| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2078520 = | 73 (1.180) | 3 (0.050) | 3/264 | 9.1 | 4.2% | intergenic (+413/+29) | yeeW/yoeD | CP4‑44 prophage; uncharacterized protein;Phage or Prophage Related/pseudogene, CP4‑44 putative prophage remnant;Phage or Prophage Related |
| ? | NC_000913 | 2078552 = | 69 (1.200) | pseudogene (126/129 nt) | yoeD | pseudogene, CP4‑44 putative prophage remnant;Phage or Prophage Related | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGATACCGT > NC_000913/2078384‑2078661 | gATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGt > 2:615110/1‑143 (MQ=255) ttACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAAc < 1:116459/143‑1 (MQ=255) tACTGATAAACCTTCCAGTGGAGCTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACg > 2:1109198/1‑143 (MQ=255) gATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGGCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGAAGGCGTAAACGCAGc > 2:149007/1‑143 (MQ=255) aaaCCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCAcc > 1:524858/1‑143 (MQ=255) ccTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTa > 1:836204/1‑143 (MQ=255) tCCAGGTGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTACCGATCTGGTTTGACGTAACAAAAAATGAATTCCTAATCCACGGTCTGGGTAAGAACAGAATAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTg < 2:573004/143‑1 (MQ=255) gaggggAGGTGCGGTATGGCGGGTTTAACGGTTAGCAGGGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGAc < 2:211513/139‑1 (MQ=255) cAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGAc < 2:932265/143‑1 (MQ=255) cAGGGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGAGTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAAGCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGAc < 1:771960/143‑1 (MQ=255) aGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACg > 1:242070/1‑143 (MQ=255) aGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGACAACGGAGCACCGTATTGACg > 2:308619/1‑143 (MQ=255) aGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATTCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCttat > 1:517029/1‑143 (MQ=255) ggTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGCAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCttatt < 1:576814/143‑1 (MQ=255) gCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCttatttat < 2:464911/143‑1 (MQ=255) cGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTtatttatt > 2:882657/1‑143 (MQ=255) cGTTATGGCCGTGTTAACCATTAGCTTTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTtatttatt < 1:929626/143‑1 (MQ=255) ttATGGCCGTTTTGACGATTAGCATTGACCTGACACAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTgg < 2:1113329/143‑1 (MQ=255) tGGCCGTGTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTga < 2:744793/143‑1 (MQ=255) gCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTgaga > 2:801874/1‑143 (MQ=255) ccGTTTGAACGATTAGCATTGACCTGACAAACAATGAAGTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGATTACGGATTAAATGAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGaa < 2:854363/143‑1 (MQ=255) ttAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAAcggcg > 2:117878/1‑139 (MQ=255) tAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTCGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAACACGGATTAAAGTCAGCGTCACCGGAGCACCGTATTGCCGCTTCTTTATTGGTGAGAAccccgt > 2:365179/1‑138 (MQ=255) aaCGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGtt > 1:150306/1‑143 (MQ=255) aCGAGTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATGCTCGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTc < 2:599495/143‑1 (MQ=255) gATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCa > 2:24093/1‑143 (MQ=255) gttAGCATTGACCTGACAAAAAATGGATTCCTGATCCACGGTCTGGGTATGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAATACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCAt < 2:385059/142‑1 (MQ=255) tAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCCAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAATCGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATgg < 1:911855/143‑1 (MQ=255) gcgtttgccTGACAAAAAATGAAATCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCa < 2:1115706/136‑1 (MQ=255) gCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCa < 1:283942/143‑1 (MQ=255) cATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAg > 1:788748/1‑143 (MQ=255) tGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAg < 2:1041018/143‑1 (MQ=255) gACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGt > 2:364120/1‑143 (MQ=255) tcTGACAAGAAATGAATTCCAAATCCGCGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTc < 2:553766/142‑1 (MQ=255) ccTGACAAAAAATGACTTCCACATCCACGGTCTGGGCAGGAACAGAAAAATCTAAGATCAGAAAACGGATTACAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTc < 2:188315/143‑1 (MQ=255) ccTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAAGTACGTCGCATGGCAGGAGTTc > 2:1110001/1‑143 (MQ=255) ccTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTc > 1:331874/1‑143 (MQ=255) aaaaaaTGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCATGAGTTCGTCAac > 1:219868/1‑143 (MQ=255) aaaaaaTGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAac > 1:105754/1‑143 (MQ=255) aaTGAATTCCAAAGCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACgg < 1:1058680/143‑1 (MQ=255) tGAATTCCACATCCACGCTCTGGGTACGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGCAAACGGATTAAAGTACGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTACTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGtt < 1:372660/143‑1 (MQ=255) tGAATTCCAAAGCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGtt < 1:181877/143‑1 (MQ=255) tGAATTCCAAAGCCACGGGCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGtt < 2:864560/143‑1 (MQ=255) cgAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAAGCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGtt < 2:164072/142‑1 (MQ=255) gAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTg > 1:524857/1‑143 (MQ=255) tCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAgg > 1:788484/1‑143 (MQ=255) tCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGCTCGTCAACACGCTTGCAgg > 2:825700/1‑143 (MQ=255) ccAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTACATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAggc > 2:694561/1‑142 (MQ=255) cAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACAACGTAACATGGCAGGAGTGCGTCAACGCGGTTGGAGGGc > 1:36299/1‑143 (MQ=255) tCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATCTATTGGTGAGAACTACGTGCAATGGTAAGAGTTGGTCAACACGGCTGGAGGGCCGtt > 2:488444/1‑143 (MQ=255) cACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTcc > 1:165472/1‑143 (MQ=255) ggTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGc < 2:517029/143‑1 (MQ=255) tCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGCCCACACGGCTGGAGGGCCATTCCGGCAg > 2:944035/1‑143 (MQ=255) tgTAGGACCAGAAAAATCCAAGCTAGGAAATCGTGTTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGATTCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGTCATTCCGGCAGTATg < 1:480801/142‑1 (MQ=255) gAACAGAAACATCTAAGCTCAGAATTCGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAg < 2:383285/143‑1 (MQ=255) aaagagcTAAGCTCAGCAGACGGATTGAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATg < 2:692325/137‑1 (MQ=255) aaaagTCTAAGCTCAGAAATCGGATTAAAGTAGGCTTAAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGTTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATg < 1:443208/143‑1 (MQ=255) aaaaGCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTAGTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCACTCAGGCAGTATGCTCAGAATATgg < 2:399680/143‑1 (MQ=255) aaaTCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGgc > 1:447345/1‑143 (MQ=255) agcgcaGCTGAGAGACCAGATGAAAGGAAGAGTGAACGGGGCACGGTATTGACGCTTATTTAGTGGTGAGAACTACGGTCCAGGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGgcgc < 2:210317/138‑1 (MQ=255) cTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAg > 1:401180/1‑143 (MQ=255) tAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGa < 1:15363/143‑1 (MQ=255) cTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACg > 2:166180/1‑143 (MQ=255) tCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATGTGGCCCAGATACGc > 2:36518/1‑143 (MQ=255) gAAAACGAAGTAAAGTAATCATCAACGTAGCACCGTATTTACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTc < 1:505300/143‑1 (MQ=255) gcGGATTAAAGTAGGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGa < 2:911197/142‑1 (MQ=255) ggATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATc < 2:150306/143‑1 (MQ=255) gATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGGTCg > 1:783098/1‑143 (MQ=255) aTTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTGCGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGCCCGTATGCTCCGAATATGGCGCAGCGCCGCTCCCGGAGCGa > 2:1036762/1‑143 (MQ=255) ttAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGGATGCTCAGAATAGGGCGCAGATACGCTTCCGGCACGAt > 2:128386/1‑143 (MQ=255) aGTAAGCGTGAAGGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCGATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGATACCg < 2:135392/143‑1 (MQ=255) aGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCGACACGGTTGGAGGGCCGTTCCGGATGGTCGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCGGGAACGATACCg > 1:93332/1‑143 (MQ=255) gTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGATCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGCAAGTATGCTCAGAATCTGGCGCAGATACGCTTCCGGAGCGATACCGt > 2:178768/1‑143 (MQ=255) | GATATTACTGATAAACCTTCCAGTGGAGGTGCGTTATGGCCGTTTTAACGATTAGCATTGACCTGACAAAAAATGAATTCCAAATCCACGGTCTGGGTAGGAACAGAAAAATCTAAGCTCAGAAAACGGATTAAAGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGATACCGT > NC_000913/2078384‑2078661 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |