| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 4034102 | 163 (1.080) | 10 (0.070) | 8/504 | NT | 5.9% | coding (958/1452 nt) | trkH | potassium transporter |
| ? | NC_000913 | = 4034172 | 160 (1.100) | coding (1028/1452 nt) | trkH | potassium transporter | |||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
ATGATGCCAGTATCGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGC‑GGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTATGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGG > NC_000913/4033821‑4034384 | atgatgCCAGTATCGGTTATTTCCATAGCCCTACTATCAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTAAGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACCGTGGTTTCATAATGTCTACAGTGCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGATGTCGAGGGCGACAACCGACGGGTTTAc > 2:1112384/1‑289 (MQ=255) tgatgCCAGTATCGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACa < 2:355602/289‑1 (MQ=255) gatgCCAGTATCGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACa > 2:326109/1‑288 (MQ=255) tATCGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAg > 2:1071882/1‑288 (MQ=255) tCGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCAt > 1:1404088/1‑289 (MQ=255) ttCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGTTTTGCAACTGACAGCATTGCCTGCt > 1:1378473/1‑289 (MQ=255) tAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTTATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACACATGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTCGcgg > 2:421335/1‑287 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |