| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 454,195 | T→G | 11.7% | intergenic (‑28/‑277) | yajG ← / → bolA | putative lipoprotein/stationary‑phase morphogene, transcriptional repressor for mreB; also regulator for dacA, dacC, and ampC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 454,195 | 0 | T | G | 11.7% | 224.4 / 2.5 | 110 | intergenic (‑28/‑277) | yajG/bolA | putative lipoprotein/stationary‑phase morphogene, transcriptional repressor for mreB; also regulator for dacA, dacC, and ampC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/52); new base G (16/5); total (52/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.74e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GTAACGATTTGATTATCGCGGGTGACTTTTGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGAAACGGTAAAAGCGGCTAGTATTTA > NC_000913/453962‑454429 | gttatgatttgatttTCGGGGGTGATTTTTGCCAGCGGCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACATCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGttt < 2:261779/233‑1 (MQ=255) tGATTATCGCGGGTGACTTTTGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTT‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGGAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTT‑AGAAACTCCTAA‑GCGGGTTTGGGAAAAAt > 1:492528/1‑238 (MQ=255) tGATTATCGCGGGTGACTTTTGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGGAAAAAt > 1:1014835/1‑238 (MQ=255) tGATTATCGCGGGTGACTTTTGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCAACCTGCAAGCATAAACAGAGCACCTAACGGGCAGAGGATTTTTTTGGACATGTTCGGGCCCTC‑CAAGACCCTTAA‑GCGGGTTTGGTAAAAAt > 1:259072/1‑238 (MQ=255) aTTATCGCGGGTGACTTTTGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGGTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTTAACATGTTCGGGGTCTC‑AAGGAACTTTTA‑GCGGGGTTTGGAAAAATTc > 1:1201432/1‑238 (MQ=255) tATCGGGGGTGACTTTTGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑TGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCg < 1:448102/239‑1 (MQ=255) tATCGCGGGTGACTTTTGCCAGCGCCTGATCTGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGAAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCg < 1:127550/239‑1 (MQ=255) aTCGGGGGTTCCTTTTGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCATCATTAAGGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGc < 1:160650/239‑1 (MQ=255) tCGCGGGTGACTTTTGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGCAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTT‑TGCATCCTGCAAGCATAAAAAGAGCAAATAAACGGGAGAGGGTTTTTTTGAAAATGTTCCGGCTCTC‑AAAGACCCCTTA‑ACGGGTTTGGGAAAAAATcccccc > 2:1066659/1‑239 (MQ=255) tCGCGGGTGACTTTTGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCG‑CGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCCTCCTGCAAGCATAAACCGAGCAACTAACCGGAAGAGGGTTTTTTTGAAAATGTTCAGGCCCTC‑AGAGACTCTTAA‑GAGCGTTTGGTaaaaaatttcccg > 2:1211597/1‑230 (MQ=255) cgcgGGTGACTTTTGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTTCCGCca > 1:656749/1‑239 (MQ=255) gTGACTTTTGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGCGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATtata > 1:722203/1‑239 (MQ=255) tttttGCCCGCGCCTGGTCGGTTCGCGTATCGGCACCATTAATTCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTTAAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGGTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACAt < 2:1014835/238‑1 (MQ=255) ttttGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGGGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAACCTTCAATAGGTGTTGGCGGTTTTT‑GAGATCCCGGCACCATAAACAGAGCAACTTACAGGTAGGGGATTTTTTTGTCCAAGTTCAGGTGTTC‑AAAGACCTTTAC‑GAGGCTTTTGGAAAAATTCCCCCCATCATaaactt > 2:1309649/1‑235 (MQ=255) cgcCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCCAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGGGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑Gc > 1:296792/1‑239 (MQ=255) cgcCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAAAATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGGGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑Gc > 1:439824/1‑239 (MQ=255) cGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGaa < 1:1299831/239‑1 (MQ=255) cGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGAAGTGTAATCGTCGGGGAATCTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGaa < 1:612879/239‑1 (MQ=255) cGGTACCGTGATCGGCCCCATTAATGCTTACGGTGGCCCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAACCGTCGGGGAAATTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATTTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGaa < 1:181532/239‑1 (MQ=255) ggttgtCGGCACCATTAATGCTTAGGGTAACGCCCATCGGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTATAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGt < 1:4172/234‑1 (MQ=255) tGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTaa < 1:628579/239‑1 (MQ=255) aTCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGCAACTTCAATAGTTGTTGGCGGGTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAACAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑CGAAACCCTTAA‑GGCGGGTTGGGAAAAAATCCCGCCCTCATAAAACTGCCAACG‑GGGAGGGGAAATGGGGaaag > 2:256983/1‑237 (MQ=255) aTCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGGAGAGGATTTTTTTTAACATGTTCGGGGTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCCTCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGGAGGGGGTAAgg > 1:660268/1‑239 (MQ=255) cACCTTTAAGGCTTAGGGGGACGCCCATCAGGCTTGGATCTGGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGGGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATg < 1:1003411/238‑1 (MQ=255) ttAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑ACGGGTTTGGTTAAAATTCCCGCCAACCTAAAATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGGGGGGAAGGCATGTAAAtt > 1:1236451/1‑239 (MQ=255) ttAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTAGGGCTTTC‑AGGGACTCTTAA‑GGGGGTTTGGTAAAAATTACCCCCATCATAACCTTGCCAACGCGCG‑GGGGAAGTGGGTAAGGCCTTGAAAtt > 1:113731/1‑239 (MQ=255) ttAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑AGCATCCTGCAAGCATAAACCGGGCACCTAAACGGCAGGGGGTTTTTTTTACCATGTTCGGGCCCTC‑ACGGACTTTTCA‑GCGCGTTTGGTTAAAATTCCCCCCCTCAATACATTGCCACAC‑GCGCGGGGGAGTGGGTAAAGCATGaaaaat > 2:713222/1‑237 (MQ=255) tACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACCAGTTCGGGGTCTC‑AGAGACTCTTAA‑ACGGGTTTGGTAAAAATTCCCGCCCTCATAACATTGTCAACG‑GCGGGGGGGAGGGGGTAAAGCATGAAAAATtatcattt > 2:258122/1‑237 (MQ=255) tACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATtcatccttg > 1:196808/1‑235 (MQ=255) tACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGGTTTG‑CGCATCCTGCAAGGATAAACAGAGCAACTAACGGGGAGAGGGTTTTTTTTAAAATGTTCGGGCTCTC‑AGAAAACCTTAA‑AGGGGTTTGGTAAAAAATCCCCCCACCAAAAACTTTCCAACG‑GGGGGGGGGAAGGGGGAAAGCAAGTAAAtaaaaaaaat > 2:1001658/1‑230 (MQ=255) agggTAACGCCCATAGGGCTTGGATCCTGCTTGGGCAGTGTAAGCGTCGGGGAAACTTCAATATGTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACGGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTTTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGtt < 1:474489/237‑1 (MQ=255) aCGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATCAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAAAATGTTCGGGATCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGCGTTTGGTCAAAATTCCCGCCCTCATAAAATTTCCAACC‑GCAAGGGGAAGTGGGGAAGGCATCTAAATTCCTCATGtt > 1:843419/1‑239 (MQ=255) ggTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGa < 1:342212/239‑1 (MQ=255) tcccccccTCAGGTTTGGATTCTGGTTGGGCAGTTTAATGGACGGGAAAACTTAAATAGTTGTGGGCGGTTTTG‑CGAATCCTGCAAGCATAAACAGGGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACg < 2:1254796/234‑1 (MQ=255) gACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCGGTGGCAGGGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACg < 1:616551/238‑1 (MQ=255) cATCGGGGTTGGCTCCTGGTGGGGCAGGTAAATCGGGGGGGAAACTTAAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGTTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAaataat < 1:713222/239‑1 (MQ=255) tcTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAAGCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGa < 1:594812/191‑1 (MQ=255) tGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGGAGAGGATTTTTTTGGACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACCCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCACTCATAACATTGCCAACG‑GCGCGGGGGAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCAAGTTGACGAAAAAATCGCCCCTgg > 1:368360/1‑239 (MQ=255) ggATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACCAAATAATTGCCCCTGGt > 1:245970/1‑239 (MQ=255) tgctgTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATTAACACAGAAAATAAAGGGGGAAGGATTTTTTTTAACACGTTCGGGATCCC‑AAGGACTCTTAA‑GCGGGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑CCAGCGGGAGGAGGGGAAGGCATGTCAATTCACCATGTTGAAGCAAAAAGCCCCCCCGGGAAAAGa > 2:81003/1‑239 (MQ=255) tgctgTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGGAGGGGGTTTTTTTGAAAAAGTTCGGGCTCTC‑AGAAACTCTTAA‑GCGGGTTTGGTAAAAATTACCCGCATCCTAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGGAAGGGACGTAAAATCATATTTTTTACGAAAAAATACCCCCTGGTaaaaaa > 2:1219365/1‑237 (MQ=255) tgctgTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCCTAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAAATCAACAATTTGACCAAAAAAATGCCCCTGGGaaaaaa > 2:206596/1‑237 (MQ=255) tgctgTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGATTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAGGTGGGTAAGGCCTGTAAATTTATCATGTTTAAGAAAAAATAGCCCCCGGTaaaaaa > 2:1145260/1‑237 (MQ=255) ggggtgggggtgtAAGTGTCGGGGAAACTTCAATAGTTTTTGGGCGTTTTG‑CGTATCCCGCAAGACTAAACAGGGCAAATAACGGAAAGGGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCCC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGa < 2:1236451/229‑1 (MQ=255) ggCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTTGTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAATTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGCCTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACt < 1:256983/239‑1 (MQ=255) gCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGGGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGGAAAAGAAACACTg > 1:821080/1‑239 (MQ=255) gtAATGTTCGGGAAAAATTCAATGTTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCCGCAAGCAAAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATCCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCg < 2:193787/239‑1 (MQ=255) gtAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCCTTTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAAAACTgtttcg > 1:1157996/1‑234 (MQ=255) gtcgtcgGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGGTTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGGGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAAAATTGCCAACG‑GCGAGGGGGAGTGGGTAAGGCCTGTAAATTCCACCTGTTGACCAAAAAATTGCCCCCGGGAAAAGAAAAACAGAAGGGAg > 2:900952/2‑238 (MQ=255) gtcgGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑GGCATCCTGAAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCt < 1:500981/239‑1 (MQ=255) gtcgGGGAAACTTCAATAGTTGGTGGGGGTTTTG‑CGCATCCTGGAAGCAAAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAAAATGTTCGGGGTCTT‑AGGGGCTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCt < 1:260252/239‑1 (MQ=255) ggAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTTGGAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGGAAATTCATCATTTTGACGAAATAATAGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCtggggt > 1:526900/1‑235 (MQ=255) ggAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCtgtggt > 1:932920/1‑237 (MQ=255) aactttaaaTTGTTTTTGGGGTTTTTG‑CTCATCCTGAAAGCAAAAATAGGACAACTAATGGGAAGAGGATTTTTTTGAAAATGTTCGGGCTCTA‑AGAGCCTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGttt < 2:439824/231‑1 (MQ=255) aaaCTTCAATAGGTGTTGGCGGTTTTT‑AGCATCCTGAAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGTTTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGGCTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGttt < 1:26129/238‑1 (MQ=255) aaCTTTAATTTTTTTTGG‑GGTTTTGTCGCATCCGACAAGCTAAAACAGACAAACT‑ACGGAAAGGGGATTTTTTTAAACTTTGTCGGGCTGTC‑AGGAACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAATGTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCa < 2:1063162/238‑1 (MQ=255) aaCTTTAATGTTTGTTGGGGTTTTTG‑CGCCTCCTGCAAGCATAAACAGGGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTAAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGGGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCa < 2:424729/239‑1 (MQ=255) cTTCAATGGTTGTTGGGGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCAAAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCt < 1:415787/229‑1 (MQ=255) aaTAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGa < 1:87645/150‑1 (MQ=255) attgtttttGGGGTTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGGGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGGTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTa < 1:807338/236‑1 (MQ=255) tAGTTGTTGGGGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTaa < 1:1066659/239‑1 (MQ=255) tgttgGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGGAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGCGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTTCCAACG‑GCGAGGGGGAGTGGGTAAGGCATGTAAAATACTCATTTTGACGAAAAAAAGCCCCCTGGGAAAAAAAAACCTAAACGGTGGCCTGGGTTTCaaaccatttcctt > 2:415787/1‑228 (MQ=255) tgGCGTGTTTG‑CGCATCCTGCAAGCAAAAACAGAACAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTa < 1:229882/239‑1 (MQ=255) ggggtttttG‑CGCATCCGGCAAGCTTAAACAGAGCAAGTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACGTGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTTTTAA‑GGGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTaa < 2:660268/234‑1 (MQ=255) ggCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTaa < 1:334264/239‑1 (MQ=255) tG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTTACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGGGTTTCAATCTTTAAATCATTAAACTTctt > 1:185481/1‑236 (MQ=255) tCCTGCAAGCATAAACAGAGAAATTAACGGGAAGGGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTg < 1:23219/239‑1 (MQ=255) aGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGGGTTTCAATCTTTAAATTAGTAAACTTCATAGGCTTAACGGtaa > 1:147482/1‑239 (MQ=255) cATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGAAGCGAGGGCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAATAAACTTCATACACTTGACGGaaaa > 2:1056404/1‑238 (MQ=255) ttAAAAAGAGAAAATAAGGGGAGGAGGTTTTTTTTTAAATTGTGCGGGATCTA‑AGAGATTCTGAA‑GCGGGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAAc < 2:449716/238‑1 (MQ=255) aaCAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAg > 1:784233/1‑239 (MQ=255) ggCAAATAAGGGGAAGAGGATTTTTTGGAACATGTTCGGCCTCTA‑AGGGCCTTTTAG‑GCGTGTTGGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACg < 2:185481/237‑1 (MQ=255) agCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAACCCAgaccga > 1:467559/1‑234 (MQ=255) gaaaCTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGGAAAAATTCCCGGCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACg < 1:1309649/235‑1 (MQ=255) cTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGGGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAAAACTGATCCCAGGCATTGGTTTCAATCTTCAAATAAGTAAACTTCATAACCTGTAAGGAAAAACCAGGACaaaaaca > 2:614353/1‑236 (MQ=255) cggggagggtttttttttAAACTTGTTGGGGCTCTC‑A‑ATACTCTTAAGGGGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAat < 2:492528/228‑1 (MQ=255) gAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTACATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATAAGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAAACAAAataat > 2:18985/1‑237 (MQ=255) gatggtttttttttGAACTTGTTCGGGTGTGC‑AGATATTTTTAA‑GCGTGTTGGTGAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATAtt < 2:722203/231‑1 (MQ=255) ggttttttttGAACATGTTCGGGCTCCC‑AGAGACTTTTAA‑GCGTGTTGGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATttgt < 1:18985/234‑1 (MQ=255) ttttttgGAACATGTTCGGGCTCTA‑GGAGTCTTTAAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGACATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACGGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTa < 1:167586/239‑1 (MQ=255) tttttGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGGGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAg < 1:258122/239‑1 (MQ=255) tttaGAACATGTTCGGGC‑CTCAAGAGACTTTGAA‑GCGGTTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAGCG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGc < 1:443802/239‑1 (MQ=255) aCATGTCCGGGTCCTC‑AAGGTCTCTTAA‑GGGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAAt < 1:663611/239‑1 (MQ=255) tgtgCGGGCTTTA‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGa < 1:970355/239‑1 (MQ=255) tGTTCGGGCTTCG‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGa < 1:1001658/239‑1 (MQ=255) gTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGaa > 1:1024752/1‑239 (MQ=255) gTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAAAATTTGTTGTTAAGTTGCAAAGGaa > 2:820685/1‑239 (MQ=255) gTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGACCGAAACCTAAAAATTTGTTGTAAAGTTGAAATGGaa > 2:547520/1‑239 (MQ=255) tc‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTTAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGAAACGGTAAAAg < 1:390500/239‑1 (MQ=255) tc‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAACTCAGCTAACTTCATACGCTCGACGGAAAAACCAGGACGAAACTCAAATATTTTTTGTTAACCGTCAATAGAAACGGAaaaa > 2:535441/1‑238 (MQ=255) c‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTTAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCCAAAAATTTGTTGTTAAACTGCAATGGAAAAGGGaaaaaa > 2:390500/1‑237 (MQ=255) c‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATGCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGGGGGGAAGTGGGAAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAAAAATCGCCCCCGGTAAAAGAAACACTGATTGGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGAACGAAAACTAAATATTAGTTTTTAAGCTCCAATGGAACGAGTaaaaca > 2:786404/1‑237 (MQ=255) taCTCTGAG‑GCGGTTTTGTTAAAAATTCCCCGCATCATAACATTGCCGACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCACTTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGAAACGGTAAAAGCGGc < 2:1201432/237‑1 (MQ=255) gcttttAA‑GGGTGTTTTGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGAAACGGTAAAAGCGGCt < 1:969958/234‑1 (MQ=255) cttttAA‑GCGTGTTTGGGAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GAGAGGGGAAGTGGGGAAGGCATGTAAAGTCATCATGTTGACGAAATAATCGACCCTGGTAAAAGAAACTCGGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGAAACGGTAAAAGCGGCTa < 2:259072/235‑1 (MQ=255) ctctTAA‑GGGTGTTTGGTAAAAATTCCCGGCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGAAACGGTAAAAGCGGCt < 1:614353/237‑1 (MQ=255) ctctTAA‑GCGGTGTTGGTAAAAATTCCCGCCATCCTAACATTGGCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGAAACGGTAAAAGCGGCTa < 1:279883/238‑1 (MQ=255) ccttgaa‑GCGTTTTTGGTAAAAATTCCCGACATCATAACCTTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATAATTGTTGTTAAGCTGCAATGGAAACGGTAAAAGCGGCTa < 1:659564/233‑1 (MQ=255) aa‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGAAACGGTAAAAGCGGCTAGTAttt < 1:1211597/239‑1 (MQ=255) a‑GCGAGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGAAGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGAAACGGTAAAAGCGGCTAGTATTTa < 1:33598/239‑1 (MQ=255) | GTAACGATTTGATTATCGCGGGTGACTTTTGCCAGCGCCTGATCGGTACGCTGATCGGCACCATTAATGCTTACGGTGACGCCCATCAGGCTTGGATCCTGCTGTGGCAGTGTAATCGTCGGGGAAACTTCAATAGTTGTTGGCGGTTTTG‑CGCATCCTGCAAGCATAAACAGAGCAACTAACGGGAAGAGGATTTTTTTGAACATGTTCGGGCTCTC‑AGAGACTCTTAA‑GCGTGTTTGGTAAAAATTCCCGCCATCATAACATTGCCAACG‑GCGAGGGGAAGTGGGTAAGGCATGTAAATTCATCATGTTGACGAAATAATCGCCCCTGGTAAAAGAAACACTGATGCGAGGCCTGTGTTTCAATCTTTAAATCAGTAAACTTCATACGCTTGACGGAAAAACCAGGACGAAACCTAAATATTTGTTGTTAAGCTGCAATGGAAACGGTAAAAGCGGCTAGTATTTA > NC_000913/453962‑454429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |