Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,209,180 | T→G | 14.0% | V386G (GTG→GGG) | ttdT → | L‑tartrate/succinate antiporte |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,209,180 | 0 | T | G | 14.0% | 255.8 / 4.3 | 112 | V386G (GTG→GGG) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/55); new base G (17/3); total (54/58) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.33e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.39e-01 |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
ATCGATGCCGCGATGGTCGGTTACAGCGTG‑GTGGCACTGATGCTGCTTCTGCGCATTATCAGTTGGGACGACATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGC‑TGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGT‑GTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGC‑GGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAGTGGTTATCTGCCAACGGCGGATTACTGGCGAC > NC_000913/3208942‑3209407 | tttcgtGCCGCGGTGGTGGGTTTCAGGGGG‑GTGGCAATGATGGTGCTTCTGCGGATTATCAGTTGGGACGTCATTGTCAGTAATAAAGCGGCGTGGAACGTTTTCTTCTGGC‑TGGCCTCGCTTATCACCCTCGCCACCGGACTCAACAACACCGGTTTTATTAGCTGGTTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTgtggt < 2:821814/234‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |