| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,351,197 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (‑158/+205) | fabI ← / ← ycjD | enoyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase, NADH‑dependent/DUF559 family endonuclease‑related protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | 81 (0.640) | 61/274 | 1.3 | 98.7% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1351197 = | 1 (0.010) | intergenic (‑158/+210) | fabI/ycjD | enoyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase, NADH‑dependent/DUF559 family endonuclease‑related protein | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | 85 (0.670) | 69/272 | 0.8 | 100% | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1351202 | 0 (0.000) | intergenic (‑163/+205) | fabI/ycjD | enoyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase, NADH‑dependent/DUF559 family endonuclease‑related protein | |||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
GTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTTCAGACCTTGCCGAATATTCTCCAGC > NC_000913/1351056‑1351349 | gttgATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTtc < 6:72640‑M2/149‑3 (MQ=255)gttgATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTt > 6:132116‑M2/1‑147 (MQ=255)gttgATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTt > 3:259606‑M2/1‑147 (MQ=255)gttgATGCTTGTTGTGACTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTtc < 2:333454‑M2/149‑3 (MQ=255) ttgATGCTTGTTGTGCCTGAATATCTCTCGATTATTCTTTTTATTAAACAGTACTAACAGATAAACGTTTTTTATAATCAACCTGGCTTTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGTTCTGGCTGCGGCAGGGTGGGCGCTTTTc < 8:493371/148‑1 (MQ=255) ttgATGCTTGTTGTGCCTGAAAATGAGGCGATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGAGGCGCTTTtc > 1:50002‑M2/1‑146 (MQ=255) aTGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTtccca > 4:164368‑M2/1‑143 (MQ=255) gCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTtcccat < 2:562606‑M2/147‑7 (MQ=255) 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gCGATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTtc < 3:322045‑M2/121‑3 (MQ=255) gCGATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTtc > 4:322045‑M2/1‑119 (MQ=255) cgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCagag < 3:488421‑M2/34‑1 (MQ=255) cgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAgggg > 2:406863‑M2/113‑149 (MQ=255) gATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTtcccataagcgctaacttaagggttgaaccat > 4:362439‑M2/1‑117 (MQ=255) cggcgtcccaatacgggccagaattgctgaccaggtcgcgtgagagaaaatcatcggcacgttaaatcatatccggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGc < 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tAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgc > 8:245621‑M2/1‑105 (MQ=255) tgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaccccttaagttagcgcttatgggCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTAt < 4:279349‑M2/51‑1 (MQ=255) aGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcga < 3:304302‑M2/149‑46 (MQ=255) tAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCttt < 7:262992/102‑1 (MQ=255) tAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATAATCAACCTGGCTGTGAGTAGCTATAGTTGCCAGGTCCGACCGGAGCAGGCTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacg < 2:464917‑M2/149‑48 (MQ=255) gccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATtgt > 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ttaagttagcgcttatgggCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTtcg > 2:125240‑M2/20‑148 (MQ=255) agttagcgcttatgggCGCTTTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAGAGGGGCGAGGGGACCGTATTGTGCAAATATTGTTACCCCAGCAACAAACAGGCTCATACAGCCCCTAACCCTTTCATGGCGATGGCTGGGACGGTTCAGa < 2:272353‑M2/132‑1 (MQ=255) cTGCGGCAGGGGGGGCGCTTTtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgatttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggc > 1:498844‑M2/1‑21 (MQ=255) gCGGCAGGGGGGGCGCTTTtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggat > 3:524086‑M2/1‑19 (MQ=255) gCGGCAGGGGGGGCGCTTTtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggat < 4:524086‑M2/130‑112 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |