| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,976,996 | C→A | 9.4% | S133* (TCA→TAA) | galR → | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,976,996 | 0 | C | A | 9.4% | 458.7 / 22.5 | 148 | S133* (TCA→TAA) | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (63/68); new base A (10/5); total (74/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
GTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTGGCGCAGCAGACCACTGAAACGGTCGGTCTGGTCGTTGGTGATGTTTCCGATCCGTTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGGCGAACCAGACGAAAGCGGCGGCGAA > NC_000913/2976711‑2977273 | gTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTGGCGCAGCAGACCACTGAAACGGTCGGTCTGGTCGTTGGTGATGTTTCCGATCCGTTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTAAtt > 1:243606/1‑289 (MQ=255) 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GTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTGGCGCAGCAGACCACTGAAACGGTCGGTCTGGTCGTTGGTGATGTTTCCGATCCGTTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAACAAAAAGAGCGTCAGGCCATTGAGCAACTGATCCGCCATCGCTGTGCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGGCGAACCAGACGAAAGCGGCGGCGAA > NC_000913/2976711‑2977273 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |