| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 119,295 | A→T | 5.7% | T5T (ACA→ACT) | ampE → | ampicillin resistance inner membrane protein; putative signaling protein in beta‑lactamase regulation |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 119,295 | 0 | A | T | 5.7% | 243.7 / 3.8 | 80 | T5T (ACA→ACT) | ampE | ampicillin resistance inner membrane protein; putative signaling protein in beta‑lactamase regulation |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/35); new base T (2/3); total (42/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.87e-01 | |||||||||||
TGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGCATGACCATTATTGCGATGGGCGT > NC_000913/119151‑119438 | tgattgatTGCTATCCGGATATCGCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAAcc > 8:226792/1‑148 (MQ=255) gattgattGCTATCCGGATATCGCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCt > 7:2774/1‑148 (MQ=255) gattgattGCTATCCGGATATCGCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATACCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCt > 3:230375/1‑148 (MQ=255) tgattgCTATCCGGATATCGCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTAc > 8:119917/1‑148 (MQ=255) tgattgCTATCCGGATATCGCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTAc > 2:332294/1‑148 (MQ=255) aTCCGGATATCGCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGtt > 2:375290/1‑147 (MQ=255) cGGATATCGCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAAt < 8:10395/147‑1 (MQ=255) atatCGCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTc > 7:112358/1‑148 (MQ=255) acGCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGTATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGACT‑GGGCACGGTCTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAg < 6:204846/147‑1 (MQ=255) cGCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAgc > 3:107929/1‑148 (MQ=255) gCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAgcg > 1:125462/1‑148 (MQ=255) cTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCCATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAgcgc > 7:81004/1‑148 (MQ=255) aaaaaCCTGAGGGTGCATTGTGATATTGCGGCGGATCGGATAAGCGATCCCGGTCCTGCTTTTGATT‑GGGCACGTTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACATCATGACGCTATTTACAACCtt < 7:318731/124‑1 (MQ=255) aCATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGtt > 3:357475/1‑147 (MQ=255) cATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTa < 4:357475/148‑1 (MQ=255) tGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAg > 3:395514/1‑148 (MQ=255) aCGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGt < 1:421321/147‑1 (MQ=255) aCGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGt < 6:164992/147‑1 (MQ=255) cATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGa < 7:226792/148‑1 (MQ=255) tgtgATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTaa > 8:55176/1‑136 (MQ=255) tgtgATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTaa < 7:55176/136‑1 (MQ=255) tgtgATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCa > 1:89544/1‑148 (MQ=255) atTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACTACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCg > 8:229565/1‑138 (MQ=255) atTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACTACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCg < 7:229565/138‑1 (MQ=255) atTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACTACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCg < 7:235621/138‑1 (MQ=255) atTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACTACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCg > 8:235621/1‑138 (MQ=255) atTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTgg > 1:231728/1‑146 (MQ=255) ttGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAg > 4:70843/1‑148 (MQ=255) cgcCGGATCGGAAAACCGATCCCTGTCCTGCATTTGATT‑GTGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCtt < 8:18032/148‑1 (MQ=255) ccGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGa < 2:89544/148‑1 (MQ=255) ggATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACATCATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGat > 3:393028/1‑147 (MQ=255) ggATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGat > 6:107069/1‑147 (MQ=255) tCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGatcatc > 6:259862/1‑148 (MQ=255) cGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATTAGGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTTATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGatcat < 4:26604/147‑1 (MQ=255) cGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGc < 7:162239/129‑1 (MQ=255) cGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGc > 8:162239/1‑129 (MQ=255) ggAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGt < 2:95759/148‑1 (MQ=255) aaaaCCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCt < 3:152437/148‑1 (MQ=255) gATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGc > 7:408255/1‑148 (MQ=255) cccGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGtt > 4:380095/1‑148 (MQ=255) ccGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGtt < 5:259862/147‑1 (MQ=255) ggTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCtt < 8:112358/148‑1 (MQ=255) tGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGt > 7:346872/1‑100 (MQ=255) tGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGt < 8:346872/100‑1 (MQ=255) gCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTcggcg > 3:293956/1‑148 (MQ=255) cATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTcggcg < 1:375290/147‑1 (MQ=255) tttGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTAGAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGTGGGGCTGTTTTAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGt < 1:135266/148‑1 (MQ=255) ttGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGgtg > 5:352498/1‑70 (MQ=255) ttGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGgtg < 6:352498/70‑1 (MQ=255) aTT‑GGGCAAGTTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAAGATGACGCTATTTACATCCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGGTCTTTCGGCGTGTGaa < 3:389157/147‑1 (MQ=255) cACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACAtttt > 7:131334/1‑148 (MQ=255) gatgtgtgtGGTGGTGAGCAAGGAGACTACATGTGGATATTTACTAGATTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCAATGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGAGTTATTTCGGCGGGTGAAACATTTTtct < 4:371751/142‑1 (MQ=255) tttCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTtctct < 1:332294/148‑1 (MQ=255) tttCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTtctct < 7:119917/148‑1 (MQ=255) tCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTtctctc < 8:2774/147‑1 (MQ=255) cGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGTCTACATGACGCTTTTTAGAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTtctctgg < 8:81004/147‑3 (MQ=255) cGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCg < 8:408255/147‑1 (MQ=255) gtgCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGgcg > 6:284360/1‑148 (MQ=255) gtgCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCATGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCATCTTGATCATCGTCATGAAGAGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTtctctagatct > 3:371751/1‑142 (MQ=255) ggTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCa > 6:45942/1‑145 (MQ=255) ggTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCa < 5:45942/145‑1 (MQ=255) ggTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGt > 3:17455/1‑148 (MQ=255) gCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGAGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGTCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTAAgg > 6:51766/1‑147 (MQ=255) aaGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGCAt > 8:110839/1‑148 (MQ=255) gagaCAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTATAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTTATCATCGTCTTGAAGCGTTATTTCGTCTGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGAATGa > 5:53008/1‑147 (MQ=255) agaAAACATCACGCTATTAACAACCTAACTGGTGATAATTTACGAGCGCCTGTTTAAGTACGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCCTCTTCAAGCGATCTTTCGGCGGGTGAAACAATTTACTCTCGGGCGCACGATACGCATGAc > 4:80505/1‑147 (MQ=255) caacaTGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGt > 6:113185/1‑95 (MQ=255) caacaTGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGt < 5:113185/95‑1 (MQ=255) acaTGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGCATGACCattat < 2:66237/148‑1 (MQ=255) acaTGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGCATGACCattat > 8:19648/1‑148 (MQ=255) acaTGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGAACATCTTCTTGAAGCTTTATTTCGGCGGGTGAAACAATTTTATATCTGGCGCACGTTAGGCATGACAattat > 3:84134/1‑148 (MQ=255) aCGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGCATGACCATTATTGCg < 4:393028/147‑1 (MQ=255) aCGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGCATGACCATTATTGCg < 2:231728/147‑1 (MQ=255) aCGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGCATGACCATTATTGCg < 3:380095/147‑1 (MQ=255) aCGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGCATGACCATTATTGCg < 4:17455/147‑1 (MQ=255) cGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGCATGACCATTATTGCGAt < 3:70843/148‑1 (MQ=255) aTTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGCATGACCATTATTGCGATGGGc > 1:118066/1‑148 (MQ=255) ttACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGCATGACCATTATTGCGATGGGCGt > 4:46823/1‑148 (MQ=255) ttcAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGc > 3:10823/3‑124 (MQ=255) ttcAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGc < 4:10823/122‑1 (MQ=255) | TGATTGATTGCTATCCGGATATCGCTAAAAACATGACGGGCCATTGTGATATTGCGCCGGATCGGAAAACCGATCCCGGTCCTGCATTTGATT‑GGGCACGGTTTCGTGTGCTGGTCAGCAAGGAGACAACATGACGCTATTTACAACCTTACTGGTGTTAATTTTCGAGCGCCTGTTTAAGTTGGGCGAGCACTGGCAGCTTGATCATCGTCTTGAAGCGTTCTTTCGGCGGGTGAAACATTTTTCTCTCGGGCGCACGTTAGGCATGACCATTATTGCGATGGGCGT > NC_000913/119151‑119438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |