| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,071,345 | T→A | 5.7% | noncoding (29/195 nt) | isrC → | novel sRNA, CP4‑44; putative prophage remnant |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,071,345 | 0 | T | A | 5.7% | 218.2 / 2.3 | 82 | noncoding (29/195 nt) | isrC | novel sRNA, CP4‑44; putative prophage remnant |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/34); new base A (2/3); total (45/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GATTTTCTTCTGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGTTT > NC_000913/2071199‑2071493 | gATTTTCTTCTGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTtata < 3:274997/148‑1 (MQ=255) tttCTTCTGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTGGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATatcga > 8:148915/1‑149 (MQ=255) tcttctGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATatcgat < 7:183916/148‑1 (MQ=255) tcttctGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATatcgat < 7:389301/148‑1 (MQ=255) gAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAg > 3:354788/1‑149 (MQ=255) gAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAg > 2:184687/1‑149 (MQ=255) acccTGTCGTGAATGCTGCACTCCCTGACTCTGCTTCTGCTCACAAAAGCAATGTTTTCGTTACTGTCTCTATTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGTATAAAACGATCAATATATATTTTATCGATCGATATAAACGATCGATaaaa < 3:94981/147‑3 (MQ=255) aaCCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGATATAAACGATCGATa < 1:191439/146‑1 (MQ=255) cTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATATGCtaa > 2:251626/1‑149 (MQ=255) cTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaa < 4:151833/149‑1 (MQ=255) cTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaa > 6:217557/1‑149 (MQ=255) gTGACTGATGCCCTCCCTGCCTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaataata < 1:269005/149‑1 (MQ=255) tGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAACAGCAGTGTGTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCCTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCCATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCtt > 6:191602/1‑149 (MQ=255) tGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCt < 8:151312/148‑1 (MQ=255) aTGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCttt < 5:367108/148‑1 (MQ=255) tGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGt < 1:251626/149‑1 (MQ=255) ccctccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCttt > 4:336700/1‑145 (MQ=255) ccctccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCttt < 3:336700/145‑1 (MQ=255) tccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGt > 4:141509/1‑148 (MQ=255) tccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGt > 2:278541/1‑148 (MQ=255) tccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCACAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGt > 8:364284/1‑148 (MQ=255) cctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTaa < 1:278541/148‑1 (MQ=255) aCTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATg < 4:354788/148‑1 (MQ=255) tGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGcac < 1:335429/147‑1 (MQ=255) gAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGca > 4:199285/1‑145 (MQ=255) aGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa < 1:184687/148‑1 (MQ=255) tGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACg > 7:376292/1‑148 (MQ=255) tGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTATCACTTGACCGTGAAATAGAACAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCTATCGTTTATATCGATAGATAACCTAATAATAACAATTGTAATTAACATTCACAGATACg > 5:114566/1‑148 (MQ=255) aaGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATATCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGa < 7:372241/149‑1 (MQ=255) cACTGTTTTCGTTACTGTCACTCTTGTCCGTGCAATAGCTAAATAATAGAATAAAACGATAAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAAACTTAGTCAGTAAAATGCACAGATACGTACAGAAAGACAt > 1:286442/1‑149 (MQ=255) aCTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACAtt < 6:43791/149‑1 (MQ=255) tGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAg > 6:344020/1‑148 (MQ=255) tctctgTTCTCCGTGCAAAAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTAAATCGATAGATAAGCTAATAATAAACTTTGTCACAAACATGCACAGATAAGTAAAGAAAGAAATTCAGGGAACAACAGAAc > 3:129124/1‑149 (MQ=255) tctctcTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAAc > 7:60809/1‑149 (MQ=255) tctctcTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAAc > 3:180227/1‑149 (MQ=255) tctctcTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGATATAAAcgatcgat > 6:79041/1‑79 (MQ=37) tctctcTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGATATAAAcgatcgat < 5:79041/79‑1 (MQ=37) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATAtcgatcga > 5:140660/1‑76 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATAtcgatcga < 6:140660/76‑1 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCa > 4:365205/1‑133 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCa < 3:365205/133‑1 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACca > 5:201361/1‑149 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACca > 6:164349/1‑149 (MQ=255) ttGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATATGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAAt > 3:80047/1‑149 (MQ=255) ttGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACcaca < 5:254287/147‑1 (MQ=255) ttGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACaa > 5:60499/1‑148 (MQ=255) gTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAAtt > 3:232562/1‑148 (MQ=255) gTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAAtt > 7:232068/1‑148 (MQ=255) tCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTc < 5:217557/148‑1 (MQ=255) cGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGa > 5:242715/1‑118 (MQ=255) cGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGa < 6:242715/118‑1 (MQ=255) cGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAAAGATCATTATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGa < 2:286442/149‑1 (MQ=255) tcTCAATAATAGAATAAAACGATGAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATATTAACCTTTGTCAGTAACATGCTCAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGATCAACAGAACCACAATTCAGAAACTccga < 6:114566/147‑3 (MQ=255) gCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCca < 8:60809/148‑1 (MQ=255) gCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCca < 4:180227/148‑1 (MQ=255) gCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCca < 5:164349/148‑1 (MQ=255) tCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAg > 8:398454/1‑149 (MQ=255) cAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGc > 5:379660/1‑149 (MQ=255) aataatAGAATAAAACGATCAATCTCTATTTTATCGATCGTTTATAAAGAACGATAACCTAATAATAACCATTCTGAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACAATCACCGAACAACAGAACAAAAATTCAGAAACACCCACAGcc > 3:18905/1‑149 (MQ=255) aataatAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAAtt < 8:336370/132‑1 (MQ=255) aataatAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAAtt > 7:336370/1‑132 (MQ=255) taataGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCtt > 1:349232/1‑70 (MQ=255) taataGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCtt < 2:349232/70‑1 (MQ=255) taataGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCgg > 6:246469/1‑149 (MQ=255) aataGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTAc > 5:213267/1‑95 (MQ=255) aataGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTAc < 6:213267/95‑1 (MQ=255) taGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGAcc > 8:381674/1‑149 (MQ=255) gAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTc > 5:1936/1‑149 (MQ=255) tAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAAt > 7:329618/1‑121 (MQ=255) tAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAAt < 8:329618/121‑1 (MQ=255) aaCGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCAc > 4:147854/1‑149 (MQ=255) aCGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACt < 6:201361/149‑1 (MQ=255) aCGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACt < 8:232068/149‑1 (MQ=255) aaTATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAAcc < 6:60499/149‑1 (MQ=255) atatCTTTTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAAcc > 8:18805/1‑148 (MQ=255) tATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTAc > 7:118791/1‑149 (MQ=255) ttttATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCttt < 7:364284/145‑1 (MQ=255) tttATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTg > 4:354347/1‑149 (MQ=255) tttATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTg > 5:195459/1‑149 (MQ=255) tATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGcc > 7:159010/1‑149 (MQ=255) gatcgTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTa > 6:334164/1‑149 (MQ=255) gatcgGTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTCACAAGCACAGATACGTACACAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGCCCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTa < 6:116002/149‑1 (MQ=255) atcgTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTAt < 7:18805/149‑1 (MQ=255) tatCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGttt > 7:155338/1‑149 (MQ=255) tatCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGttt < 5:191602/149‑1 (MQ=255) | GATTTTCTTCTGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGTTT > NC_000913/2071199‑2071493 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |