| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,250,156 | C→T | 5.0% | T201T (ACC→ACT) | malM → | maltose regulon periplasmic protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,250,156 | 0 | C | T | 5.0% | 257.1 / 2.3 | 79 | T201T (ACC→ACT) | malM | maltose regulon periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/38); new base T (2/2); total (39/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.67e-01 | |||||||||||
GGGCAGCAAAAACTTTATGTTCTGGTCTTTACCACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGCTGTGGCTGCACCCGCTCCGGCACCGGTGAA > NC_000913/4250010‑4250302 | gggCAGCAAAAACTTTATGTTCTGGTCTTTACCACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGa < 3:168554/149‑1 (MQ=255) ggCAGCAAAAACTTTATGTTCTGGTCTTTACCACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGAt < 1:139715/149‑1 (MQ=255) ggCAGCAAAAACTTTATGTACTCGTCATTACCAAGGAAAAAGATCTCCAGCACACGACCCAACTGCTCGACCCGCCTAAAGCCTATGACAAGGCCGTCGGTAACTCGCACCCGCAAATCCCCCATCCGTTTGCTCGTCATACAACCGAt > 2:166567/1‑149 (MQ=255) cagcaAAAACTTTATGTTCTGGTCTTTACCACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAACGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCTGTTGCTCGTCATACCACCGATgg < 6:212212/149‑1 (MQ=255) aaaaCTTTATGTTCTGGTCTTTACCACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGCCCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTac > 6:232029/1‑149 (MQ=255) tttATGTTCTGGTCTTTACCACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTactgaaa > 1:352728/1‑149 (MQ=255) tATGTTCTGGTCTTTACCACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGGTATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTactgaaac < 1:317449/148‑1 (MQ=255) gTTCTGGTCTTTACCACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTactgaaactga > 6:206586/1‑148 (MQ=255) cTGGTCTTTACCACGGAAAAAGATCTCCAGCAGCCGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGt > 1:80705/1‑149 (MQ=255) ttCTTTACCACGGCAAACGATCTCCATCATAGGACCCCACCTCTCTACCCGTCTACATCCTAAGCCAACTGCGTCCCTCACTAGATCCCGGAAATCCCCGCTCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGa < 2:298397/147‑1 (MQ=255) tCTTTACCACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGaaa < 1:238663/149‑1 (MQ=255) tCTTTACCACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGaaa < 5:206586/149‑1 (MQ=255) cctcGGAAAAAGATCTCGAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAAc < 1:166567/146‑1 (MQ=255) ccACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAAc < 1:364265/149‑1 (MQ=255) cACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGt < 6:189408/138‑1 (MQ=255) cACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGt > 5:189408/1‑138 (MQ=255) cACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGATAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCACGGATATCCCCGATACGGTTGATCGTCATACCACCGATGGCTAACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAAct > 4:274201/1‑149 (MQ=255) aCGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAActc > 7:69828/1‑149 (MQ=255) aCGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAActc > 3:325310/1‑149 (MQ=255) aCGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAActc > 7:75133/1‑149 (MQ=255) cGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAActc > 7:258376/1‑148 (MQ=255) ggAAAAGGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAA‑CCTATGCCAAGGGCGGCCGTAACTCGCACCCGGGTATCCCCGCTCCGGTTGCTGGTCATTCCACCGCTGGCGTACGGAAACGGCAAGTGAAAACCAAcgccac > 3:292501/1‑148 (MQ=255) ggAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAActcca < 7:370730/149‑1 (MQ=255) aGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAActccagctcca < 4:325310/149‑1 (MQ=255) cagcagACGACGCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCgtgt < 1:325277/148‑1 (MQ=255) cagcagACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGt > 2:177715/1‑122 (MQ=255) cagcagACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGt < 1:177715/122‑1 (MQ=255) gcagACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACACCAGCTCCAGCGTGTTgg > 4:324351/1‑149 (MQ=255) acgacCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAg > 3:290470/1‑148 (MQ=255) gacCCAACTTCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGCAACTGAAAGTGAAATCGAACGCCAGCTCCCGCGTGTTGGGAGGAc > 2:216100/1‑149 (MQ=255) acCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGAcc < 3:55135/149‑1 (MQ=255) acCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGAcc > 7:199071/1‑149 (MQ=255) ccAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCtt > 2:64524/1‑149 (MQ=255) ccAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCtt < 4:333246/149‑1 (MQ=255) aaCTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGa < 2:72038/111‑1 (MQ=255) aaCTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGa > 1:72038/1‑111 (MQ=255) aaCTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTa > 2:348479/1‑149 (MQ=255) cTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCATTGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTAtt < 2:308086/149‑1 (MQ=255) gcccGACCCGGCT‑AACCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTgg < 4:292501/146‑1 (MQ=255) gCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTg > 3:317769/1‑149 (MQ=255) gCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTg > 7:99419/1‑149 (MQ=255) tCGACCCCGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGGCGGTTACTCGATCCCGGTAATCCCCGATCCGGGTGCTCGTCATACCACCCCTGGGTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCgt < 1:269521/127‑1 (MQ=255) gACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACAGAAAGTGAAAACGCACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGttc > 6:202445/1‑149 (MQ=255) aCCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTGTATTTGGttct > 1:235657/1‑149 (MQ=255) cccGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGttctt < 1:348479/149‑1 (MQ=255) cccGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGttctt < 8:258376/149‑1 (MQ=255) ccGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGttcttc < 7:341554/149‑1 (MQ=255) ccGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGttcttc > 8:341554/1‑149 (MQ=255) gCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGc < 8:99419/149‑1 (MQ=255) aaGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGAGCCGGTTGATCGTCATACCCCCGATGGGTAAATGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACGTTTTTTTGGTTCTGCCGATCCa > 4:283334/1‑149 (MQ=255) gCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCCTACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGGGAAACCGAACTCCAGCTCCCGCGTGTTGGTAGGACCTGTAGTTGGTTCTTCCGCTCCAGc > 4:223777/1‑149 (MQ=255) tATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTcc > 1:31733/1‑149 (MQ=255) tGCCAAGGGCGTCGGTACCGCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGGCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTcc < 3:223777/147‑1 (MQ=255) ccAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGt > 7:253662/1‑148 (MQ=255) ggCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGCTGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACggt < 1:216100/149‑1 (MQ=255) gTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACggtagg < 4:275576/149‑1 (MQ=255) gTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACggtagg > 3:275576/1‑149 (MQ=255) tAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGATAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAaca < 7:152775/149‑1 (MQ=255) tCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCa > 3:250423/1‑149 (MQ=255) cccGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCAc < 2:80705/149‑1 (MQ=255) ccGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGAGGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTGGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCAc < 5:232029/148‑1 (MQ=255) gATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGc < 8:75133/149‑1 (MQ=255) gATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGc < 8:69828/149‑1 (MQ=255) tCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGCtgtg < 4:250423/149‑1 (MQ=255) tCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGCtgt < 3:324351/148‑1 (MQ=255) cccGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGTTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGCTGTGGc > 4:313100/1‑149 (MQ=255) cccGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGCTGTgg < 8:199071/148‑1 (MQ=255) cccGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGCTGTGGc > 4:343030/1‑149 (MQ=255) ccGATCCGGTTGCTCGTCATACCACTGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGt > 1:251994/1‑115 (MQ=255) ccGATCCGGTTGCTCGTCATACCACTGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGt > 1:246814/1‑115 (MQ=255) ccGATCCGGTTGCTCGTCATACCACTGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGt < 2:246814/115‑1 (MQ=255) ccGATCCGGTTGCTCGTCATACCACTGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGt < 2:251994/115‑1 (MQ=255) ccGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGttctt > 4:65139/1‑99 (MQ=255) ccGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGttctt < 3:65139/99‑1 (MQ=255) cGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGCTGTGGCTg > 6:130149/1‑149 (MQ=255) tCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGCTGTGGCTGCAc < 4:290470/149‑1 (MQ=255) tCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAAATGTAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGATCCTGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGCTGTTGCTGCAc < 3:274201/149‑1 (MQ=255) 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7:276648/1‑148 (MQ=255) accGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGCTGTGGCTGCACCCGCTCCGGCACCGGTgaa < 8:276648/149‑1 (MQ=255) | GGGCAGCAAAAACTTTATGTTCTGGTCTTTACCACGGAAAAAGATCTCCAGCAGACGACCCAACTGCTCGACCCGGCTAAAGCCTATGCCAAGGGCGTCGGTAACTCGATCCCGGATATCCCCGATCCGGTTGCTCGTCATACCACCGATGGCTTACTGAAACTGAAAGTGAAAACGAACTCCAGCTCCAGCGTGTTGGTAGGACCTTTATTTGGTTCTTCCGCTCCAGCTCCGGTTACGGTAGGTAACACGGCGGCACCAGCTGTGGCTGCACCCGCTCCGGCACCGGTGAA > NC_000913/4250010‑4250302 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |