| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 564,107 | IS2 (+) +5 bp | coding (370‑374/633 nt) | sfmZ ← | response regulator family protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | 111 (1.010) | 75/276 | 0.3 | 98.2% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 564107 = | 2 (0.020) | coding (374/633 nt) | sfmZ | response regulator family protein | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381408‑381260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aTACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAATTGCCGA < NC_000913/564111‑563966 CGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA > 4:34836/1‑149CGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA > 8:15788/1‑149 GATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCACTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGTAGATTCAGGGGGCAAGTCTA > 4:324061/1‑148 GATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTCCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA > 5:150732/1‑148 TTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA > 5:451080/1‑144 TTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA < 6:451080/144‑1 TTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCGATACAC > 3:143039/1‑149 TGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTT < 1:371700/148‑1 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CGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATAT < 6:452191/147‑1 CGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGGTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATA < 3:325526/146‑1 GGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAA < 7:397973/149‑1 GCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGAGTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAA > 8:282981/1‑148 AGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAA < 8:264736/148‑1 GACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATA < 4:65889/149‑1 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GGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTA < 3:281921/148‑1 GTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGC > 7:460917/1‑149 TGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTGCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATTTTACGTTATCTGGTTAGCGGATTA > 6:204821/1‑149 TGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTA > 4:126367/1‑149 TGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAA < 8:381367/82‑1 TGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAA > 7:381367/1‑82 GAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTAT < 3:117448/148‑1 GAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTAT < 8:242919/148‑1 GAGATTCAGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATT < 5:296376/146‑1 AGGGGGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAA < 8:346443/148‑1 GGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAA < 8:460917/149‑1 GGCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAA < 7:282981/149‑1 GCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAAT > 7:87943/1‑149 GCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATT > 4:23870/1‑134 GCCAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATT < 3:23870/134‑1 CAGTCTATACACGTTTTTTCGGAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAATT < 7:317373/148‑1 CAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAATTG > 7:131499/1‑149 CAGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAATTG > 7:138839/1‑149 AGTCTATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGC < 8:152915/126‑1 TATACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAATTGCCGA > 1:155440/1‑148 CGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381408‑381260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aTACACGTTTTTTCCCAGCGAAACGCTTAACTATATAAAAAGCAATAAATGTAGTACGAATAGTTCAACGGTCACTGTGCTATCTAATCGTGAAGTGACCATATTACGTTATCTGGTTAGCGGATTATCTAATAAAGAAATTGCCGA < NC_000913/564111‑563966 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |