| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,023,796 | Δ5 bp | 14.5% | intergenic (+118/‑168) | fliR → / → rcsA | flagellar export pore protein/transcriptional regulator of colanic acid capsular biosynthesis |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2023801 = | 127 (0.860) | 20 (0.140) | 20/480 | NT | 14.5% | intergenic (+123/‑167) | fliR/rcsA | flagellar export pore protein/transcriptional regulator of colanic acid capsular biosynthesis |
| ? | NC_000913 | = 2023795 | 113 (0.800) | intergenic (+117/‑173) | fliR/rcsA | flagellar export pore protein/transcriptional regulator of colanic acid capsular biosynthesis | |||||
ACAAGCTATGGCAAGGTCATCAACGGTTTCAATGTCGTTGATTTCTCTTTTTTTAACCCCTCTACTCAACAGATACCCGGTTAAACCTAGTCGGGTGTAACTACATAAATCCATAATAATCGTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2024096‑2023801‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaagtaaaTGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATAATTGCGGGGCCA < NC_000913/2023795‑2023512 ACAAGCTATGTCAATGTCATCAACGGTTTCAATGTCGTTGATTTCTCTTTTTTTAACCCCTCTACTCAACAGATACCCTGTTAAACCTAGTCGGGTGTAACTACATAAATCCATAATAATCCTTTACATGGCATACCCTCACTCAATGCTTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCATTCTCGCGATTTTTCAGGCTGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTA < 1:829628/289‑1 TATTGCAAGGTCATCAACCGTTTCAATGTCGTTTAATTCTCTTTTTTTAACCCCTCTACTCCACAGATACCCGGTTAAACCTAGTCGGGTGTAACTACATAAATCCATAATAATCGTGGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAA < 2:674603/289‑1 TATGGCAAGGTCATCAACGGTTTCAATGTCGTTGATTTCTCTTTTTTTAACCCCTCTACTCAACAGATACCCGGTTAAACCTAGTCGGGTGTAACTACATAAATCCATAATAATCGTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGT < 1:880124/287‑1 TATGGCAAGGTCATCAACGGTTTCAATGTCGTTGATTTCTCTTTTTTTAACCCCTCTACTCAACAGATACCCGGTTAAACCTAGTCGGGTGTAACTACATAAATCCATAATAATCGTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGT < 1:723527/287‑1 CAGATACCCGGTTAAACCTAGTCGGGTGTAACTACATAAATCCATAATAATCGTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGT > 1:446266/1‑289 ACCCGGTTAAACCTAGTCGGGTGTAACTACATAAATCCATAATAATCGTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTA > 1:86906/1‑289 GGGTGTAACTACATAAATCCATAATAATCGTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATA < 2:1158410/289‑1 TAAATGCATAATAATCGTTGACATGGCATACCCTCGCGCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCAGCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCCCTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAA < 1:789675/289‑1 TAATAATCTTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAA > 2:588566/1‑289 TCGTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTT > 1:1413464/1‑288 ACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAAT < 2:446266/289‑1 ACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAAT > 1:347885/1‑289 TGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGAT < 1:665068/254‑1 TGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGAT > 2:665068/1‑254 TTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCA < 1:588566/289‑1 AACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTT > 1:471633/1‑124 AACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTT < 2:471633/124‑1 ACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAA < 2:347885/289‑1 ACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATA > 1:865259/1‑193 ACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATA < 2:865259/193‑1 GCGCCACTATCGCGATTTTCCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGACTGGAATTGTCTCAAAGTAATTGTTGCGATTTGAGAGTGCGCTTAAAAAAAATATTTCGCTGCCGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGACAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATT > 2:1205877/1‑289 TAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATT > 2:166293/1‑160 TAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATT < 1:166293/160‑1 TGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAA < 2:1413464/289‑1 GTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATAATTG < 1:90699/289‑1 AAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATAATTGCGGGG < 2:223381/289‑1 AAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATAATTGCGGGG > 1:1351019/1‑288 AAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAAT > 2:1062764/1‑265 AAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAAT < 1:1062764/265‑1 AAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATAATTGCGGGGCCA < 2:316330/287‑1 ACAAGCTATGGCAAGGTCATCAACGGTTTCAATGTCGTTGATTTCTCTTTTTTTAACCCCTCTACTCAACAGATACCCGGTTAAACCTAGTCGGGTGTAACTACATAAATCCATAATAATCGTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2024096‑2023801‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaagtaaaTGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATAATTGCGGGGCCA < NC_000913/2023795‑2023512 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |