| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,499,694 | 0 | G | T | 11.7% | 206.6 / 2.1 | 74 | intergenic (+79/‑216) | yhfL/frlA | small lipoprotein/putative fructoselysine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (21/43); new base T (7/3); total (28/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.56e-02 | |||||||||||
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GTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTGCGGTCCTACTGCACAGTAAGTCTCTGACAG‑AAATCGGCTAAC‑ACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTCCCCTACAACGTATTGGACAAGAAAAAGGTATCGCTATGGG > NC_000913/3499475‑3499914 | gTAGGTGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGGTGCGGGCCTACTGCACACAAAATCTCTTACCG‑AAAACGGCTAAC‑ACCCGTTTATATTTCCGCCACCCTCTGGGTTTTT‑CCCGTGCGCGTTTTTTTCTCTGTGCTTC‑TTT‑‑Ccccccccc > 1:1269312/1‑238 (MQ=255) tGCAGTACTGGCTACGTTAACTGCATGTACTGGTCATATTGAAAACCGTGATAAGAACTGCTCTTACGACTACCTGCTGCACCCGGCAATTTCTATTTCTAAAATCATTGGCGGTTTCGGTCCCACTGCCCAAAAAATCTCTTACAGAAAATCGG‑TCAC‑ACCCGGTTTATTGCCCCCCGCCCCCCTGAATTTC‑CGAGGGCGGCTTTTTTTCTTTGTCCCTC‑TTT‑‑Ccccccccccccaaa > 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(MQ=255) gTCTCTGACAG‑AAATCGGCTAAC‑ACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAgcg > 2:389599/1‑153 (MQ=255) ctctGACAG‑AAATCGGCTAAC‑ACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCtttt > 2:211946/1‑239 (MQ=255) aaTCGGCTAAC‑ACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TTTGCGAAATTTTGTGa > 2:71489/1‑164 (MQ=255) aaTCGGCTAAC‑ACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGa < 1:71489/164‑1 (MQ=255) tCGGGTAAC‑CCCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATTTCCTTC‑TTG‑‑‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCaaa < 1:890202/239‑1 (MQ=255) tAAC‑CCTGGTTTAATTTCCCGTCCCCCTCTGGATTTTC‑CGAAGGTTTTTTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCCCTTTAAATTCAATTTTATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAActc < 2:184481/238‑1 (MQ=255) c‑acCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTC‑CGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTC‑TTG‑‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCC‑TGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTCCACATTACATAACATCATATGTTGTTATATTCATCATGCATTGTCATGTTACCTTTTAAATGACTGCAAACTCTccc < 1:1252955/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |