New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 550165 | 116 (0.970) | 3 (0.030) | 3/512 | NT | 2.2% | coding (539/816 nt) | ylbF | putative anaerobic allantoin catabolic oxamate carbamoyltransferase; DUF2877 family protein |
? | NC_000913 | = 551959 | 147 (1.240) | coding (636/1068 nt) | purK | N5‑carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TTTGTCGTACCAGTGCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAACACTCTGCCGGTAACTGTTCGGTTTCATTTGCGCGTAAACGCCATTGACCGCGACCGTCATAACCACCAGTGCGACGCTTAACAATCG > NC_000913/551674‑552245 | tttGTCGTACCAGTGCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCgcc > 1:426670‑M2/1‑286 (MQ=255) gTACCAGTGCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACT‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGc < 1:874065/289‑1 (MQ=255) ccAGTGCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATAATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCTGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACCCGCGGTGCCAGTTCGTTGCTCAACAGACCTTGGGGGGTGACAAAACATTCCATCGCCAACCCCACCACATAGCCCAGCCCCTGCATAATGgccgccagcca < 2:239319‑M2/288‑12 (MQ=255) ccAGTGCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGACCATCACCGACGGATTATTCACAACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGACCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTACAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTACATCGCCATTACGCCCACATAGCCCAGCACCTTCATAAACcccgccagcat < 1:452708‑M2/288‑12 (MQ=255) tGCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGATCGCTGTTATGCCCACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGCCCTTGCGGGGTGACAACACACTCCATCTCCATTCCGCCCACATACCCCAGCTCCTGCATAAACGCCGATACCATctct > 1:379846/1‑288 (MQ=255) aTGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGTCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCCCGCCCCAATAGCCCAGCCCCTGCCTAACCGCCGACACCAACTCTTCGGCt > 2:343930/1‑289 (MQ=255) ccAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCAAAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTTTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACATTGCGGGGTGCCAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAACTCCTGCCTAATCACCGACAGCAGCTCTTCGGCTTgcg > 1:392198/1‑288 (MQ=255) cAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCTAACTGGCTGATGCTAGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGcc < 2:806169/289‑1 (MQ=255) gCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCct > 2:978248/1‑288 (MQ=255) aGTTTCGGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATGGATCATCACCGACGTATTATTCACCACTGGGTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCGAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGTGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCctgctgct < 2:556783/289‑1 (MQ=255) 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caTCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGCTCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGc > 1:296965/1‑289 (MQ=255) caTCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGc > 1:801717/1‑289 (MQ=255) caTCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCCCTTCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTTCGTTGGCCTGCGGAAAAGc > 2:92403/1‑289 (MQ=255) caTCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCCCCCGCATAATCGCCGACAGCATCCCTTCGGCTTGCGCCCGCTGCTGGGCGGTGGCCTGCGGACAAg > 2:215898/1‑288 (MQ=255) caTCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGAAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAATAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCACCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAAACGCCGACAGCATCCCTTCGGCTTGCGCCTGATGCTGCGCGTTGGctctgccacttat > 1:721031/1‑277 (MQ=255) cTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCTCCGCCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTCGGCCTGCGGAAAAGCGACg > 1:341322/1‑288 (MQ=255) 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cAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGt < 2:618213/289‑1 (MQ=255) cAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGt < 2:770309/289‑1 (MQ=255) aTCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTTGCCTTCGGAAAAGCGACGCTGGTgc > 1:1062579/1‑289 (MQ=255) 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cTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCCACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCTGATGCATGTTATGCGTCAGCGGATAAAACAAGGTGCTGCCATCCAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACCCTTCACCAGAGACGTTAATGCCCTTCTCGACAATACATTCGCCGTAACCCTCCGCCGGTCACCGTCAGGTTTCATTTGCGGGTAAACGCCATTGACCGCTACAGCACTAAACCCCAGAGCGACg > 2:847901/1‑288 (MQ=255) tCCTGCATAAGCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGTGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCGTATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAACACTCTGCCGGTAACTGTTCGGTTTCATTTGCGCGTAAACGCCATTGACCGCGACCGTCATAACCACCAGTGCGACGCt < 1:387828/289‑1 (MQ=255) tGCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAACACTCTGCCGGTAACTGTTCGGTTTCATTTGCGCGTAAACGCCATTGACCGCGACCGTCATAACCACCAGTGCGACGCTTaa < 2:673684/289‑1 (MQ=255) gCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAaca > 2:641933/1‑208 (MQ=255) aTAATCGCCGACTGCATCTCTTCGGCTTGCGCGTGCTGCGGTGCGGTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGGGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAACACTCTGCCGGTAACTGTTCGGTTTCATTTGCGCGTAAACGCCATTGACCGCGACCGTCATAACCACCAGTGCGACGCTTAACa < 1:541626/288‑1 (MQ=255) tCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAACACTCTGCCGGTAACTGTTCGGTTTCATTTGCGCGTAAACGCCATTGACCGCGACCGTCATAACCACCAGTGCGACGCTTAACAATCg > 1:360601/1‑288 (MQ=255) | TTTGTCGTACCAGTGCAGATGCACCAGCGGCAGTTTCAGCCAGTCATAATTCACATCGCTACCAATCAGATTGATCATCACCGACGGATTATTCACCACTGGTTGCGGTAACGGCAGATCGGTAATCGCCCGCAGATGCAGCTCAAACTGGCTGATGCTGGCACC‑GTTTTGTGTCCAGTGACCGCTGTTATGCACACGCGGTGCCAGTTCGTTGATCAACAGACCTTGCGGGGTGACAAAACACTCCATCGCCATCACGCCCACATAGCCCAGCTCCTGCATAATCGCCGACAGCATCTCTTCGGCTTGCGCCTGCTGCTGTGCGTTGGCCTGCGGAAAAGCGACGCTGGTGCGCAAAATACCGTCCTGATGCAGGTTATGCGTCAGCGGATAAAACACGGTGCTGCCATCAAAGCCGCGCGCGCCAACCAGCGACACTTCACCAGAGAAGTTAATGCCCTGCTCGACAATACATTCGCCGTAACACTCTGCCGGTAACTGTTCGGTTTCATTTGCGCGTAAACGCCATTGACCGCGACCGTCATAACCACCAGTGCGACGCTTAACAATCG > NC_000913/551674‑552245 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |