| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,316,235 | G→T | 5.1% | intergenic (‑200/+181) | yciG ← / ← trpA | KGG family protein/tryptophan synthase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,316,235 | 0 | G | T | 5.1% | 262.0 / 3.6 | 78 | intergenic (‑200/+181) | yciG/trpA | KGG family protein/tryptophan synthase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/35); new base T (2/2); total (41/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.92e-01 | |||||||||||
GACACTCATTAAAATTAGTCGCTAATGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGATTTTTCCGGCTTCATTAAAGAAAGT > NC_000913/1316088‑1316381 | gACACTCATTAAAATTAGTCGCTAATGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTgg > 8:97808/1‑149 (MQ=255) acacTCATTAAAATTAGTCGCTAATGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGgt < 5:189461/149‑1 (MQ=255) tCATTAAAATTAGTCGCTAATGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTa > 3:344645/1‑149 (MQ=255) aaaaTTAGTCGCTAATGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGTAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTg > 5:332510/1‑149 (MQ=255) aaTTAGTCGCTAATGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCg < 8:318617/149‑1 (MQ=255) gCTAATGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATg > 8:257269/1‑136 (MQ=255) gCTAATGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAAt > 1:98118/1‑149 (MQ=255) gCTAATGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAAt < 2:98118/149‑1 (MQ=255) gCTAATGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAAt > 3:54734/1‑149 (MQ=255) gCTAATGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAAt > 3:226605/1‑149 (MQ=255) aTGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAAtttgt < 6:180964/149‑1 (MQ=255) aTGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAAttt < 4:54734/147‑1 (MQ=255) tGAGAATTAGTCAAATTAAGCTCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGTAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAAtttgtt < 7:340752/149‑1 (MQ=255) agaATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAAtttgttt < 5:126397/148‑1 (MQ=255) gaATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGa < 4:344645/149‑1 (MQ=255) aaTTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTTGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGAt > 7:121220/1‑149 (MQ=255) aaTTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTTGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGAt > 7:115315/1‑149 (MQ=255) aTTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGAtt < 5:120864/149‑1 (MQ=255) ttAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATta > 1:18807/1‑149 (MQ=255) gTCAAATTAATCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTTGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATtata < 1:255747/148‑1 (MQ=255) cAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATAtt < 2:18807/148‑1 (MQ=255) aaaTTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTTCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTAc > 4:194033/1‑149 (MQ=255) aTTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTg < 6:126635/149‑1 (MQ=255) ttAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGt < 4:240667/149‑1 (MQ=255) aaGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGtt < 4:226605/148‑1 (MQ=255) cgcAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTTGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGc < 8:121220/149‑1 (MQ=255) cgcAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTTGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGc < 8:115315/149‑1 (MQ=255) gaagaTAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATAtt < 3:7560/131‑1 (MQ=255) gaagaTAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATAtt > 4:7560/1‑131 (MQ=255) agaTAGAGGGAAAATATAATTTGAGGAACATTCTGGATATATAACCAATTACATCAGGAATAAGAGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGTTGTTATCTTTCAGGATTAAGTTGTTAGATTAAATTACTGTTGGGCGGAAAAATGa > 4:381914/1‑149 (MQ=255) gaTAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGAc < 8:246651/149‑1 (MQ=255) tAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACg > 1:218567/1‑148 (MQ=255) gggAAAATATATTTTGATTAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGt < 3:242493/149‑1 (MQ=255) ggAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGtt > 5:84758/1‑149 (MQ=255) atTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGa > 3:275712/1‑149 (MQ=255) atTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGa > 5:376954/1‑149 (MQ=255) aGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGTAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCggg < 1:155550/148‑1 (MQ=255) aGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCgggg > 6:314811/1‑149 (MQ=255) aGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCggg < 6:332510/148‑1 (MQ=255) aGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCggg < 5:239401/148‑1 (MQ=255) gAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTg < 1:260587/108‑1 (MQ=255) gAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTg > 2:260587/1‑108 (MQ=255) gAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCgggtt > 1:257058/1‑146 (MQ=255) gAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGt > 5:123151/1‑148 (MQ=255) tCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACATAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAg > 8:404977/1‑145 (MQ=255) tCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACATAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAg < 7:404977/145‑1 (MQ=255) gATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACgg > 3:330251/1‑149 (MQ=255) ttAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGAtt > 4:256629/1‑83 (MQ=255) ttAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGAtt < 3:256629/83‑1 (MQ=255) ttAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTaaaaa < 2:218567/149‑1 (MQ=255) ttAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTaaaaa < 6:123151/149‑1 (MQ=255) tAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTaaa > 3:301405/1‑146 (MQ=255) aCAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGAACGGTGTAAGCGAAACGGTAAAAAGa > 5:48935/1‑148 (MQ=255) aaTTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGaaaa > 8:117716/1‑99 (MQ=255) aaTTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGaaaa < 7:117716/99‑1 (MQ=255) cTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATAtt > 4:132444/1‑148 (MQ=255) aGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAAt > 2:76293/1‑149 (MQ=255) gAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATtata > 5:108168/1‑70 (MQ=255) gAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATtata < 6:108168/70‑1 (MQ=255) gAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGAAAAAAGATAAATATTAAATg > 2:123874/1‑148 (MQ=255) aaTAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGaa > 8:201905/1‑149 (MQ=255) gTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAg > 8:204473/1‑149 (MQ=255) gACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGa > 7:289220/1‑149 (MQ=255) agagAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGAttttt > 6:104600/1‑149 (MQ=255) gagaAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGTGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGAttttt < 5:314811/148‑1 (MQ=255) gagaAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGATTTTTc < 6:84758/149‑1 (MQ=255) gagaAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGATTTTTc < 3:194033/149‑1 (MQ=255) gagaAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCCGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGATTTTTc > 4:258424/1‑149 (MQ=255) gaATATTTTTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGTGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGATTTTTcc < 6:48935/148‑1 (MQ=255) aaaaTTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGt > 3:267567/1‑78 (MQ=255) aaaaTTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGATTTTTCCgg > 3:368026/1‑149 (MQ=255) aaTTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAg < 1:76241/136‑1 (MQ=255) aaTTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAg > 2:76241/1‑136 (MQ=255) aaTTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGATTTTTCCGGCt > 7:157907/1‑149 (MQ=255) ttttACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAg < 7:26011/127‑1 (MQ=255) ttttACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAg > 8:26011/1‑127 (MQ=255) aCTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGATTTTTCCGGCTTCATTaaagaaa < 6:376954/148‑1 (MQ=255) aCTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTAGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGATTTTTCCGGCTTCATTaaagaaa < 4:368026/148‑1 (MQ=255) cTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGATTTTTCCGGCTTCATTAAAGAAAGt > 5:98246/1‑149 (MQ=255) | GACACTCATTAAAATTAGTCGCTAATGAGAATTAGTCAAATTAAGCGCAACGAGAAGATAGAGGGAAAATATATTTTGAGGAACATTCTGGATATATTAACAATTACCTGAGGAATAAGTGACTTAGAGAAAATTATTGATTTTACTGGTGTTATGTTGCGGGATTAATTTGTTTGATTATATTACTGTTGGGCGGAAAAATGACGTAAGTTGACGTTCGACCGGGGTAAGCGAAACGGTAAAAAGATAAATATTAAATGAATTTAGGATTTTTCCGGCTTCATTAAAGAAAGT > NC_000913/1316088‑1316381 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |