQ=255) tgGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCt > 7:296069/1‑148 (MQ=255) ggcggcAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGa > 6:182937/1‑149 (MQ=255) gcttgaaCGCTCTATTTTGTCTTTGTGGTCTTTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGACGCTCGGGCCTGAACATTCGAAACCGGATTTCTGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGGTTGCTTCCGGGATCGGTATCGACCTGAt < 4:269922/144‑1 (MQ=255) gcggcAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGAt < 1:68077/149‑1 (MQ=255) cggcAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATg < 5:182937/149‑1 (MQ=255) cAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGTAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGttc < 3:212493/149‑1 (MQ=255) cAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGttc < 4:80042/149‑1 (MQ=255) cAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGttc < 1:134834/149‑1 (MQ=255) cAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTGGTTCGCGTTGTGGTTCGGTGTAGCTCGGGCCAGAACATTCCTAACCGGATTTCTGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGttc < 3:279953/149‑1 (MQ=255) gCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCgg < 8:288343/123‑1 (MQ=255) gCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCgg > 7:288343/1‑123 (MQ=255) gCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTtcttct > 4:315850/1‑149 (MQ=255) gCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTCTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTtcttct < 8:220872/149‑1 (MQ=255) ctctATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTtctc > 6:350110/1‑149 (MQ=255) tatTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGTAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAg > 2:357822/1‑149 (MQ=255) tatTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCGAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAg > 8:208791/1‑149 (MQ=255) tatTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAATCCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAg > 3:56764/1‑149 (MQ=255) tatTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTa < 8:296069/148‑1 (MQ=255) gTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAACCCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGa > 6:246055/1‑149 (MQ=255) tgtgGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAAGAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCGGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCg < 2:274201/148‑1 (MQ=255) cTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACg > 5:95308/1‑148 (MQ=255) tATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGt < 2:227269/149‑1 (MQ=255) tCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGCCCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGta > 3:320003/1‑148 (MQ=255) tCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGta < 1:247557/148‑1 (MQ=255) tCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTCAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTAGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGta > 4:189857/1‑148 (MQ=255) tcgTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAgccgc > 5:256119/2‑149 (MQ=255) gcgTTTTGGTTCGGTGTAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAgccgc < 1:357822/149‑1 (MQ=255) ttttGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGttc > 7:308025/1‑106 (MQ=255) ttttGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGttc < 8:308025/106‑1 (MQ=255) cGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAAc < 3:342400/114‑1 (MQ=255) cGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAAc > 4:342400/1‑114 (MQ=255) ggTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGGTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGGAGGCGCgg < 3:274722/149‑1 (MQ=255) gAAGCTCGGGCCAGAACAATCCACACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTAGCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGGAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGACGGCGCGGGAc > 8:5399/1‑149 (MQ=255) | AACGATCCTGTTTCGCGACTTCTCGGCCCTGTGGATTGGCCGCACGCTGGACTGGGTTTCTAAAACCTTCGGTTGGTACTATCTGCTGGCGGCAACGCTCTATATTGTCTTTGTGGTCTGTATCGCTTGTTCGCGTTTTGGTTCGGTGAAGCTCGGGCCAGAACAATCCAAACCGGAATTCAGCCTGCTGAGTTGGGCGGCGATGCTGTTTGCTGCCGGGATCGGTATCGACCTGATGTTCTTCTCCGTAGCCGAACCGGTAACGCAGTATATGCAGCCGCCGGAAGGCGCGGGAC > NC_000913/329555‑329850 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |