New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4335640 = | 171 (1.130) | 4 (0.030) | 3/494 | NT | 2.5% | intergenic (‑50/+54) | eptA/adiC | lipid A phosphoethanolamine transferase/arginine:agmatine antiporter |
? | NC_000913 | 4335670 = | 150 (1.050) | intergenic (‑80/+24) | eptA/adiC | lipid A phosphoethanolamine transferase/arginine:agmatine antiporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
CAGGCCAGTGGTCGATTAAGCCATAAGAAAGAGCTTAGTGTCAGGACAATATTAATCACGCTGAAAGCGACGACCGGCATCGACAAGAAAACCAGTACGTTATGCAGCGAATCCAGCGGCAGCGCCTGCAACACCTGTTTAAAAAAGGCAATATTCAGGCAGATAGAGATATAAAAAGCGGCCAACAATAGCCAGGCGAGTAAATTCAAAGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTTTTATGTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAATTCAGCGCATACATGGCGGTGATGACCATCAGGGTGACAAATGACCACATAACCTCTTTCGCTCCGGACCCCACCACGGCCCAGATGCAGTAGAGGAAGGCAATGGTAGTAACTGCCAGATATGCCGGGCGTGCTTTACCAAAGTGACCGTGTCCGAGCAGCAGTAACGCCGCAC > NC_000913/4335352‑4335926 | caggcCAGTGGTCGATTAAGCCATAAGAAAGAGCTTAGTGTCAGGACAATATTAATCACGCTGAAAGCGACGACCGGCATCGACAAGAAAACCAGTACGTTATGCAGCGAATCCAGCGGCAGCGCCTGCAACACCTGTTTAAAAAAGGCAATATTCAGGCAGATAGAGATATAAAAAGCGGCCAACAATAGCCAGGCGAGTAAATTCAAAGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTa > 1:502904/1‑289 (MQ=255) gcCAGTGGTCGATTAAGCCATAAGAAAGAGCTTAGTGTCAGGACAATATTAATCACGCTGAAAGCGACGACCGGCATCGACAAGAAAACCAGTACGTTATGCAGCGAATCCAGCGGCAGCGCCTGCAACACCTGTTTAAAAAAGGCAATATTCAGGCAGATAGAGATATAAAAAGCGGCCAACAATAGCCAGGCGAGTAAATTCAAAGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAg > 2:842950/1‑288 (MQ=255) ccAGTGTTCGACTAAGCCATAAGAAAGAGATTATGGTCAGGACAAAATCAACCACCCTGAAAGCAACCACCGGCACCGACAAGAAAACCAGTAAGGTATGCAGCGAATCCAGCGGCAGCGCCTGCAACACCGGGTTAAAAAAGGCAATATGCAATCAGATAGAGAGATAAAAAGCGGCCAACAATAGCCAGGCGAGTAAATTCAAAGCGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACAGCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGcc < 2:459182/289‑1 (MQ=255) ccAGTGGTCGATTAAGCCATAAGAAAGAGCTTAGTGTCAGGACAATATTAATCACGCTGAAAGCGACGACCGGCATCGACAAGAAAACCAGTACGTTATGCAGCGAATCCAGCGGCAGCGCCTGCAACACCTGTTTAAAAAAGGCAATATTCAGGCAGATAGAGATATAAAAAGCGGCCAACAATAGCCAGGCGAGTAAATTCAAAGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGc < 1:365636/288‑1 (MQ=255) tCGATTAAGCCATAAGAAAGAGCTTAGTGTCAGGACAATATTAATCACGCTGAAAGCGACGACCGGCATCGACAAGAAAACCAGTACGTTATGCAGCGAATCCAGCGGCAGCGCCTGCAACACCTGTTTAAAAAAGGCAATATTCAGGCAGATAGAGATATAAAAAGCGGCCAACAATAGCCAGGCGAGTAAATTCAAAGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCtt < 1:706960/288‑1 (MQ=255) gtgccatatctttacacctgtgcggcgttactgctgctcggacacggtcactttggtaaagcacgcccggcatatctggcagttactaccattgccttcctctactgcatctgggccgtggtggggtccggagcgaaagaggttatgtggtcatttgtcaccctgatggtcatcaccgccatgtatgcgctgaattacaaccggctacataaaaacccgtatcccttagatgcaccaataagcaaagattaattccccttaatccagcaaacataaAAGCCAACCTTaa < 1:204987‑M1/13‑1 (MQ=255) gtgccatatctttacacctgtgcggcgttactgctgctcggacacggtcactttggtaaagcacgcccggcatatctggcagttactaccattgccttcctctactgcatctgggccgtggtggggtccggagcgaaagaggttatgtggtcatttgtcaccctgatggtcatcaccgccatgtatgcgctgaattacaaccggctacataaaaacccgtatcccttagatgcaccaataagcaaagattaattccccttaatccagcaaacataaAAGCCAACCTTaa < 1:1220290‑M1/13‑1 (MQ=255) gtgccatatctttacacctgtgcggcgttactgctgctcggacacggtcactttggtaaagcacgcccggcatagctggcaggtactaccattgccttcctctactgcatctggtccgtggtggggtcgggagcgaaagaggttatgtggtcatttgtcaccctgatggtcatcacagccatttatgcgctgaatcacaaccggctacataaaaaaccgtaccccttagatgcaccaataagcaaatattaattccacttaatccagcaaaaataaACACCCACCTTaa < 2:21059‑M1/13‑1 (MQ=255) gtgccatatctttacacctgtgcggcgctactgctgctcggacacggtcactttggtaaagctcgcccggcatacctggcagttactaccattgccttcctctactgcatctgggccgtggtggggtccggagcgaaacaggttatgtggtcatttgtcaccctgatggtcatcaccgccatgtatgcgctgaattacaaccggctacatgaaaacccgtaccccttagatgcccgaaaaagcaaagattaattccccttaatccaacaaacataaCAGCAAACCTTaa < 2:1243408‑M1/13‑1 (MQ=255) cGATTAAGCCATAAGAAAGAGCTTAGTGTCAGGACAATATTAATCACGCTGAAAGCGACGACCGGCATCGACAAGAAAACCAGTACGTTATGCAGCGAATCCAGCGGCAGCGCCTGCAACACCTGTTTAAAAAAGGCAATATTCAGGCAGATAGAGATATAAAAAGCGGCCAACAATAGCCAGGCGAGTAAATTCAAAGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTa < 1:732572/288‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
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read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |