| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,499,651 | 0 | G | T | 22.9% | 135.8 / 5.6 | 70 | intergenic (+36/‑259) | yhfL/frlA | small lipoprotein/putative fructoselysine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (12/40); new base T (15/2); total (28/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.60e-06 | |||||||||||
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ACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAG‑AAATCGGCTAAC‑A‑CCGGTTTAATTG‑CCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTA > NC_000913/3499433‑3499886 | aCATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAG‑AAATCGGCTAAC‑A‑CCGGTTTAATTG‑CCCGACGCCCTCTg < 1:506941/233‑1 (MQ=255) 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caGTAAGTCTCTGACAG‑AAATCGGCTAAC‑A‑CCGGTTTAATTG‑CCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACCTTACATAACATCATATGTTGTTATAtt > 1:381701/1‑221 (MQ=255) cggtattctcTGACAG‑AAATCTGCTAAC‑A‑TCTGTTTAATTG‑CCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTTCTTC‑TTG‑‑CCTCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAAcatc < 2:449937/199‑1 (MQ=255) gTAAGTCTCTGACAG‑AAATCGGCTAAC‑A‑CCGGTTTAATTG‑CCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTCCATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAAcatcaaa > 2:1326838/1‑205 (MQ=255) gTAAGTCTCTGACAG‑AAATCGGCTAAC‑A‑CCGGTTTAATTG‑CCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCata < 1:1326838/207‑1 (MQ=255) tAAGTCTCTGACAG‑AAATCGGCTAAC‑A‑CCGGTTTAATTG‑CCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACCGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTTTGATCTTCCTCCACATTACATAAAATCATATTTTGTTTTATTTATAATAcattttcatttt > 2:1196185/1‑237 (MQ=255) tAAGTCTCTGACAG‑AAATCGGCTAAC‑A‑CCGGTTTAATTG‑CCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTTTCATGTTa > 1:202955/1‑238 (MQ=255) aGTCTCTGACAG‑AAATCGGCTAAC‑A‑CCGGTTTAATTG‑CCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCt > 1:600504/1‑239 (MQ=255) gTCTCTGACAG‑AAATCGGCTAAC‑A‑CCGGTTTAATTG‑CCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAgcg > 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ACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAG‑AAATCGGCTAAC‑A‑CCGGTTTAATTG‑CCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTA > NC_000913/3499433‑3499886 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |