| Predicted mutation | |||||||
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| JC | NC_000913 | 3,992,469 | Δ4 bp | 6.2% | coding (1317‑1320/2547 nt) | cyaA → | adenylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3992473 = | 241 (1.760) | coding (1321/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
GCTGGCGTCGCGCAGTGTTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTT > NC_000913/3992186‑3992756 | cgtcgcgcagtgttgagccagttagtgagcgagtggggttgggacgaagctcgtctggcaatgctcgataaccgcgctaactggaagattgatcaggtgcgtgaggcgcacaacgagttgctcgacgcgatgatgcagagctaccgtaatctgatccgctttgcgcgtcgcaataaccttagcgtcttcgccagtccgcaggataacggcttgctgaagcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcaTCACCCGAtc > 1:1168996‑M2/279‑288 (MQ=255) tgtTGAGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATACTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGCGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATACCCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATACCGGCGCGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTCTGAAGCATTACCAGGTAAAGGTACGCTGGTAAACCCGCAGAGTTCAccccgtctattgga > 2:39850/1‑278 (MQ=255) aGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGa > 2:643900/1‑289 (MQ=255) aGCCAGTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGa > 1:115445/1‑289 (MQ=255) ccggTTGGTGAGCGAGTGTAGTTGGTACGAAGCTAGTCTGGCAATGCTCGTGAACCGCGCTAACTGGAAGATTGTTCAGGTGCGGGAGGCGAACAACGAGTTGCTAGGCGGAATGATGCAGAGCTACCGTAAACTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCTGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATGACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAAt < 2:953225/286‑1 (MQ=255) ggttggggAGCGAGAGTGGGTGGGACAAAGTGCGTCTGGCAATACTCGGTAGCGGGGCGGACTGGGAGATTGATGAGGGGCGTGAGGCGAACAACGAGTTGCTCGACGGGGTAATGCAGGGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTGGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGGCGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTATAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCt < 2:616983/282‑1 (MQ=255) gTTAGTGAGCGAGTGGGGTTGGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAGGCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGAtctct < 1:1262269/275‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |