| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3798233 | 468 (5.630) | 4 (0.050) | 5/234 | NT | 0.90% | intergenic (+26/+6) | waaL/waaU | O‑antigen ligase/lipopolysaccharide core biosynthesis |
| ? | NC_000913 | = 3798235 | 458 (6.130) | intergenic (+28/+4) | waaL/waaU | O‑antigen ligase/lipopolysaccharide core biosynthesis | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3798075‑3798233‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taagaagtgagttTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGC < NC_000913/3798235‑3798089 GATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTT > 3:291790/1‑147GATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAAGTAATTAAGAATAAACAAGTTT > 3:286926/1‑147 ATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCAGTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAATTTTAA > 5:118393/1‑148 TATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAG < 4:315501/148‑1 TATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAA < 7:361473/147‑1 ATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAG > 7:61320/1‑147 ATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAG > 2:355203/1‑147 ATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAG > 3:126856/1‑147 TTAACGCTTGGCATTGTGTGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTACAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAA < 1:143353/148‑1 TTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGTGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGA < 1:376603/147‑1 TTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTTATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGA < 3:136611/147‑1 TTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAA > 7:206375/1‑148 TTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAA < 5:66394/148‑1 TTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAA < 3:359806/148‑1 TTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAG > 5:234463/1‑146 TTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCAATCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAA < 1:148813/148‑1 TTAACGCTTGGCATTGTGGGAATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGA < 5:345100/147‑1 TAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAG > 7:240774/1‑148 AACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAG < 7:17790/147‑1 AACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAG < 4:336142/147‑1 ACGCTTGGCATTGTGGTGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGTCACGCAGCATTCCAATTATAATTATATCCGCTATAGTACTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGT < 3:347477/147‑1 ACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTG < 8:61320/148‑1 ACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTG < 6:374669/148‑1 ACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTG < 7:13917/148‑1 ACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTG < 2:341478/148‑1 ACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTG < 4:314143/148‑1 ACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTG < 3:191717/148‑1 ACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGT > 7:178046/1‑147 ACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTATAACTCGTCATTAATAATCGAAACAAAACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGT > 5:55991/1‑147 CGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGA < 8:206375/148‑1 CGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAG < 5:205959/145‑1 CGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAG > 6:205959/1‑145 GCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATGCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTATGAATAAACAAGTTTATGAAGTGAG < 6:250332/148‑1 TGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTT > 7:265248/1‑147 CATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGA > 8:354329/1‑141 CATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGA < 7:354329/141‑1 TGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACT > 6:138980/1‑147 TGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAA < 8:200616/131‑1 TGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAA > 7:200616/1‑131 CAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGA > 5:352514/1‑118 CAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGA < 6:352514/118‑1 CCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGT > 1:239945/1‑68 CCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGT < 2:239945/68‑1 CGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAAT > 5:138980/1‑148 TAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTG > 3:104367/1‑147 AATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGA < 4:104367/148‑1 TAAGTAGTTAGTTTTATCTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAATAGGACTATAGCTGATATAATGATTATTGGATTGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCga < 3:152909/147‑3 TAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATTATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAA > 3:79241/1‑148 TAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAA > 7:58670/1‑148 TAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAA > 4:98446/1‑148 TAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAA > 3:52858/1‑148 TAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCA < 1:377594/147‑1 atAAGTGAGTTTTAAATCAATTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTTTTAAGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATTATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAAT < 8:265249/145‑1 AGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATC < 5:93023/148‑1 AGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCC < 6:92572/144‑1 AGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCC > 5:92572/1‑144 GAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCC > 3:95965/1‑148 AAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCC > 7:287859/1‑148 AAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCC > 8:143533/1‑148 AAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCC < 4:41771/148‑1 AAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGA < 4:329476/78‑1 AAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGA > 3:329476/1‑78 AGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCC < 7:25866/148‑1 AGTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCC > 4:116235/1‑147 gttAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCC < 8:348125/144‑1 GTGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCA < 8:291707/148‑1 TGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCA > 3:290955/1‑147 TGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCA > 5:355495/1‑147 TGAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCA > 3:200109/1‑147 GAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTATTGACTAGTAAGAGGACTATAGCGGAAATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑AGCACATCACTGAGTCCATTCCCCAC > 4:90376/1‑147 GAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCAC > 3:272270/1‑147 GAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCAC > 5:127229/1‑147 GAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCAC > 2:245799/1‑147 GAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCAC > 4:95265/1‑147 GAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCAC < 6:279094/147‑1 GAGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCAC > 6:219321/1‑147 AGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGTACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACA < 2:111213/147‑1 AGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACA < 8:103978/147‑1 AGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACA < 3:57305/147‑1 AGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACA < 7:243552/147‑1 AGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACA < 1:318816/147‑1 AGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACA < 7:299338/147‑1 AGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACA < 7:170297/147‑1 AGTTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACA < 7:107597/147‑1 TTTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATG < 6:160527/148‑1 TTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATATCTGATATAATGATAATTGGAATGCTGAGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTACAATCACCACAATGC > 3:231713/1‑148 TTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCA < 5:348014/135‑1 TTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCA > 6:348014/1‑135 TTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTACAATCACCACAATG > 5:370292/1‑147 TTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTG > 3:198244/1‑129 TTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTG < 4:198244/129‑1 TTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTAGAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTG‑CCAAATGTAGCAAAGCACGGAGACCATCCCCCACAATcc > 4:195297/1‑146 GATATTAACGCTTGGCATTGTGGGGATTGGACTCAGTGATGTGATCATATGGGCACGCAGCATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3798075‑3798233‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taagaagtgagttTTAACTCACTTCTTAAACTTGTTTATTCTTAATTAATTGTATTGTTACGATTATTAATGACGAGTAAGAGGACTATAGCGGATATAATGATAATTGGAATGCTGCGTGCCCATATG‑ATCACATCACTGAGTCCAATCCCCACAATGC < NC_000913/3798235‑3798089 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |