| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4235756 | 106 (1.290) | 3 (0.040) | 3/242 | NT | 3.0% | intergenic (+349/‑150) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
| ? | NC_000913 | = 4235758 | 98 (1.300) | intergenic (+351/‑148) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAA > NC_000913/4235610‑4235900 | cccTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTg > 4:87180/1‑148 (MQ=255) ttGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAaac < 4:245285‑M2/149‑4 (MQ=255) gTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATATGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAaacttatat < 2:370609‑M2/149‑10 (MQ=255) 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tAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGat < 3:245285/148‑1 (MQ=255) aaCGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGAGTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGatat > 7:292981/1‑149 (MQ=255) ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattca < 3:327193/149‑1 (MQ=255) ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattca < 4:280185/149‑1 (MQ=255) ggAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATattca > 1:30915/1‑149 (MQ=255) 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1:43305/148‑1 (MQ=255) gTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGGATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCcattcatt > 4:223576/1‑149 (MQ=255) ttATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCcattcatt > 5:134921/1‑148 (MQ=255) aTTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCaa > 1:97611/1‑149 (MQ=255) ttAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTGTAGTTGTGTATCCTCGATCCGGCCCGAAATGTGTTTGGGTAAATCTCGATGCATTCAAt > 2:69660/1‑148 (MQ=255) aaaTATAAGTTtcaacttatatttaaataacaataaaaatcataaacttaaaataaaaacaaaagcaattaatctgcgtattttccgaaataaacaacgattaaaaatctattttaggattaacctcacggtatgatttccgttaaat < 2:194291‑M1/148‑138 (MQ=255) 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5:206563‑M1/113‑112 (MQ=255) tttcaacttatatttaaataacaataaaaatcataaacttaaaataaaaacaaaagcaattaatctgcgtattttccgaaataaacaacgattaaaaatctattttaggatta > 6:206563‑M1/1‑2 (MQ=255) | CCCTTGTCTGTAATTTAACGGAAATCATACCGTGAGGTTAATCCTAAAATAGATTTTTAATCGTTGTTTATTTCGGAAAATACGCAGATTAATTGCTTTTGTTTTTATTTTAAGTTTATGATTTTTATTGTTATTTAAATATAAGTTGAAACTTATATTTGATATTCATTCCAATTATCCTAAAACGCCATCGCTAATTCCCCGCGCCGTAATTCGCATGCTTTAGTTGTGTATACTCGATCCCGCCCGAAATGTTTTTGGGTAAATCTCCATTCATTCAATGAAGGGAAA > NC_000913/4235610‑4235900 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |