| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 15387 = | NA (NA) | 99 (0.980) | 78/278 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La | |||||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 126 (1.240) | 95/280 | 0.0 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609350 | NA (NA) | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
AAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGC > NC_000913/458643‑458938 | tcatctggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggg < 3:264755‑M1/1‑1 (MQ=255) ggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATc < 5:3594‑M1/8‑1 (MQ=255) gagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatagttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACAt > 4:198880‑M1/141‑147 (MQ=255) 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5:392472‑M1/104‑147 (MQ=255) cagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGc > 2:35922‑M1/103‑149 (MQ=255) gcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattctgcagatggtgaaacccttaagttagcgcttatgggGAAACAGCCCCATATACGGCCGTACTTGAGAATAGAGGGCGTGAAGca < 8:201188‑M1/48‑1 (MQ=255) ggTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatat < 5:411100‑M2/148‑45 (MQ=255) tacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGt < 2:244530‑M1/52‑1 (MQ=255) acaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTc < 6:60820‑M1/53‑1 (MQ=255) 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5:87617‑M1/41‑149 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGa > 3:109847‑M1/41‑149 (MQ=255) ttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGt < 1:10417‑M1/113‑1 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttatctcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGACTCCTGAGCGt > 2:354379‑M1/35‑147 (MQ=255) aaTTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcaagataactggtcagcaattctggcccatattggtaa > 2:73762‑M2/1‑40 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCt > 7:180667‑M1/34‑149 (MQ=255) 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ttatgggGAAACATCCCAATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGACAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCcgtatatcc < 7:322402‑M1/142‑5 (MQ=255) gAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgccg > 2:150429‑M2/1‑6 (MQ=255) gAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACATGGCGTAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTgagc > 6:94539/1‑149 (MQ=255) | AAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGC > NC_000913/458643‑458938 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |