| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 394471 | 213 (1.640) | 9 (0.080) | 8/254 | 10.6 | 4.4% | intergenic (+53/‑35) | yaiT/yaiV | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein/putative transcriptional regulator |
| ? | NC_000913 | = 394475 | 194 (1.650) | intergenic (+57/‑31) | yaiT/yaiV | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein/putative transcriptional regulator | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
ACTTCAGCGCCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTCCAGTGA > NC_000913/394327‑394618 | cTTCAGCGCCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGAtt > 3:223903/1‑149 (MQ=255) cTTCAGCGCCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGAtt < 6:269247/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGAttt < 7:332631/147‑1 (MQ=255) gcgcCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGACCGTCAAGGATTTGACg > 6:475470/1‑149 (MQ=255) cTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGAGGGGCa < 2:83553/149‑1 (MQ=255) taCCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTa < 3:183392/149‑1 (MQ=255) cGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTg > 6:226829/1‑149 (MQ=255) cTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCaaa < 4:222356/148‑1 (MQ=255) tAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCTCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAgg > 3:621/1‑149 (MQ=255) tAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAg > 1:146527/1‑148 (MQ=255) aaCTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCaa < 7:567588/122‑1 (MQ=255) tACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGAcgc > 2:418193/1‑149 (MQ=255) ccTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGAcgc < 4:224111/147‑1 (MQ=255) ccTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGAcgc < 3:395581/147‑1 (MQ=255) ccTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAATCCTTGACggg < 2:191787/129‑1 (MQ=255) ccTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAATCCTTGACggg > 1:191787/1‑129 (MQ=255) ccTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCATCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGAcgcg > 2:132612/1‑148 (MQ=255) tCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACgg < 6:127776/126‑1 (MQ=255) tCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACgg > 5:127776/1‑126 (MQ=255) tggtgACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTAt < 3:426010/149‑1 (MQ=255) tggtgACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTAt < 3:253917/149‑1 (MQ=255) gtgACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATc < 8:171163/148‑1 (MQ=255) gACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGAcgc > 8:140773/1‑134 (MQ=255) aCGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTg > 8:6711/1‑147 (MQ=255) aCGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGt < 6:171398/148‑1 (MQ=255) aCGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTa < 8:195990/149‑1 (MQ=255) gTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGt > 4:114853/1‑149 (MQ=255) gTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGt > 1:154433/1‑149 (MQ=255) gTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCCGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGAcgc > 7:146912/1‑131 (MQ=255) tCAAGACTGGTCCGCGAACGTTGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTTCAAATGACGCGCAAATGTTATCAGTAGTTAAAc > 6:357193/1‑149 (MQ=255) aaGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATATGTAGTTAAAcc > 1:503763/1‑148 (MQ=255) aGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAAccac > 4:2251/1‑147 (MQ=255) gACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACctct > 8:481216/1‑149 (MQ=255) gACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACctct > 2:245564/1‑149 (MQ=255) cTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTc < 8:297026/149‑1 (MQ=255) gTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAg > 7:406038/1‑148 (MQ=255) gTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAg > 1:238239/1‑148 (MQ=255) tCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAgg > 4:83709/1‑148 (MQ=255) cgcgAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAAt > 5:343305/1‑149 (MQ=255) gcgAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAAtt < 5:74869/149‑1 (MQ=255) gAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTg < 2:15145/149‑1 (MQ=255) gtgtTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTc < 4:34362/149‑1 (MQ=255) ttAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCtt > 7:231266/1‑128 (MQ=255) ttAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCtt < 8:231266/128‑1 (MQ=255) aaaTATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATa > 2:442581/1‑148 (MQ=255) aaaTATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATa > 6:311637/1‑148 (MQ=255) aaTATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATaaa > 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agaaATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGa < 8:559102/149‑1 (MQ=255) agaaATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGa < 1:442581/149‑1 (MQ=255) aaTACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGtt > 2:283158/1‑149 (MQ=255) tGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGAt > 5:59934/1‑125 (MQ=255) tGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTtaat > 8:434402/1‑148 (MQ=255) tttAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGaa > 7:198879/1‑148 (MQ=255) ttAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTtaa < 2:521944/140‑1 (MQ=255) ttAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTtaa > 1:521944/1‑140 (MQ=255) ttAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGaa > 1:248303/1‑147 (MQ=255) tAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGaaaa < 7:481216/148‑1 (MQ=255) tttgcagtaatGCCCGTCAAATCCTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGc > 3:287386/8‑148 (MQ=39) tAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGt > 2:535443/1‑149 (MQ=255) tAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGAAGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGt > 2:123250/1‑149 (MQ=255) aaaTAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACgcgc > 8:119835/1‑122 (MQ=255) aaaTAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACgcgc < 7:119835/122‑1 (MQ=255) ataatGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTta > 5:445188/1‑148 (MQ=255) atGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTaataat < 7:450984/132‑1 (MQ=255) tGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATAttt < 8:106381/149‑1 (MQ=255) gCCCGTCAAATCCTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATAtttt > 8:29504/1‑149 (MQ=255) ccGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATCTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTc > 8:379688/1‑148 (MQ=255) cGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTCCa < 1:418193/149‑1 (MQ=255) cGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTCCa < 6:445188/149‑1 (MQ=255) gTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTCCAg < 6:71797/149‑1 (MQ=255) gTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTCCAg > 6:116697/1‑149 (MQ=255) tCAATGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTCCAGt < 5:226829/149‑1 (MQ=255) tCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTtata < 8:520029/140‑1 (MQ=255) tCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTtata > 7:520029/1‑140 (MQ=255) cAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAg < 7:67998/134‑1 (MQ=255) aaGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGAGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTCCAGTGa > 5:410872/1‑149 (MQ=255) | ACTTCAGCGCCTATACCGATGCTAACTACCTCGGTGGTGGTGACGTAGATCAAGACTGGTCCGCGAACGTGGGTGTTAAATATACCTGGTAATATTCTTCACTCCGAAGAAATACTGGTAATTTAATCTAAATAATGCCCGTCAAGGATTTGACGGGCATTACTGCAAAGGACGCGCAAATGTTATCTGTAGTTAAACCTCTTCAGGAATTTGGTAAGCTCGATAAATGTTTGTCCAGATACGGTACGCGCTTCGAGTTTAATAATGAAAAGCAAGTTATATTTTCCAGTGA > NC_000913/394327‑394618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |