New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 609415 | 79 (1.110) | 3 (0.040) | 3/266 | 10.4 | 3.9% | intergenic (+238/+44) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex |
? | NC_000913 | = 609431 | 74 (1.100) | intergenic (+254/+28) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGA > NC_000913/609289‑609573 | aaaCGCGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTg < 1:679704/142‑1 (MQ=255) aaCGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGc < 2:628309/143‑1 (MQ=255) caGGCACCCAGACGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCGTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGTACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCggg < 2:371768/142‑1 (MQ=255) agtcACCGAGGCGTTGCAGTCTTCAGATCGTTCAACCCTTTAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATTCCCGCATAGCCGGTTGTCAGGTCGGGATGGTTGTGCTCCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGc < 2:680852/140‑1 (MQ=255) gCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACCCTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGa > 1:734390/1‑143 (MQ=255) cACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGaa > 1:1178683/1‑143 (MQ=255) aCCGTGGGGTAGCAGTCTGCAGATGGTTCAAGCCTTTGGTGAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGGCAGGGTGGTAGGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAAt < 2:964812/143‑1 (MQ=255) aCCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCCTATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGAAAGGCACCTACTTTACACCTTCGCCCGTGGCAAGCGATGGCTCAGGGCGact > 2:1118241/1‑141 (MQ=25) ggCGTCGCATTCTTCTGATGGTTCAACCCTTAATTGAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGCTGTCAGGGTAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTAc < 2:80167/143‑1 (MQ=255) cGTCGCATTCTTCAGATGGTTCCACCCTGTGGTGAGCGCGTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCa < 1:534094/143‑1 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGa < 1:910768/143‑1 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCACCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGa > 1:792862/1‑143 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGGCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATCGCTGCGGGCGAATCGGACGAgc > 2:536753/1‑142 (MQ=255) aTTCTTCAGATGGTTCAGCCCCTCAGTTGGCGCGTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGAtgtt < 2:1001692/143‑1 (MQ=255) ttcttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGAtgttg > 2:595253/1‑143 (MQ=255) tcttcAGATGGTTCAACCCTTTAGTTAGCGCGTATGGGTGTTATCCCCGCATATCGGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTGTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGAtgttgt < 1:40579/143‑1 (MQ=255) tcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCaa < 1:520457/143‑1 (MQ=255) tcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCaa > 1:564731/1‑143 (MQ=255) cAGATGGTTCAACCCTTAATTTATCGCTTATGGTAGTTATCCCCGTATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAAt < 1:310875/143‑1 (MQ=255) ggTTCAACTCGTAGGTTAGCGCTTATGGCAGTGATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGACCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATc < 2:43383/143‑1 (MQ=255) cccTTATGTGAGCTCTTAGCGGAGTACTCGCCGTGTATCCGGTGGTCAGGTCAGGATTGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGTGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTgg < 2:167283/143‑1 (MQ=255) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAGTCGTACCAGATGTTGTCATTTAATCGGGTTggg > 1:431913/1‑142 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGGCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTAACAGAAGTTGTCAATTAATCGTGTTGTca > 1:685798/1‑143 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGCGTTGGca > 1:395352/1‑143 (MQ=255) ttAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAAGCGTACCAGCTGTTGTGCATTAATCGTGTTGGcac > 2:943845/1‑143 (MQ=255) gTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATGGTGTTGGCACAGCg > 2:1204375/1‑143 (MQ=255) ttAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACTAGATGTTGTAAATTAATCGTGTTGACACAGcat > 1:751889/1‑141 (MQ=255) gcgcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTAt > 1:1035978/1‑143 (MQ=255) gcgcGTATGTGAGTAAGCCCCCGAGAGCCGGCTGTGAGGGCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCCCCCGTGTTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTAt < 2:1132869/143‑1 (MQ=255) gcacgaaTGGGAGTAAAGCCCGCGTATCCGGGTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTAt < 1:440220/137‑1 (MQ=255) cgcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTtgtg > 1:804110/1‑143 (MQ=255) agtgaTGTGAGTGCTCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGa < 1:584320/139‑1 (MQ=255) aTGGGAGTAATCCCCGCATGTCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAt < 2:760864/143‑1 (MQ=255) gTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGTATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtcttttc < 2:127233/143‑1 (MQ=255) gTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtcttttc < 2:440364/143‑1 (MQ=255) gaaTCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtcttttct < 1:52760/142‑1 (MQ=255) aTCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGCTGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtcttttcttt > 2:331648/1‑143 (MQ=255) cccGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCACCTGGTCAGTCAGGGCCGCGGGCGCATCGTACCAGCAGTTGTCAATTAACCATCTTGCGCCAGCGTTATGACTCTCTCTTCTTTTag > 2:320505/1‑142 (MQ=255) tcGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGCCTATCTTTTCTTTTATc < 2:578561/142‑1 (MQ=255) tatCCGGGTGTCAGGTGAGGGTGGTAAGGCACCTGCTGTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTTAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCa < 2:907620/143‑1 (MQ=255) tCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACCATCTTTTCTTTTATCTGcccgc > 2:528004/1‑140 (MQ=255) tCCAGTTATCAGGGTAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCCGt > 2:925163/1‑143 (MQ=255) ccGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACTTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTTATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCtgtg < 2:221847/143‑1 (MQ=255) ccGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTg < 1:274980/143‑1 (MQ=255) tcaggtcaggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCGGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCCGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTCTCTTTTCTTTTATCTGCCGGTGAACCGCa > 2:347116/1‑143 (MQ=255) aggtcaggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCaaa > 1:450777/1‑143 (MQ=255) aggccaggATGGTTAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGTCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCaaa < 1:1214578/143‑1 (MQ=255) gtcaggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACa > 1:346910/1‑143 (MQ=255) gtcaggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGACACAGCATTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGACAATGGACACCATACa > 1:819268/1‑143 (MQ=255) gtcaggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACATTAGCCCGTGGCCAGTGATGGCTGCGGGCGAGTAGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCGTTTCTTTTATCTTCCAGTGAACagcaagca > 2:803929/1‑143 (MQ=255) tcaggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATTGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACAt < 1:51752/143‑1 (MQ=255) ggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACCtctc > 1:980630/1‑143 (MQ=255) gATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCAGCGGGACAAGCGTACCAGACGTAGTCAACTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACGATCTTTTCTTTTATCTGCGAGTGCAAAGCAAACAgctcc > 2:1126290/1‑142 (MQ=255) aTGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCAt < 2:804110/143‑1 (MQ=255) tAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATtctc > 1:713814/1‑143 (MQ=255) tAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATtctc > 1:949480/1‑143 (MQ=255) agacACCTGCATTACACTTTCGCCCGTGGTGAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGTACAGCGTTATGATTATCTTTTCTTTTATGTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCAc < 1:272448/140‑1 (MQ=255) gcgcccgCTGTACCCGTTCGCCCCGGTTCAGTGATGGCTGCGGGCCAATCGTACCCGATGTTGTCAATTACTCGTGTTGCCACCGCGTTATGACTATCTTTTCTTCTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGa < 2:1150880/137‑1 (MQ=255) gCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGa > 2:1159988/1‑143 (MQ=255) gCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTATCGATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCCCAGCAAACATCTCATCCTCACgc > 2:151638/1‑142 (MQ=255) aCCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCCCATTCTCACGatg > 1:928194/1‑143 (MQ=255) tGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGatgaat < 1:595253/143‑1 (MQ=255) cTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCATTTCTTTTATCTGCCAGTGCATAGCAAACATCTAATTCTCACGatgaatga > 2:317022/1‑143 (MQ=255) tttACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAGCATCTCATTCTCACGATGAatgat > 1:1073242/1‑143 (MQ=255) acacTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGAc > 1:1112670/1‑143 (MQ=255) cacTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCATATGTTGTTAATTAATCGTGTTGGCAAAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGAcc < 2:1084277/143‑1 (MQ=255) acgttCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACct < 1:127540/140‑1 (MQ=255) acTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACct > 2:627178/1‑143 (MQ=255) tttCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACctgc > 2:541932/1‑143 (MQ=255) ttCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATACAACGGATTGGGTGAGGGTTATGACGATCTGTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACctgct > 1:296303/1‑143 (MQ=255) tCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACctgctg > 2:1098311/1‑143 (MQ=255) cGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGATTCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTTGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGt < 1:536753/143‑1 (MQ=255) gTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGAATATCGGCGCTTATCTCTGAACAACCACGATTCTCATCTCGTTCTTACAATGAATCATGACCCGCTGTTTATTCCa > 2:570340/1‑143 (MQ=255) tCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAg < 1:972760/143‑1 (MQ=255) gactGAGGGCGGCTGGCGAATCGTACCAGATGCTGTCAATTAATCGTGTTTGCAGAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACTATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGc < 1:987276/140‑1 (MQ=255) aGTGATGGCTGCGGGCAAATCGTACCAGATGTTGTCAATTACTCGTGCTGGCCCAGCGTTATGACTCACTTATCATTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCACACGATGAATGAGGAGCTGCAGTTTATGCCAGCt > 1:541593/1‑143 (MQ=255) gTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCGGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTa < 2:1178683/143‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGCGGGCGAATCGAACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTCATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGATCATCCCAGCTa > 2:35108/1‑143 (MQ=255) tGATGGCTGCGGGCGAATCGTACAAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTATTTATTCCAGCTaa > 2:632204/1‑143 (MQ=255) gCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATc > 2:898684/1‑143 (MQ=255) gcgggcggATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGa < 2:618897/143‑1 (MQ=255) | TAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGA > NC_000913/609289‑609573 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |