| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,175,151 | (A)6→5 | intergenic (‑125/‑237) | coaA ← / → thrU | pantothenate kinase/tRNA‑Thr |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,175,146 | 0 | A | . | 95.2% | 255.0 / 8.1 | 63 | intergenic (‑120/‑242) | coaA/thrU | pantothenate kinase/tRNA‑Thr |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base . (33/27); total (35/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.96e-01 | |||||||||||
GTCATTAACGTTTGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGAAAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCGGCTGT > NC_000913/4174998‑4175288 | gTCATTAACGTTTGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGa < 7:142200/149‑1 (MQ=255) ttAACGTTTGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGaaaaa > 1:116351/1‑149 (MQ=255) ttAACGTTTGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGaaaaa > 7:129157/1‑149 (MQ=255) tctTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAg > 4:87057/1‑148 (MQ=255) tctTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAg > 6:56905/1‑148 (MQ=255) tctTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAg > 8:290088/1‑148 (MQ=255) ataCTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCt < 1:36248/148‑1 (MQ=255) ataCTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGAGGGGGAGGAATAATAAG‑AAATATCTCTGCCAGGAAGCTa > 2:317280/1‑149 (MQ=255) aCTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATc > 7:57586/1‑149 (MQ=255) aCTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATc > 5:286198/1‑149 (MQ=255) cTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATc < 8:129157/148‑1 (MQ=255) tCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGAAAAAA‑CTCTGCCAGGAAGCTATCGt > 6:135147/1‑149 (MQ=255) tCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGt > 1:176286/1‑149 (MQ=255) tCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAACCTATctt > 6:171773/1‑147 (MQ=255) aTAATCCTGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGCATGTGTTAATGGGCAGGATGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGtt < 2:147955/148‑1 (MQ=255) aTAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGtt > 8:113103/1‑148 (MQ=255) aaGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGa > 7:5632/1‑148 (MQ=255) cATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAg > 2:348951/1‑149 (MQ=255) tGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGc > 3:129707/1‑148 (MQ=255) tttCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAAt < 5:56905/149‑1 (MQ=255) tttCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAAt < 3:87057/149‑1 (MQ=255) tCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCATATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAAtg < 4:220460/148‑1 (MQ=255) ggCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGa > 1:336850/1‑148 (MQ=255) gCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGa > 2:178660/1‑147 (MQ=255) gCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGAAATGTGa < 5:135147/147‑1 (MQ=255) gTCATAGCTCTAGCCGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGat < 2:154317/149‑1 (MQ=255) cATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGatat > 1:18984/1‑149 (MQ=255) aGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGaaaaatctc > 2:162989/1‑103 (MQ=255) aGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGaaaaatctc < 1:162989/107‑5 (MQ=255) tCGACAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGAAAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGa > 6:122481/1‑149 (MQ=255) cAAATCGATATTTGCCATTGCGCGTAACAGTTCAGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGTTAACACCAGAGGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATaaaa < 1:49606/149‑1 (MQ=255) aaaGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATaaaaa < 7:160828/149‑1 (MQ=255) tatTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTAt < 7:113103/149‑1 (MQ=255) atTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCAt < 7:79731/131‑1 (MQ=255) atTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCAt > 8:79731/1‑131 (MQ=255) tttGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATg < 5:144415/148‑1 (MQ=255) cATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAg < 2:18984/149‑1 (MQ=255) gTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGAAAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAgc < 5:122481/149‑1 (MQ=255) gTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAgcg > 8:159612/1‑149 (MQ=255) tCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAgcg > 6:297246/1‑148 (MQ=255) acaGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGtt > 2:146613/1‑135 (MQ=255) acaGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGtt < 1:146613/135‑1 (MQ=255) acaGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCAt > 2:248936/1‑149 (MQ=255) caGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACCCCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCAtt > 1:90655/1‑149 (MQ=255) aGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCAttg < 2:336850/149‑1 (MQ=255) ttCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCACTGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGGAGGAGCGCAttg < 3:229536/147‑1 (MQ=255) gAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAg > 3:106637/1‑94 (MQ=255) gAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAg < 4:106637/94‑1 (MQ=255) aTGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGa < 1:248936/149‑1 (MQ=255) ggCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAATGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTTTTGAGCTCAATGATGTTTaaa > 6:220681/1‑148 (MQ=255) aggaggGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAgt < 1:178660/149‑1 (MQ=255) aggaggGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAgt > 5:137332/1‑149 (MQ=255) gaggGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTGTGCCAGGTAGCTATAGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATTAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAgtgt < 5:220681/149‑1 (MQ=255) gaggGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAgtgt > 3:163636/1‑149 (MQ=255) gggTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGGTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGc < 7:290088/149‑1 (MQ=255) gTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCa < 6:265115/107‑1 (MQ=255) gTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCa > 5:265115/1‑107 (MQ=255) gTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCt > 6:334420/1‑148 (MQ=255) acacCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATc < 2:116351/149‑1 (MQ=255) acacCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATc < 8:57586/149‑1 (MQ=255) acacCAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCAGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATc < 6:286198/149‑1 (MQ=255) cAGATGGGGAGGAATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCATTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGcc > 1:110583/1‑149 (MQ=255) aggaATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCg > 4:232384/1‑149 (MQ=255) aggaATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGAGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCg > 3:223601/1‑149 (MQ=255) gaATAATAAG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCGATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCGGc > 1:218727/1‑149 (MQ=255) taataaG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCGGCTGt > 8:27504/1‑149 (MQ=255) taataaG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAAGGTGACAGATATTCCCTCTGTTAAAAAGAATTATGGGTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCTCAATGAGGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCGGCTGt > 1:179962/1‑149 (MQ=255) taataaG‑AAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCATTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCGGCTGt < 2:110583/149‑1 (MQ=255) | GTCATTAACGTTTGCTCTTTTATACTCATAAGCATGTTTCTGGCGGTCATAGCTCTATCGGCAAAGCGATATTTGCCATGGCGCGTCACAGTTCTGTTGAATGGGTTAATGGGCAGGAGGGTAACACCAGATGGGGAGGAATAATAAGAAAAAATCTCTGCCAGGAAGCTATCGTTGAAAAGCAATGTGACAGATATTCCATCTGATAAAAAGAATTATGGTTTAGCAGGAGCGCATTGTTGAGCACAATGATGTTGAAAAAGTGTGCTAATCTGCCCTCCGTTCGGCTGT > NC_000913/4174998‑4175288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |