| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3898629 = | NA (NA) | 3 (0.040) | 3/248 | NT | NA | intergenic (+20/+42) | cbrC/yieK | UPF0167 family protein/putative 6‑phosphogluconolactonase |
| ? | NC_000913 | 3898659 = | NA (NA) | intergenic (+50/+12) | cbrC/yieK | UPF0167 family protein/putative 6‑phosphogluconolactonase | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGTGCCTGCGCTTTACCC > NC_000913/3898512‑3898806 | aTCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGAGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACCTCCGGCCTTa > 6:338116/1‑149 (MQ=255) aGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTCTGGGCTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTc > 7:1012/1‑149 (MQ=255) gCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTa < 5:235887/144‑1 (MQ=255) gCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTAttt < 2:338413/147‑1 (MQ=255) gCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCt > 1:77695/1‑149 (MQ=255) cTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCtt < 5:96501/149‑1 (MQ=255) tAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCtt > 3:146280/1‑148 (MQ=255) ggttaccgaagatgttccagcttccgtgttgcagctgcatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataaggccggagcgtaattcacacatccggcctTATTTCTTaa < 1:122449‑M2/10‑1 (MQ=255) cTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTaa < 4:182919/149‑1 (MQ=255) cTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCATCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTaa < 2:58177/149‑1 (MQ=255) tGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCAGCTGTCTCCAATGAGGCAACCTGAGACTGTTGGGTTATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGCGAACAGTCCGGA‑GCGTAATTCAGACATCCGGCCTTAGTTCTTAAGCTTAAc > 4:154814/1‑149 (MQ=255) gCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAAcc > 8:313701/1‑149 (MQ=255) aaaaGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGa < 8:1012/149‑1 (MQ=255) aaaaGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGa < 2:6259/149‑1 (MQ=255) aaaGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAg < 2:6460/149‑1 (MQ=255) gggTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGc < 7:313701/149‑1 (MQ=255) gtCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAAtt < 3:89372/149‑1 (MQ=255) tCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGTCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCgg > 4:336137/1‑148 (MQ=255) gggTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGc > 7:275721/1‑149 (MQ=255) 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agaACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGAcc < 2:77695/149‑1 (MQ=255) agaACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGAcc < 5:14175/149‑1 (MQ=255) aCAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTg < 7:136138/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGc < 8:275721/149‑1 (MQ=255) ggccggatgtgtgaattacgctccggcctTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGaa > 3:49564‑M2/30‑96 (MQ=255) ggccggatgtgtgaattacgctccggcctTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGaa < 4:49564‑M2/67‑1 (MQ=255) GA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACAt > 2:115810‑M1/1‑149 (MQ=255) atcGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGATTAACCGTGTTCTAATTCTGCGGCAGCGTCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAAAATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACAtt < 3:154814/147‑1 (MQ=255) gCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTg > 2:106278/1‑114 (MQ=255) gCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTg < 1:106278/114‑1 (MQ=255) tAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTc < 8:365525/149‑1 (MQ=255) aTTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAg < 3:336137/149‑1 (MQ=255) aTTCACACATACGGCCTTATTTCTTAAACTTAACCGAGTGATAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCATCGATTACCATAACCGAAGGATTCAGCTCCAAAAAGGAAGCTGGAACATCTACGTTAACCGGAACTTTCAGAACATTTTTCAg > 8:313767/1‑149 (MQ=255) ttCACACATCCGTCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCGGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGt < 8:318461/149‑1 (MQ=255) acacaTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCATCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGTGc < 4:146280/148‑1 (MQ=255) acacaTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGTGc < 7:193645/148‑1 (MQ=255) cgctccggcctTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATTCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGTGCCTg < 2:122449‑M2/138‑1 (MQ=255) aTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGTGCCTgcg > 8:237562/1‑149 (MQ=255) ggcctTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGTGCCTGCGCttt < 2:177347‑M2/144‑1 (MQ=255) ggcctTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGTGCCTGCGCtt > 8:245516‑M2/6‑148 (MQ=255) cctTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGTGCCTGCGCTTTAc < 2:166416‑M2/146‑1 (MQ=255) cctTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGTGCCTGCGCTTTAc > 4:244324‑M2/4‑149 (MQ=255) ctTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGTGCCTGCGCTTTAcc > 7:162328‑M2/3‑149 (MQ=255) tTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTc < 8:297108‑M2/130‑1 (MQ=255) tTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTc > 7:297108‑M2/2‑131 (MQ=255) tTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGTGCCTGCGCTTTAccc > 1:364973‑M2/2‑149 (MQ=255) | ATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA‑GCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGCAGAACATTTTTCAGTGCCTGCGCTTTACCC > NC_000913/3898512‑3898806 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |