| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | intergenic (+254/‑485) | ychE → / → oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499–1300697 | 1300697 | 1–1199 | 115 [0] | [0] 117 | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 108 (1.560) | 76/274 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑1684) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+1453/‑484) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGT > NC_000913/1300558‑1300840 | ttacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 1:860245‑M2/3‑1 (MQ=255) cagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataata < 1:746660‑M2/6‑1 (MQ=255) agttagttataaggatttccttaactgcttctcctccccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:145065‑M2/7‑1 (MQ=255) agttagttataaggatttccttaactgctagtcctgaccatcatgttatttttgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 2:315087‑M2/7‑1 (MQ=255) taaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgacgaataattgaaatgatattattaattccactgccttttgtagatgaaagtgctacATACTTATCAATTGtt > 1:630293‑M2/128‑143 (MQ=255) taaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtataggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt > 2:1039819‑M2/128‑143 (MQ=255) aaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa < 1:678130‑M2/17‑1 (MQ=255) aaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 1:269983‑M2/127‑143 (MQ=255) aggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATtgttta < 1:479359‑M2/18‑3 (MQ=255) gtctttccttaactgcttctcctcaccatcatgttactttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 2:1293388‑M2/19‑1 (MQ=255) attgcttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta > 1:944014‑M2/122‑143 (MQ=255) ttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat > 1:905979‑M2/121‑143 (MQ=255) ttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAAACAATGGTTAAattat > 1:170672‑M2/121‑143 (MQ=255) tccttaactgttgctcctcaccatcatgttattttcgccacatcatactcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 2:1172997‑M2/24‑1 (MQ=255) tccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 2:1222031‑M2/24‑1 (MQ=255) tcctgaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatccttggcttgctgaagtataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 2:617640‑M2/24‑1 (MQ=255) cttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgacgaatacttgaaatgatattattaattccactccctttgatagagaaaagtgctaaATAATAATAAATTGTTAAATTATtgt > 1:1251303‑M2/118‑143 (MQ=255) ttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 1:396660‑M2/27‑1 (MQ=255) ttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatactgggcttgctgaagaataattgaaatgatattagtaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaAGAATCATCAATGTTTAAATTATtgtg > 2:1196801‑M2/117‑143 (MQ=255) taactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGc < 2:707326‑M2/28‑1 (MQ=255) atggcttctcctccccatcatgttatttccgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattatttattccactggctttggtagaggaaagtgctaaTTAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt < 1:951549‑M2/30‑1 (MQ=255) tgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 2:451006‑M2/112‑143 (MQ=255) tgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 1:835739‑M2/32‑1 (MQ=255) tgctgctcctcaccatcatgttatgttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 1:213277‑M2/32‑1 (MQ=255) cttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattacactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 2:1120615‑M2/110‑143 (MQ=255) cctctcctcaccttcattttattttcgccacatcataatccttggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 2:514279‑M2/34‑1 (MQ=255) ttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:1098635‑M2/109‑143 (MQ=255) cctctccgtcatgttattttcgtcacatcataaccctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccaatgactttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 2:773961‑M2/39‑1 (MQ=255) cctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact > 2:485001‑M2/105‑143 (MQ=255) ctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagagggaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:1081066‑M2/104‑143 (MQ=255) tcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTTTTGTGCATTTCACTTCTgg > 1:197854‑M2/103‑143 (MQ=255) tcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTgg < 2:1248851‑M2/41‑1 (MQ=255) tcaccatcatgttattttagccacatcataatcctgggcttgctgaagaataatttaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTgg < 1:3133‑M2/41‑1 (MQ=255) accatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa < 2:928153‑M2/43‑1 (MQ=255) cgtcaggttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt < 1:76539‑M2/45‑1 (MQ=255) catcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt < 1:711046‑M2/45‑1 (MQ=255) catcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt > 1:579623‑M2/99‑143 (MQ=255) atcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagcataattgaaatgctattattaattccactgcctttggtagaggacagtgctacATAATAATCAATTGTTACATTATTGTGCATTTCTCTCCTGGgaccg > 1:331451‑M2/98‑141 (MQ=255) tgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgactgtggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATCATTGTGCATTACACTACTGGAACTGTAAt > 2:622976‑M2/94‑143 (MQ=255) gttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATc < 2:1178336‑M2/51‑1 (MQ=255) ccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑a > 1:818351‑M2/83‑143 (MQ=255) ccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑a > 1:818359‑M2/83‑143 (MQ=255) catcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGAc < 2:954028‑M2/64‑1 (MQ=255) catcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGAc > 1:1198352‑M2/80‑143 (MQ=255) atcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattcccctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTAGAACTGTAATCAGAAACGAT‑AGACa > 2:862258‑M2/79‑143 (MQ=255) tcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAACAGAAAAAAT‑AGACAt > 2:4212‑M2/78‑143 (MQ=255) atattccttggcttgttgaagaataattgaaatgatattagtgattccactgctttttgtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAGTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGc < 2:704269‑M2/68‑1 (MQ=255) aatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCtt > 1:1059802‑M2/74‑143 (MQ=255) aatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTCTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCtt > 2:548905‑M2/74‑143 (MQ=255) atcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTa < 2:1010038‑M2/71‑1 (MQ=255) accctgtgcttgctgaatactaaatgaaatgatattatcaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATTATAATCAATTGTTAACTTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTa < 2:237663‑M2/71‑1 (MQ=255) tcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagagctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACAACTGGAACAGTAATCAGTAAAGAT‑AGACACTCTTAg > 2:606277‑M2/72‑143 (MQ=255) tgggcttgctgaataataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCa < 2:63188‑M2/75‑1 (MQ=255) cttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAAtct < 2:1243727‑M2/79‑1 (MQ=255) gctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAACTTATTGTGCATTTCACTACTGGCACTGTAATCAGAAAAGAT‑AAACATGCTTAGCCAATCTCTa > 1:632496‑M2/62‑143 (MQ=255) ctgaagaataattgaaatgatattattgattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTAt < 1:500989‑M2/83‑1 (MQ=255) tgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTAtt > 1:655978‑M2/60‑143 (MQ=255) tgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTAtt < 1:675137‑M2/84‑1 (MQ=255) tgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGAAATGCTTAGCCAATCTCTCtt > 2:650148‑M2/60‑143 (MQ=255) aagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGCATTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATttg > 1:287893‑M2/58‑143 (MQ=255) aagaataattgaaatgatattattaattccactgcctgtggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATAGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAG‑AGACATGCGTAGCCAGTCTCTAtgtg > 1:254982‑M2/58‑143 (MQ=255) agaataattgaaattatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATttga < 2:341649‑M2/87‑1 (MQ=255) agaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATttga < 2:1041763‑M2/87‑1 (MQ=255) aattgaaatggtattattaattcccctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGattgaa < 1:1252920‑M2/92‑1 (MQ=255) attgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGattgaat > 1:850441‑M2/51‑143 (MQ=255) aatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCAATTTGATTGAATTGaaa > 1:92662‑M2/46‑143 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtg > 1:58866‑M2/42‑143 (MQ=255) attattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTACTCCGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATATCTCTTTAATTGAATTGAAAGAggtt > 2:527225‑M2/40‑143 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgttt < 1:634454‑M2/105‑1 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgttt < 1:1087802‑M2/105‑1 (MQ=255) ttattaatcccactgcctgtgggagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgttt < 1:26063‑M2/105‑1 (MQ=255) gtattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgttt < 2:1292382‑M2/105‑1 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgtttgt < 2:1198352‑M2/107‑1 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑CGCCATGCTTAGCCAATATCTCTTTGATTGAATTGAAAGAtgtttgtt < 1:953851‑M2/108‑1 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAtgtttgtt > 1:516023‑M2/36‑143 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTaa < 1:323120‑M2/110‑1 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTaa < 2:25606‑M2/110‑1 (MQ=255) aatgccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAAGAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTaa < 2:167411‑M2/110‑1 (MQ=255) attccactgctgttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAg < 2:943976‑M2/111‑1 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGGATTGACAGATGTTCGTTACGGCa > 2:1200702‑M2/30‑143 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGACAt > 2:1096553‑M2/29‑143 (MQ=255) cactgcccttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCAt < 1:1064002‑M2/115‑1 (MQ=255) tgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGa > 1:173103‑M2/26‑143 (MQ=255) tgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACACGCTTAGCCAACCACTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTCGTTCAGGCATGGa > 2:1189010‑M2/26‑143 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATg > 1:129631‑M2/24‑143 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGc > 1:1156143‑M2/23‑143 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTAGAACTGTAATAAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGc > 2:833604‑M2/23‑143 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAGGctc > 1:547773‑M2/17‑142 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGAt > 2:233243‑M2/12‑143 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTGTTGTGGACAACACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTc < 2:908310‑M2/134‑1 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCt > 2:772298‑M2/9‑143 (MQ=255) agtgctaaATAACAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATACAAGCTATAGATTCt < 1:1182332‑M2/135‑1 (MQ=255) gtgctaaATCATAGTCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGATCTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTg < 2:268218‑M2/136‑1 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATa < 1:1212905‑M2/139‑1 (MQ=255) taaATAATAATTAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATCCGGTTTG‑AAAGCCAGTCTCTATTTGATTCAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATAc < 1:947003‑M2/140‑1 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTTTTGTGGTTGTAAATACTAAAACGGGAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATAc < 1:534879‑M2/140‑1 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGAtaa > 2:754275‑M2/4‑142 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACgg < 2:1136452‑M2/142‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAACTATAGATTCTGATACgg < 1:689663‑M2/142‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGt < 2:29311/143‑1 (MQ=255) | TAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT‑AGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGT > NC_000913/1300558‑1300840 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |