| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3368970 = | 148 (0.920) | 4 (0.030) | 4/494 | NT | 2.9% | intergenic (+16/+44) | yhcG/yhcH | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily/DUF386 family protein, cupin superfamily |
| ? | NC_000913 | 3368995 = | 125 (0.810) | intergenic (+41/+19) | yhcG/yhcH | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily/DUF386 family protein, cupin superfamily | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
AGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGGTTTTAAGATGATGGCTTGCTCGTTATCAATGGTGCTGCAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCA > NC_000913/3368684‑3369248 | gcaatacattgatatccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaacgAt < 1:1162804‑M1/2‑1 (MQ=255)gcaatacattgatatccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagAt < 1:539649‑M1/2‑1 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAATATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGGCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTTCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTTGTTCGAAACCAGGTGGTGCTAGAGGAAGGCTATAAACGCCGTTAATTTAAACGGTTTCGCATTCTGc > 1:1294704/1‑289 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTTTGGCTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCCAGCGACTATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTAGCAGATGAACTTGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGCGGAAGGCTATAGACGCCGTCAATTTCACCGGTTTCGAATTCTga > 1:1175333/1‑288 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTTCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGACGCACCTACTTGATGAGAACCGACTCGCAAATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGCGCTAGAGGAAAGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTga > 2:760471/1‑288 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGc > 1:829193/1‑289 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGc > 1:526815/1‑289 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGc > 1:1429299/1‑289 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGc > 2:860962/1‑289 (MQ=255) ggCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGc > 1:431947/1‑289 (MQ=255) 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gatctccagctgttattaaacggtgaggaactgattctgttttgcatgtcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggagtgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagATTCTGCAGACa > 2:41968‑M1/278‑289 (MQ=255) gatatccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagATTCTGCAGACa < 2:58238‑M1/12‑1 (MQ=255) atatccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagATTCTGCAGAc < 2:366935‑M1/11‑1 (MQ=255) atatccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagATTCTGCAGAc < 1:730551‑M1/11‑1 (MQ=255) tccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagATTCTGCAGAc < 1:1298120‑M1/11‑1 (MQ=255) tccagctgttattaaacggtgaggaacggattctgtttggcatggcaggcactgcgcgtcagtgtgaagagttccaccatgaggatgattatcagctttgcagcaccattgataacgagcaagccatcatcttaaaaccgggaatgttcgccgtgtttatgccaggtgaaccgcataaaccaggatgcgttgtcggcgagcctggagagattaaaaaggttgtggtgaaggttaaggctgatttaatggcttaaaacttagttcgttttaaagATTCTGCAGAc < 1:1006102‑M1/11‑1 (MQ=255) cGAGGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGa < 2:1303263/288‑1 (MQ=255) aTGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAg > 2:10686/1‑274 (MQ=255) aTGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTATCTGCAg < 1:10686/274‑1 (MQ=255) tGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaaaa < 1:562574/284‑1 (MQ=255) aTCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAACGTAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCACGCGAATATAAGATGCAACTACCTGCTGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCAAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGATATAGACGCAGTTAATTTACGCGGTTTCGAATGCTGCAGCAAGTGTCTGCAGCAACATTAAAACGAACTAAGTTTTa > 2:848677/1‑289 (MQ=255) tctcAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTaa < 1:1086525/289‑1 (MQ=255) 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AGTGGGCAAATTCAGCTATAGCGATGCCGGACAGATGAATATGTATCTCAACTACGCCAAAGAGCACTGGACGCTACCGGATGAAAATCCGCCCATCGGTCTGGTTCTCTGTGCAGAGAAAGGAGCCGGAGAAGCGCA‑TTATGCTCTGGCAGGTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGGTTTTAAGATGATGGCTTGCTCGTTATCAATGGTGCTGCAAAGCTGATAATCATCCTCATGGTGGAACTCTTCACACTGACGCGCAGTGCCTGCCATGCCAAACAGAATCCGTTCCTCA > NC_000913/3368684‑3369248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |