| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2304887 = | 57 (0.390) | 16 (0.110) | 6/454 | NT | 20.2% | noncoding (471/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 4296264 | 70 (0.480) | noncoding (430/600 nt) | RIP321 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 11 REP sequences and 4 IHF sites | RIP321 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 11 REP sequences and 4 IHF sites | |||||
CTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTT > NC_000913/2304616‑2305145 | cgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttacgccgcatccgacatcaatccctgatgcgccgcttgccgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggatcaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgctacgcttaccgtgtcttatcaggcctacgccagccggcgccatagcctgatttagcgtgctttcgttggtcggataaggcgtTTa < 2:186387‑M1/3‑1 (MQ=255)cgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttacgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttgccgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttatgccgcatccgaactcaacgcctgatgcgacgtttaacgcgtcttaccaggcctacgccagccagcgccatagcctgatttcgcggtattttgtaggccggataaggggtTTa < 2:1344815‑M1/3‑1 (MQ=255) tgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGCGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAAGTCGGATACGGCGGTTACGCCGCATCCgc > 1:67033/1‑274 (MQ=255) atttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttacgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttgccgcgtcttatcaggcctacgccagcccgcgcaatagcctgatttatcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttatgccgcatccgacctcaacgcctgatgcgacgctttacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgacttagcgttattttgtgcgtcgcaacaggcgtTTCCTCcgcatacgc < 2:914085‑M1/15‑5 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAGCCGAAATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGAc < 1:619171/274‑1 (MQ=255) cgtgattttgtaggtcggataaggcgtttacgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttgccgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCATCCGACa‑tcaa < 2:761893‑M1/21‑3 (MQ=255) cTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGATGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGAATcctgtcgctt > 1:97461/1‑266 (MQ=255) attttgtaggtcggataaggcgtttacgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttgccgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCATCcgaca‑tcaatgcc < 1:1425789‑M1/25‑7 (MQ=255) attttgtaggtcggataaggcgtttacgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttgccgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcatgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatatcctgatttcgcgtgattttgtatgtcggataaggcgtTTACGCCGcatcggacacaaatggc < 2:840972‑M1/25‑9 (MQ=255) ttttgtaggtcggataaggcgtttacgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttgccgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCAtccgaca‑tcaatgcctg < 1:1204917‑M1/27‑9 (MQ=255) cGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTCCACCGCTGTGAAGTGCTCCTCCCCTTAGGTCGGATAAGGCCGTTACGCCGCTTCCGACA‑TCTAACGCCCaa > 1:373257/1‑274 (MQ=255) cGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGGTACGCCGCACCCCACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTg > 1:784296/1‑275 (MQ=255) ttACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGAc > 1:1344322/1‑274 (MQ=255) gcatccgacatcaacgcccgatgcgacgcttgccgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCAt < 1:123002‑M1/11‑1 (MQ=255) cGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAACAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCGGGCGCGTCTTATCATGCCTAAACCGCTGTGGAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAACCGAc > 1:526430/1‑220 (MQ=255) cGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCg > 1:330444/1‑275 (MQ=38) ggCGCGTCTTAGCAGGTCTACACCTCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGTTTGCGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGGGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt < 1:954008/238‑1 (MQ=255) cgcgTCTTATCAGGCCTACACCGCTGCGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACACCGCCGCGAAGTGCCCCGCCCCGTAGGTCGGGTCAGCCGGCTACGACGCACCCGACA‑CCGCTCCCCCAAACCGGTTCCGCAATGCGACGCTGGCGCGTCTTCGTAGCCCCCCCCCGCTCGGACGCACTCCCCCCCGTAGGt > 2:1479975/1‑274 (MQ=11) cgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCATCCg > 2:1502245‑M1/169‑182 (MQ=255) cgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgcttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCATCCg < 1:1502246‑M1/14‑1 (MQ=255) cgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTa < 2:154439‑M1/3‑1 (MQ=255) cTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACCCCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑ACACTCTAAAGCCCAACCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCCCGCCATATCAGGCCCACCCCCCTGCGACATGCCCCCCCCCGTGGGTTgccacaggcggccc > 2:842056/1‑261 (MQ=11) atagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTAcgcc > 1:154440‑M1/155‑161 (MQ=255) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGTCATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCCGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCCACGCCGGCGCGTCTTAGCAGCCCAACACCCCTGTGAAGTTCTCCTCCCCTTGGGGTGTATACGGCCGTCT‑cgcccgac > 2:883421/1‑270 (MQ=11) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGACGCATACGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCAt > 1:320598/1‑274 (MQ=38) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTGACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg > 1:102541/1‑234 (MQ=255) tgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGAGTCTTATCAGGCCTCCACCGCTGTGAAGTGCTCCACCACGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGAATCCaa > 1:1007699/1‑275 (MQ=255) gAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTGACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCt < 2:102540/234‑1 (MQ=255) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCTAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTCACCCGCTCTGAACTGCCTCACCCCGTAGGTTGGATAAGGGGGTTA‑CGGCGCAGTCCACATCCaa > 2:625248/1‑275 (MQ=11) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATCAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTCAc > 1:1154371/1‑273 (MQ=38) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCCGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTCGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCCTCCGACA‑TCTAACGCCCCAGCGGGTTGCCTGATCCGACGCTGGCGCGTCTTATCCGGTCTACACCGCCCAGCAGTGCGCAACCCGTCCGGTCGTATAATGCGGTTA‑CGCACCACCCAAccctcacca > 2:160658/1‑266 (MQ=11) attttgtaggtcggataaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCa > 1:552421‑M1/137‑146 (MQ=255) attttgtaggtcggataaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCa < 2:552420‑M1/10‑1 (MQ=255) cGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCAACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCACCATCCAACATCTAACGCCCGa > 1:1444626/1‑274 (MQ=255) taggtcggataaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCa < 2:981858‑M1/10‑1 (MQ=255) gaagggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGTTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTTCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCg < 1:1375162/270‑1 (MQ=255) tcggataaggcgtttatgccgcatccgacatcaacgcctgatgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCATCCg > 1:981859‑M1/127‑140 (MQ=255) ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGACGTGCTCCACCCCGTCGGTTGGATAAGGCCAGTA‑CGCCGCACCCCACACCCAACCCCCCAGCCCGttcc > 2:954009/1‑273 (MQ=11) gATAAGGGGGGTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGCGCCGTTTGCCTGATGCGACGCGGGGGCGTCTGATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGcc < 1:1041003/275‑1 (MQ=255) gCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCCTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCCCCCCACCTCTAACCACCGAGGCGGTTGCCTgca > 2:138374/1‑271 (MQ=255) ttACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACCCCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACC‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCCGTTC‑AGCCGCATCCAACACCTAACGCCCGACGCGGTTcccctgagccac > 2:1564740/1‑265 (MQ=11) ttACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGAGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCCTCCGACA‑TCTAACGACCAAGCCTGTTGGCTGATGCGACGCTGGCGCGGCTTATCAGGCCTCCCCATCTGGTAAGTGGCTCACCCCGTACGTTGGGTAAGGCGGTTA‑CGCCACATCCAACATCAAACCACCGAGACGGTTGCCTGATGCggtt > 2:1375161/1‑272 (MQ=11) tACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTa < 1:1528536/183‑1 (MQ=32) ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCCAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCCACACCCCCTAGGTTGGCTCAGGCGGTTACCCCCGCCACC‑ACCTCCAACTCCCCAGCCCTCTGCCTGATGccgcgttcg > 2:294285/1‑266 (MQ=11) cgcATCTGACATCCTCCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcg < 1:625249/275‑1 (MQ=21) cccATCCGACATCCACCGTCCGGGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGAATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCAGCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcg < 1:616349/273‑1 (MQ=255) cccggcccGTGCTGGTTGCCTGATGGTACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAGGGGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCa < 1:967562/269‑1 (MQ=255) tgcgacgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCCCCACCCCGTAGGtt < 2:195958‑M1/102‑1 (MQ=255) cgCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTTTTATCAGGGCGACACCGCTGTGAGGTGCTCCACCCCGGAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACTCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCcaca < 1:1564741/274‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATAAGCcac > 1:514637/1‑274 (MQ=25) acgcttaacgcgtcttatcaggcctacgccagacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGAt > 1:195959‑M1/82‑187 (MQ=255) cGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAATGCCCCACCCCGTAGGTTGGATCAGGCGGTTA‑CGCCTCCTCCAACATCTAACGCCCGCGCCGGTTTCCTGATGCGACCCTTGCGCGTCTTTTCAGCATCCCCCACCTCCGGCAACCCATGCCGGa > 2:565179/1‑275 (MQ=14) gtgcgTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTgg < 1:883422/273‑1 (MQ=255) gcgcGGCTTGGCGGGCCTAGAGCGATGTGAAGTCGTCCACCGCGTCGGTGGGGGAGGCCGGTTACGCCGCATCGGGCA‑TCAAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGAGGCGACGCTGGCGTGTCTTATCAGGGCTACGCCGCGGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTgg < 2:1324272/275‑1 (MQ=17) gctttATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGGTGTGGCGt < 1:842057/271‑1 (MQ=255) cTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGGGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTAt < 1:954010/274‑1 (MQ=255) gacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCa < 2:36429‑M1/10‑1 (MQ=255) gacagcgcaatagcctgatttagcgtgattttgtaggtcggataaggcgtTTACGCCGCa > 1:36429‑M1/51‑60 (MQ=255) cacCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCCCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTCACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACCTCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAat > 1:1417343/1‑275 (MQ=255) acCGCTGTGAAGGGCTCCACCCGGTAGGTCTGACAATGCGGTTACGCCGCATCCGCCA‑TCTAACGCCCAAGCCGCTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACTCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTTGCGTATCATTACAACGCAata < 1:1479976/275‑1 (MQ=255) gCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAGGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGACTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATc < 1:1264725/274‑1 (MQ=255) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCg > 1:914635/1‑275 (MQ=255) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCg > 1:1122269/1‑275 (MQ=255) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAACATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATCTCCg > 1:903848/1‑275 (MQ=255) cTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCCCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTACCGCCCGCGCCGGCTGCCTGTTGCGACGCTGGCCCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCCTTCTCTTTCAACTCCATATCCCGCCCTTCttt > 2:424493/1‑275 (MQ=17) cACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATCCGCCCCATCCGGCCTTCCATGCCGGATGTGGCGGTACATTACCACGCAATCTCCCCCACTTCTTTTTg > 2:191377/1‑275 (MQ=17) cACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACAt > 2:153913/1‑215 (MQ=40) cACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATc > 2:211359/1‑244 (MQ=255) aCCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTACCGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGCCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCgg < 1:864738/231‑1 (MQ=255) aCCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGt < 1:405296/240‑1 (MQ=255) ccGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCgg < 1:153914/215‑1 (MQ=255) cGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGcc > 2:184203/1‑206 (MQ=39) tAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGGATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACggg > 1:927936/1‑274 (MQ=255) ggTTGGATAAGGCGGTTCCGCCGCCGCCGACA‑GTTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑TGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGtt < 2:784295/274‑1 (MQ=255) ggTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACAt < 1:184204/206‑1 (MQ=255) cGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACg > 2:1393652/1‑267 (MQ=255) tAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGtt < 1:1393653/267‑1 (MQ=255) TTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCgg > 1:497390‑M1/1‑147 (MQ=255) TTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCgg < 2:497389‑M1/147‑1 (MQ=255) | CTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACA‑TCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTA‑CGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTT > NC_000913/2304616‑2305145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |