| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3375666 = | 108 (1.330) | 4 (0.050) | 4/246 | NT | 4.0% | coding (798/1368 nt) | dcuD | putative transporter |
| ? | NC_000913 | 3375686 = | 92 (1.210) | coding (818/1368 nt) | dcuD | putative transporter | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
AAAATATCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTC > NC_000913/3375539‑3375831 | aaaaTATCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCtg > 4:202579/1‑149 (MQ=255)aaaaTATCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCACCtg < 2:347053/149‑1 (MQ=255) aaaTATCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCtgg > 4:24882/1‑149 (MQ=255) aaaTATCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCtgg > 3:123612/1‑149 (MQ=255) aaTATCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCtggt > 8:166693/1‑149 (MQ=255) atatCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCtggtg < 4:123612/149‑1 (MQ=255) atcaatcaCGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCtggtggt > 1:300606/1‑149 (MQ=255) aatccCGACCAGGCACAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCtggtggtgg < 2:79576/148‑1 (MQ=255) aatcaCGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTggtggtggt < 3:202579/149‑1 (MQ=255) atcaCGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTAGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTggtggtggt > 5:102359/1‑148 (MQ=255) tcaCGAACAGGCAGCTCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTAATACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGa < 6:285799/149‑1 (MQ=255) tcaCGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGa > 5:170250/1‑149 (MQ=255) gAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGt > 6:138386/1‑148 (MQ=255) aaCAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTa < 7:244700/149‑1 (MQ=255) 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2:102570/1‑148 (MQ=255) gCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGcc > 7:146027/1‑148 (MQ=255) gCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCa > 1:298578/1‑149 (MQ=255) tGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGGTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAAc > 2:235371/1‑149 (MQ=255) gatgcagttctgactgcatcTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACg > 4:162163‑M2/21‑149 (MQ=255) ggccgTCCGAACTGCATCGGGGGGGGGTGAGGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTGGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTg < 5:261139/145‑1 (MQ=255) TGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTg < 5:277552‑M1/149‑1 (MQ=255) TGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTg > 1:102570‑M1/1‑149 (MQ=255) GTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTaa < 7:276441‑M1/149‑1 (MQ=255) TCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAAc < 7:352479‑M1/149‑1 (MQ=255) aaCTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCtg > 1:367787/1‑149 (MQ=255) ctgcatcTGGTGGTGGTTATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGGTTGTTGAGTTCTTACGCAAGCATCACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACTGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTTGTAACGCtggt < 8:316159‑M2/142‑1 (MQ=255) ctgcatcTGGTGGTGGTGATATTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCtggt > 4:285033‑M2/8‑149 (MQ=255) tgcatcTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCtggtg < 5:29597‑M2/143‑1 (MQ=255) tgcatcTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGAAGTTTGCCAACGTGGTAACGCtggtg > 1:130435‑M2/7‑149 (MQ=255) catcTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCtggtgg < 6:277552‑M2/144‑1 (MQ=255) catcTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCtggtg < 3:285033‑M2/143‑1 (MQ=255) catcTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTggtggt < 8:311470‑M2/145‑1 (MQ=255) atcTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTc > 2:342922‑M2/4‑149 (MQ=255) atcTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTc > 8:357032‑M2/4‑149 (MQ=255) atcTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCACTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTc > 5:360341‑M2/4‑149 (MQ=255) | AAAATATCAATCACGAACAGGCAGAGCAAAAAGCTCTCGATAATGTCCCGCCGCTCTATTACGCCATTTTACCTGTGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTC > NC_000913/3375539‑3375831 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |