| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,629,219 | G→A | 5.8% | intergenic (‑281/‑71) | yfgF ← / → yfgG | cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, anaerobic/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,629,219 | 0 | G | A | 5.8% | 216.6 / 2.0 | 69 | intergenic (‑281/‑71) | yfgF/yfgG | cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, anaerobic/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/30); new base A (2/2); total (37/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
TATATCAAACAAAATAACCCTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTT > NC_000913/2629072‑2629366 | tatatCAAACAAAATAACCCTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGa > 4:177594/1‑149 (MQ=255) tCAAACAAAATAACCCTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCAt > 4:102685/1‑149 (MQ=255) aaacaaaATAACCCTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑ATGAATTGACCAtt < 8:227052/148‑1 (MQ=255) aacaaaATAACCCTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTAATCATTATTACAACATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAATTATGTATCCACTGACGCTTTTTAACATAACT‑AAGAATTGACCAtttt > 6:125085/1‑149 (MQ=255) acaaaATAACCCTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTg > 5:229845/1‑149 (MQ=255) tAACCCTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGa < 4:220767/135‑1 (MQ=255) tAACCCTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGa > 3:220767/1‑135 (MQ=255) tGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCAACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGATATGc > 4:41128/1‑148 (MQ=255) aTTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGcc < 7:143744/147‑1 (MQ=255) ttAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCtt > 7:120172/1‑148 (MQ=255) ttAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTa < 5:66452/149‑1 (MQ=255) aTGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAAt < 8:47299/148‑1 (MQ=255) tGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACAATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATg > 3:111755/1‑148 (MQ=255) ttattaCGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAg > 6:89731/1‑148 (MQ=255) ataCGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTAcc > 1:70056/2‑149 (MQ=255) taCGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTAACCATTTTGTCCTGTGTTGCGTTAATTTAATTAcct > 7:38619/1‑148 (MQ=255) taCGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTAACCATTTTGTCCTGTGTTGCGTAAATGTAATTAcct > 7:42690/1‑148 (MQ=255) gTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTc > 7:125685/1‑148 (MQ=255) aTCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCcaca < 7:6714/148‑1 (MQ=255) aTCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAg > 1:62518/1‑149 (MQ=255) gTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTgg > 7:101172/1‑149 (MQ=255) ttAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTgg < 8:125685/148‑1 (MQ=255) ttAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTgg < 1:99870/148‑1 (MQ=255) ttAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTgg < 4:111755/148‑1 (MQ=255) aataTTCATCATTTATTCATCATCATTGTATATAATTAATTTAACTTCGATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTATAACATAACG‑ATGAATTGACCATTTTGTCCTGTTTTGCCTTAATGTATGTACCGTCCTCTGCGTgg < 6:43929/145‑1 (MQ=255) atcatTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACt > 4:45454/1‑149 (MQ=255) atcatTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCATGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACt > 7:243058/1‑149 (MQ=255) tcatTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACt > 1:107906/1‑148 (MQ=255) attattACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTc < 3:56142/148‑1 (MQ=255) attattACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTc < 2:70056/148‑1 (MQ=255) ttattaCATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTc > 1:240858/1‑147 (MQ=255) catcatcatTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCtgtt > 4:203218/1‑99 (MQ=255) catcatcatTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCtgtt < 3:203218/99‑1 (MQ=255) catcatcatTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAAcc < 3:102685/149‑1 (MQ=255) catcatcatTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAAc < 6:189016/148‑1 (MQ=255) tcatcatTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCtt < 3:177594/149‑1 (MQ=255) atTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTtgt < 8:120172/148‑1 (MQ=255) ttGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTtgt > 2:236422/1‑147 (MQ=255) tAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTc < 2:213970/149‑1 (MQ=255) aaaTAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGt > 4:196851/1‑147 (MQ=255) aataatTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑ATGAATTGACCATTTTGTACTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAg < 3:41128/149‑1 (MQ=255) aataatTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGt < 4:151538/98‑1 (MQ=255) aataatTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCa < 6:229845/148‑1 (MQ=255) aataatTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAg < 1:236422/149‑1 (MQ=255) aataatTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACAATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGt > 3:151538/1‑98 (MQ=255) attaaattaaCTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCaa > 4:106564/1‑149 (MQ=255) ttaaattaaCTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGAACATTTTGTCCTGTTGTGCCTGAATGTTCGTACCGTCCACAGATTGGGACATACTTCAAGGGACCTTTTGTGAGGCTGGCAAc > 7:174577/1‑149 (MQ=255) aattaaCTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAg > 7:158386/1‑149 (MQ=255) caataaaTTAAAATATGGATTCACTTTAGGTTTTTTACATAAAGTATAAATAAACAATTTTGT‑CTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGaaaa < 8:38619/143‑1 (MQ=255) cATTACATTTAAATATTGTTTCACTGTCGGTTTTTTTCATAACG‑TACTATTAACCATTTTGGTCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGaaaa < 8:42690/149‑1 (MQ=255) cATAACATTAAAAAATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATAATTCAAGGAACCATTTGTGAGACAGGCAACCAGTAAGAGaaaa > 3:191618/1‑149 (MQ=255) aCATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGa > 6:214344/1‑148 (MQ=255) aCATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGa < 2:62518/148‑1 (MQ=255) ttATAATATGTATACACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATg < 1:79750/136‑1 (MQ=255) ttAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATTTAATTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGccaca > 7:146596/1‑148 (MQ=255) ttAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCAACAGACTGGGACATACTTCAAGGAACATTTTGTGAGTAAGGCAACCAGTATg > 2:79750/1‑136 (MQ=255) aaaaTATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGa > 3:157503/1‑149 (MQ=255) aaaTATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGa < 5:125085/148‑1 (MQ=255) tGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGaa < 2:215432/101‑1 (MQ=255) tGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGaa > 1:215432/1‑101 (MQ=255) tGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTaa < 3:45454/148‑1 (MQ=255) aCGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAATAGTCGCATGAc > 8:163400/1‑149 (MQ=255) ttttttACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCg > 1:230550/1‑148 (MQ=255) ttttttACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCg > 6:14320/1‑148 (MQ=255) ttAAATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGGTGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACAGATTTAACAGTCGCATGACCCGTAta < 8:146596/148‑2 (MQ=255) cG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCtc < 3:196851/149‑1 (MQ=255) aagaaTTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCtcat < 2:107906/149‑1 (MQ=255) gaaTTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCtcat > 6:198133/1‑147 (MQ=255) ttGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTATGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCt > 4:52078/1‑149 (MQ=255) gACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCtt < 5:89731/148‑1 (MQ=255) | TATATCAAACAAAATAACCCTGATTAATGAATTATTACGTTTATCATGTTAATTCATCATTATTACATCATCATTGTAAATAATTAAATTAACTTCCATAACATTAAAATATGTATCCACTGACGCTTTTTTACATAACG‑AAGAATTGACCATTTTGTCCTGTTGTGCCTTAATGTAAGTACCGTCCACAGCGTGGGACATACTTCAAGGAACCTTTTGTGAGTCAGGCAACCAGTATGCGAAAACGACACCGATTTAACAGTCGCATGACCCGTATCGTACTGCTCATCAGCTT > NC_000913/2629072‑2629366 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |