| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,367,990 | IS2 (–) +5 bp | coding (164‑168/1128 nt) | yhcG → | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2996361 = | NA (NA) | 30 (0.810) | 22/260 | 0.9 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3367994 | 0 (0.000) | coding (168/1128 nt) | yhcG | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 50 (1.350) | 40/260 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3367990 = | 0 (0.000) | coding (164/1128 nt) | yhcG | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily | |||||
AGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCGATAGCGCCCGGACGGAAACGGTACGTAGCGTTAACGCGTTAATGACCGCGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCTTTTTTCAACATGTTGAAATTCACCAGACAA > NC_000913/3367853‑3368142 | agcagGCTACCAGCAAATCCACTACGGTATTATTCATCTGGTCGATAGCGCCCGGACGGAAACGGTACGTATCGTTAACGCGTTAAAGACCGCGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCtggattt > 8:35308‑M2/1‑142 (MQ=255)agcagGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCGATAGCGCCCGGACGGAAACGGTACGTAGCGTTAACGCGTTAATGACCGCGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCtggattt < 6:130907‑M2/149‑8 (MQ=255) ggCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCGATAGCGCCCGGACGGAAACGGTACGTAGCGTTAACGCGTTAATGACCGCGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCtggatttgccc > 1:93318‑M2/1‑138 (MQ=255) 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(MQ=255) ccGGACGGAAACGGTACGTAGCGTTAACGCGTTAATGACCGCGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgct < 2:88728‑M2/149‑59 (MQ=255) ccGGACGGAAACGGTACGTAGCGTTAACGCGTTAATGACCGCGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgct < 1:154385‑M2/149‑59 (MQ=255) ggacggaAACGGTACGTAGCGTTAACGCGTTAATGACCGCGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgc > 5:165938‑M2/1‑89 (MQ=255) caataactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTa > 5:140236‑M2/84‑142 (MQ=255) caataactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTa < 6:140236‑M2/59‑1 (MQ=255) 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8:31914‑M2/80‑1 (MQ=255) cgcgACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCttgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcac > 3:115763‑M2/1‑52 (MQ=255) atttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCaaa > 8:126271‑M2/45‑149 (MQ=255) tgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTa > 4:82906‑M2/38‑84 (MQ=255) tgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTa < 3:82906‑M2/47‑1 (MQ=255) cAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatg < 3:82688‑M2/149‑108 (MQ=255) cAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatatt > 5:79561‑M2/1‑42 (MQ=255) 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(MQ=255) tggagattcagggggccagtctaGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACtt > 5:119798‑M2/24‑120 (MQ=255) ggagattcagggggccagtctaGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCttttt > 2:142877‑M2/23‑149 (MQ=255) gagattcagggtgccagtctaGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATTGTTCTCAGCTAATCAATCGACTATCAAATGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCttttt < 4:30330‑M2/127‑1 (MQ=255) ttGTCGAATTTGAACAAGGTGGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctc < 8:80602‑M2/148‑126 (MQ=255) ttcagggggccagtctaGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCTTTTTTCAAc < 4:126694‑M2/132‑1 (MQ=255) agggggccagtctaGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAg > 2:84658‑M2/15‑123 (MQ=255) agggggccagtctaGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAg < 1:84658‑M2/109‑1 (MQ=255) gggccagtctaGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCTTTTTTCAACATGtt > 6:169484‑M2/12‑148 (MQ=255) cAAGGTGGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaag > 2:154385‑M2/1‑9 (MQ=255) gTGGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgacattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggtt > 4:82688‑M2/1‑5 (MQ=255) tGGCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttct > 7:80602‑M2/1‑4 (MQ=255) 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AGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCGATAGCGCCCGGACGGAAACGGTACGTAGCGTTAACGCGTTAATGACCGCGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCTTTTTTCAACATGTTGAAATTCACCAGACAA > NC_000913/3367853‑3368142 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |