| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,135,548 | T→C | 5.3% | intergenic (+37/‑16) | flgG → / → flgH | flagellar component of cell‑distal portion of basal‑body rod/flagellar protein of basal‑body outer‑membrane L ring |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,135,548 | 0 | T | C | 5.3% | 236.9 / 3.2 | 75 | intergenic (+37/‑16) | flgG/flgH | flagellar component of cell‑distal portion of basal‑body rod/flagellar protein of basal‑body outer‑membrane L ring |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/43); new base C (2/2); total (30/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.61e-01 | |||||||||||
ACGTGGCGGAAGAACTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCG > NC_000913/1135402‑1135692 | aCGTGGCGGAAGAACTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCGACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGAtttt < 1:261637/148‑1 (MQ=255)aCGTGGCGGAAGAACTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGAtttt > 2:133790/1‑148 (MQ=255) cGTGGCGGAAGAACTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGAttttt > 2:12474/1‑148 (MQ=255) gTGGCTGAAGAACTGTTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTg < 2:168822/148‑1 (MQ=255) gtggAAGAACTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGATGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAg < 3:261613/146‑1 (MQ=255) gCGGAAGAACTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGaa < 2:235665/147‑1 (MQ=255) gCGGAAGAACTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAg < 5:274109/148‑1 (MQ=255) gCGGAAGAACTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAg < 5:224744/148‑1 (MQ=255) gCGGAAGAACTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAg < 1:59666/148‑1 (MQ=255) gaagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAgat > 8:344727/1‑147 (MQ=255) gaagaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGG‑TTACTGATTTTTGAAgatga < 2:117421/148‑1 (MQ=255) agaaCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAgatgat < 2:40725/148‑1 (MQ=255) aCTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACTCAACTCTAAGTCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGc < 5:327713/148‑1 (MQ=255) tatGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCaaa > 8:289809/1‑147 (MQ=255) tGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGa > 4:150300/1‑127 (MQ=255) tGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGa < 3:150300/127‑1 (MQ=255) tGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCaaaaaa < 8:226504/148‑1 (MQ=255) cAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGc > 6:204068/1‑147 (MQ=255) cAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGc < 5:204068/147‑1 (MQ=255) gCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCa > 6:347898/1‑148 (MQ=255) aaCGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATa < 6:257304/148‑1 (MQ=255) aCGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATAc > 1:241237/1‑148 (MQ=255) aCGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATAc > 6:96740/1‑148 (MQ=255) gcgcTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACtt < 5:96740/148‑1 (MQ=255) cTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATg > 3:190872/1‑148 (MQ=255) aCGCAAGCAACAGTAAAGCGGTGTCCACAACCGATCAGCTGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGGGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCGATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGcc < 5:225331/147‑1 (MQ=255) gAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCAtt < 8:318124/148‑1 (MQ=255) tCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTc > 1:154359/1‑146 (MQ=255) tCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTCTTGa > 8:313192/1‑100 (MQ=255) tCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTCTTGa < 7:307842/100‑1 (MQ=255) tCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTCTTGa < 7:313192/100‑1 (MQ=255) tCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTCTTGa > 8:307842/1‑100 (MQ=255) aCAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCt > 1:69580/1‑148 (MQ=255) cAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAg > 2:322101/1‑145 (MQ=255) cAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAg < 1:322101/145‑1 (MQ=255) cAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCtt > 1:191860/1‑148 (MQ=255) cgTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCttg < 6:230548/147‑1 (MQ=255) gTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCttgt > 7:49845/1‑148 (MQ=255) tAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCttgtt < 7:289809/148‑1 (MQ=255) aaaGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCttgttg > 8:43288/1‑148 (MQ=255) aaGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCttgttg < 1:12474/147‑1 (MQ=255) ggTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCt < 1:133790/148‑1 (MQ=255) ggTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCt < 2:154359/148‑1 (MQ=255) tgcaccacCGATCAGAGGCAGCAAAAACTGAAGCAACTCTAAGTCGTAACCGGTGGCATGTTCTCCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCTAATATAAGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTc < 4:139057/145‑1 (MQ=255) tCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTc < 5:347898/147‑1 (MQ=255) tCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTc < 8:215859/147‑1 (MQ=255) tCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTc < 8:127121/147‑1 (MQ=255) ccaccaCCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCAc > 1:46012/1‑148 (MQ=255) ccaccaCCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCAc > 2:138078/1‑148 (MQ=255) ccaccGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTaa > 3:130972/1‑148 (MQ=255) caccGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAAc < 7:344727/148‑1 (MQ=255) accGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAAcc > 6:248725/1‑148 (MQ=255) cGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTgcgc < 5:108858/105‑1 (MQ=255) cGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTgcgc > 6:108858/1‑105 (MQ=255) cGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCgg > 8:57290/1‑148 (MQ=255) aTCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTAGGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTACCCGGCt > 6:187739/1‑148 (MQ=255) gATGCTGCAAAAACTGAAGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTTGAAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGCTGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTgcgc < 3:186290/148‑1 (MQ=255) aTGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGcc < 5:266788/148‑1 (MQ=255) tgctccAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGCTAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCt < 6:308562/148‑1 (MQ=255) ctgcAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTgg < 8:129916/148‑1 (MQ=255) gcAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCt > 2:278845/1‑89 (MQ=255) gcAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCt < 1:278845/89‑1 (MQ=255) cAAAAACTGAAGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGTCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGAt < 8:153603/147‑1 (MQ=255) aaaaaCTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATAc < 4:190872/148‑1 (MQ=255) gCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCAcgcc < 8:257641/148‑1 (MQ=255) tAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTgg < 2:46012/146‑1 (MQ=255) aaGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTCTGCCATTTCCCGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGc < 3:208925/148‑1 (MQ=255) aGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa < 2:241237/148‑1 (MQ=255) aGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCa < 5:318095/148‑1 (MQ=255) aGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGAAGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTg > 2:133310/1‑146 (MQ=255) ggCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAg < 8:49845/148‑1 (MQ=255) ggCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAg < 2:69580/148‑1 (MQ=255) ggCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGt > 7:64660/1‑148 (MQ=255) gTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGcac > 7:148491/1‑147 (MQ=255) ttCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACaa > 8:374796/1‑148 (MQ=255) aCCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGCCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCg > 3:141995/1‑148 (MQ=255) cGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGt < 4:130972/148‑1 (MQ=255) aTTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCg > 1:96975/1‑148 (MQ=255) | ACGTGGCGGAAGAACTGGTCAATATGATTCAGGTGCAACGCGCTTACGAAATCAACAGTAAAGCGGTGTCCACCACCGATCAGATGCTGCAAAAACTGACGCAACTCTAAGGCTTAACCGGTGGCAGGTTCACCGGTTTACTGATTTTTGAAGATGATAGCCATGCAAAAAAACGCTGCGCATACTTATGCCATTTCCAGCTTGTTGGTGCTTTCACTAACCGGCTGCGCCTGGATACCCTCCACGCCGCTGGTGCAGGGGGCGACCAGTGCACAACCGGTTCCCGGTCCG > NC_000913/1135402‑1135692 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |