| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,099,835 | IS1 (+) +8 bp | 66.3% | intergenic (‑222/+20) | ugd ← / ← gnd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase/6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2099835 = | 33 (0.430) | 64 (0.780) | 51/258 | NT | 64.5% | intergenic (‑222/+27) | ugd/gnd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase/6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating |
| ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
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TGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGT > NC_000913/2099695‑2099986 | tgttCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATTGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTTGTATATAAGATATTTGGCAATAAAAAGACCGGTGCAATATACGCAGTGCATCAAttt > 5:316833/1‑148 (MQ=255) cttCGATGGTCAACTCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCATTATAAGAATAGCTGATAATTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGTTGCAATATACGCCGGGCCTCACttt < 4:42896/146‑1 (MQ=255) ttCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTgg > 2:226726‑M2/1‑146 (MQ=255) ttCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTg > 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> 3:86279‑M2/1‑109 (MQ=255) ttATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt < 5:163018‑M2/148‑42 (MQ=255) ataAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGaa > 3:195101/1‑148 (MQ=255) taAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 6:200656‑M2/148‑45 (MQ=255) gtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcaggacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTATTGATGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacac > 8:340839‑M1/95‑148 (MQ=255) aGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:104387‑M2/1‑102 (MQ=255) 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> 6:180715/1‑147 (MQ=255) | TGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGT > NC_000913/2099695‑2099986 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |