New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3252197 = | 6 (0.080) | 81 (1.080) | 59/280 | 0.2 | 93.1% | intergenic (+187/‑107) | yqjG/yhaH | putative S‑transferase/DUF805 family inner membrane protein |
? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
ATAATTTTTTAGTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3252336‑3252197 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG > NC_000913/3583428‑3583568 ATAATTTTTTAGTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGT > 2:994486/1‑143 ATAATTTTTTAGGACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATGTTGCTCAATAACCTCTCGTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGT < 1:437544/143‑1 AATTTTTTAGTAC‑TTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGCGACTGAACTGCCAGTAAGTATGCGTTCAAGGACTTAATAAAGTGCCGTGGGTGAT > 2:954893/1‑143 TTTTTTAGTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTACGAAGAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATG < 1:1211724/143‑1 TTTTTAGTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCTCTTGTTTTTAGAG‑AGCAAAAGTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGC < 2:735495/143‑1 TTTTTAGTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑ACATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAACTATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGC > 2:751290/1‑143 TAGTACTTTCAGCTATCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGGATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCC < 2:464063/143‑1 GTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAA < 2:357052/143‑1 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TACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCCATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 2:316641/143‑1 ACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 2:7190/1‑143 ACCAGTCCATTTTTGCCTCAATGTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 2:145366/143‑1 ctcttCATTTTTTCCTCAATTTTTCTCAATCACTTGTTTTTCAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGTAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 2:944746/138‑1 CAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:45940/143‑1 CAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 2:934822/1‑143 CAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:1311511/143‑1 CAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:972934/1‑143 CAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:934822/143‑1 CAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACCGATTTAGT > 1:972886/1‑143 AGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAACTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 1:876962/143‑1 GTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 2:1180846/1‑143 TCCATTGTTGCCTCAATTTGGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 2:754129/143‑1 ATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:455971/1‑143 ATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 2:266536/1‑143 TCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 2:80725/1‑143 TCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 2:801997/1‑143 acTTTTGCCCAATCACTGGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAACGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 1:215797/141‑1 agTTTGCTCAATCACTTGTTTTCAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 1:326525/141‑1 ATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 2:1146331/143‑1 TTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCTAACTTATTGATTTAGTGTATGATGTTGTTTTTGAG > 2:1253101/1‑143 TTTGCTCGATCACTTGTTTTTAACGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 2:252794/143‑1 TCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT < 2:247400/143‑1 TCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCGCCAct > 1:232632/1‑141 ACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 2:1287084/1‑143 CTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGACTTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGCGCTCCAGTGGC > 2:1265988/1‑143 CTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 1:577772/1‑143 TTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCACCTTACTGATTGAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 2:29778/1‑143 TTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTCCTGATTTAGTGTACGATGATGTTTTTGAGCTGCTCCAGTGGCT > 1:128341/1‑143 TTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGGTTTTGAGGTGCTCCAGTGGat > 2:103873/1‑141 TTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTTGTGTATGCTGCTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 2:166380/143‑1 TTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGCGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTCAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 1:954893/143‑1 TTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 2:1344185/1‑143 TTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 1:748900/1‑143 TAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 2:404677/143‑1 AAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATGTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC < 2:200043/143‑1 AAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT > 2:51098/1‑143 AGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTAAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGTGGTGCTCCAGTGGCGTCTGTTTCTA > 1:813142/1‑143 GC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATGTAGTGTCTGATGGTGTTTTTGAGCTGCTCCACTGGCACCTGTTTCGATCAG > 2:258023/1‑143 C‑AAATTAAGAATAGATGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATGTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 2:130999/143‑1 AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT < 2:748900/143‑1 cTTAAGAATAGACGTGAGTGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATACAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 1:154340/142‑1 AAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC > 1:1322421/1‑143 ATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCTCTCCT > 2:963945/1‑143 GTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAG > 1:863311/1‑143 GTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGGGATGCGGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAG < 1:626129/143‑1 AATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTc > 1:275070/1‑142 AATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA < 1:801997/143‑1 ATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG < 1:30178/143‑1 GCAGTAGATATTCGGTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGG < 2:608165/143‑1 TAAATATTCGTTCCAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGT < 1:76922/143‑1 TAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCTAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGT < 1:994486/143‑1 TAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTGCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGT > 1:735006/1‑143 TATTCGATCAAGCAATTAATAAAGTGCCGTGGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT < 2:1158722/143‑1 ctTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTAACTGATTTAGTGTATGATGGTGGTTTTGAGGTGCTGCAGTGGCGTCTGTGTCTATCAGCTGGCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACG < 2:880012/141‑1 CGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACG < 2:577772/143‑1 CGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACG < 1:1344185/143‑1 TTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGC < 1:193576/143‑1 GGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGCGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAG > 1:849954/1‑143 ATTACTAATGTGCCGTGGGTGCTGCTGCCGTCTTACTGATTTAGGGTATGATGTTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAC < 1:501178/143‑1 TAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACCGCAACAACACCG > 2:942548/1‑143 TAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGGGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCG > 1:1331680/1‑143 ATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCC > 2:567025/1‑143 CGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAACAGCCCCCCCGCACAcccg > 2:489982/1‑139 TGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTGTGATGGCGTTTGTGTCTTACCCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG < 1:51098/143‑1 TGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG > 2:168043/1‑143 TGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG > 1:212492/1‑143 ATAATTTTTTAGTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3252336‑3252197 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG > NC_000913/3583428‑3583568 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |