| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,617,565 | A→G | 5.9% | T180A (ACC→GCC) | ydeA → | arabinose efflux transporter, arabinose‑inducible |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,617,565 | 0 | A | G | 5.9% | 206.0 / 3.4 | 68 | T180A (ACC→GCC) | ydeA | arabinose efflux transporter, arabinose‑inducible |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/31); new base G (2/2); total (34/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.78e-01 | |||||||||||
GCCGGGAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATA > NC_000913/1617421‑1617713 | gccggGAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCt < 6:304531/149‑1 (MQ=255) cggGAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCttt < 8:334385/149‑1 (MQ=255) gAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTtgt > 1:73647/1‑149 (MQ=255) aGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGa < 1:64535/149‑1 (MQ=255) cacaGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGAtt < 6:279533/149‑1 (MQ=255) cacaGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGAtt < 4:352219/149‑1 (MQ=255) aGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAg > 7:82955/1‑149 (MQ=255) ttGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGTCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACt > 5:260655/1‑149 (MQ=255) ttGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACt > 5:261760/1‑149 (MQ=255) ttGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACt > 4:171452/1‑149 (MQ=255) gAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACtt < 7:242563/148‑1 (MQ=255) gTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATTGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGGTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTccc < 6:52043/149‑1 (MQ=255) tttAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCt < 1:164877/149‑1 (MQ=255) tAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCtt > 1:206708/1‑148 (MQ=255) aCCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAg > 7:175123/1‑149 (MQ=255) cGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGt > 4:243053/1‑148 (MQ=255) cAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCa < 8:175123/148‑1 (MQ=255) gCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGtt < 2:132511/148‑1 (MQ=255) cGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCt > 3:116324/1‑123 (MQ=255) cGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCt < 4:116324/123‑1 (MQ=255) cGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCa < 2:73647/149‑1 (MQ=255) gATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCAc > 3:34667/1‑149 (MQ=255) aTGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACt < 2:206708/149‑1 (MQ=255) tCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTTGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGaaa < 3:171452/149‑1 (MQ=255) tCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGaaa < 5:89578/149‑1 (MQ=255) tCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGaa > 8:95767/1‑148 (MQ=255) ttAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAg > 4:233642/1‑149 (MQ=255) aGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCg < 8:281364/134‑1 (MQ=255) aGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCg > 7:281364/1‑134 (MQ=255) aGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGc < 3:243053/148‑1 (MQ=255) aGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTAGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGcc > 3:224937/1‑149 (MQ=255) tACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTccc < 8:82955/148‑1 (MQ=255) ctctCGGGCGCATTGTGGGCCGGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTa > 6:7024/1‑149 (MQ=255) cGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCa > 8:350307/1‑127 (MQ=255) cGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCa < 5:240602/127‑1 (MQ=255) cGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCa < 7:350307/127‑1 (MQ=255) cGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCa > 6:240602/1‑127 (MQ=255) gggCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTAtt < 3:233642/146‑1 (MQ=255) ggCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTc < 1:5818/149‑1 (MQ=255) tgGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCg > 5:209956/1‑149 (MQ=255) ggCCAGTATTTCGGTGGGCGAATGACCTGCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCCCCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGc < 2:88013/149‑1 (MQ=255) gCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCa > 3:143218/1‑149 (MQ=255) gCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCa > 5:380697/1‑149 (MQ=255) tATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATtgat < 6:380697/149‑1 (MQ=255) attttCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGGATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATtgat < 1:88282/147‑1 (MQ=255) ggCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCatttat > 2:104951/1‑149 (MQ=255) gACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCGCCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTaa > 8:262838/1‑149 (MQ=255) gACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCGCCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTa > 8:256615/1‑148 (MQ=255) aCCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGaaa < 7:358180/96‑1 (MQ=255) aCCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGaaa > 8:358180/1‑96 (MQ=255) ccTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACt < 5:7024/149‑1 (MQ=255) ccTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTACGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGATCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACt > 1:273562/1‑149 (MQ=255) tcttcGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCATCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACtgtg > 1:258597/1‑149 (MQ=255) ttcGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTgtggt > 5:124315/1‑149 (MQ=255) gcgATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTGCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTACCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGtggtgg < 4:224937/148‑1 (MQ=255) gATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGtggtgg < 6:124315/146‑1 (MQ=255) gATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTg > 8:348878/1‑149 (MQ=255) tATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCg > 1:261692/1‑149 (MQ=255) ggggCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTcc < 7:345383/94‑1 (MQ=255) ggggCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTcc > 8:345383/1‑94 (MQ=255) gggCGCTTATCGCCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCa < 7:262838/148‑1 (MQ=255) gggCGCTTATCGCCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCa < 7:256615/148‑1 (MQ=255) gggCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCAt < 6:209956/149‑1 (MQ=255) gggCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCAt > 4:202263/1‑149 (MQ=255) ttATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACg > 7:25133/1‑149 (MQ=255) ttATCACCCTTTTGTGCCTGATTAACTTACATCCCATACTGCCCATTGAGCATACCGCATCACTGAAAAGCCTCCCGCTATAGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGAGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACg > 1:407405/1‑149 (MQ=255) tCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGt < 7:119552/114‑1 (MQ=255) tCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGt > 8:119552/1‑114 (MQ=255) aCCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGTATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATa > 2:69780/1‑149 (MQ=255) | GCCGGGAAGCGAGCACAGGCATTGAGTTTAATTGCCACCGGTACAGCACTGGCGATGGTCTTAGGTTTACCTCTCGGGCGCATTGTGGGCCAGTATTTCGGTTGGCGAATGACCTTCTTCGCGATTGGTATTGGGGCGCTTATCACCCTTTTGTGCCTGATTAAGTTACTTCCCTTACTGCCCAGTGAGCATTCCGGTTCACTGAAAAGCCTCCCGCTATTGTTCCGCCGCCCGGCATTGATGAGCATTTATTTGTTAACTGTGGTGGTTGTCACCGCCCATTACACGGCATA > NC_000913/1617421‑1617713 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |