Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,088,201 | 0 | C | A | 8.6% | 438.0 / 23.8 | 129 | intergenic (+341/‑83) | metK/galP | S‑adenosylmethionine synthetase/D‑galactose transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (66/51); new base A (7/4); total (73/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.57e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.44e-01 |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGATTATCATCACAACTGAAACCGATTACACCAACCACAACAGACAAAGATTTGTAATATTTTCATATTATTATTCGGTTTTCACAGTTGTTACATTTCTTTTCAGTAAAGTCTTAATTGCAGATAACAGCG‑TTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCGGTGTAATTGCTGGCGCACTGCCGTTTATTGCAGATGAATTCCAGATTACTTCGCACACGCAAGAATGGGTCGTAAGCTCCATGATGTTCGGTGCGGCAGTCG > NC_000913/3087918‑3088485 | gCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAAAACCGCCCGCACAATAACATCATTCTTCCTGATCACGTTTCACCGCAGCTTATCATCACAACTGAAACCGATTACACCAACCACAACAGACAAAGATTTGTAATATTTTACTATTATTATTCGGTTTTCACAGTTGTTACATTTATTTTCAGTAAAGTCTTAATTGCAGATAACAGCG‑TTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAAATAAGATAAATGTTAGTGTAAGGTATTACACTGAtg > 2:1584824/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |