| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,154,407 | A→T | 9.8% | I271N (ATC→AAC) | yqhC ← | transcriptional activator of yqhD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,154,407 | 0 | A | T | 9.8% | 141.7 / 2.1 | 52 | I271N (ATC→AAC) | yqhC | transcriptional activator of yqhD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/20); new base T (2/4); total (28/24) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.97e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.46e-01 | |||||||||||
CTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGTATTTATTCTCAATCCGTTTCAGCACGCGGCTAATCAGACTGAAGTGAGTCTGGCGACTGACCAGCGCCAGTAACGCGCCGC > NC_000913/3154184‑3154632 | tctgttGGGGTTAATAAAAAAAAATACTTTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGGATTTAATTCCCCTGCATCTCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGatcat < 1:650118/224‑1 (MQ=255) tGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CCTGCCGCCATGGATGatcacc > 1:375421/1‑226 (MQ=255) aTTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCCCACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGCCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACTCGCCTCGCTGCTCCCCTGGCCTA‑CATCCCGTCATGGGTGTTCACCATCCCCGCCt > 2:208354/1‑227 (MQ=255) ttAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACCATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCtt < 1:208354/227‑1 (MQ=255) aCGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAAttcttc < 1:513458/228‑1 (MQ=255) gACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCCTAGCCGACGCGCATCGCTCCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCCCCTTATGCTAACGGAAATTCTTCAAATAc > 2:198253/1‑228 (MQ=255) ttttCCCCGTTCCCGGTTTCTGTGCCGGGAACCTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCCAACTTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCaa < 2:200757/228‑1 (MQ=255) tCCCCGTTCCCGGTTGCTTTCCCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCGCGGCTAAATTGCGATGCGCTGTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑GATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACgg < 1:36697/228‑1 (MQ=255) cccGGTTTCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTAc < 1:251871/228‑1 (MQ=255) cccGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTAc < 1:155050/228‑1 (MQ=255) gcatGTACCGGGAACGTATGTAATTCCCCGGCATCGCCCGCACACGTGCCGCATCGTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCGTAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGa < 1:436365/225‑1 (MQ=255) tACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGCCAGAc > 1:85125/1‑228 (MQ=255) tACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGGTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGCCAGAc > 1:696525/1‑228 (MQ=255) gTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCGTAGCCGACGCGCCTCGCTGCTGCGCTGGCATT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAAACGGTAATTCCTCAAATACTGCAACGGCGAGGAACTGGGCACAGACTTaaaaatgc > 2:436365/1‑224 (MQ=255) gTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTCCGCTGTCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCCTCCGCGCCTTTTGCAGTCGGTAATTCTTCAAATACTGCACCGGCGCGGGACCGGGGACAAACTTAAAAtcaa > 2:574542/1‑225 (MQ=255) cccTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGGCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGcc > 1:416972/1‑228 (MQ=255) cccTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGTGGGAACGcc > 1:68616/1‑228 (MQ=255) gccgcGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCCCACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATa < 1:462095/224‑1 (MQ=255) cccGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGACGGCCGCTACGc > 1:585406/1‑225 (MQ=255) cccGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGccc > 1:510145/1‑225 (MQ=255) cccGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGACTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGTTGATCATCATCCGCGCCTTATGCCGCCGGTAATTCTTCACATACTGCAACGGCCAGGTACTTGTCGCAGAATTAAAATTATGGGGGAACGCCGATaacctc > 2:167970/1‑222 (MQ=255) aTTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCCGACGGTAATTCTTCAAAt > 2:461447/1‑163 (MQ=255) aTTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCCACGCCGAGGTACTGGTGCCAGACTTCAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATCtt > 1:360774/1‑227 (MQ=255) ttCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATa < 1:461447/163‑1 (MQ=255) gCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTCAAAATTATGGGGGAACGCCGTTACGCCCATGTTGGCTTc > 1:217169/1‑227 (MQ=255) ccccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTg > 1:448230/1‑228 (MQ=255) gTCACACCGAAGTAACGTTTAAACCCGCGGCTAAAGTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCTTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACg < 1:697083/228‑1 (MQ=255) acacCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCCCGCCTTCTGCAGCCGGTACTTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACCGCCTTAAAATTATGGTGGAACGCCGACACGCCCATGTTGGCTTCTGCCCCAAGTGGCTCGagcccc > 2:410388/1‑223 (MQ=255) cgTAACGTTTAAACTCCGGGGTCAATGGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGTTGGCCTT‑CATGGCGGCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGtttt < 2:416972/227‑1 (MQ=255) tAACTTTTAAACCCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGAGGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCg < 2:375421/228‑1 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCgg < 1:167970/228‑1 (MQ=255) 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1:70939/1‑228 (MQ=255) tAAACTCACGGCTAAAGTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGtatt < 1:198253/228‑1 (MQ=255) aCGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGTTCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTa > 1:446679/1‑145 (MQ=255) aCGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATAAGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGATGGAACCTCAGGTTTTCGGGGTATTTTTtctc > 2:377224/1‑228 (MQ=255) cGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGTTCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTaa < 2:446679/145‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAACTTATGGGGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCACGTTTTCGGGGTATTTATTTTCAATCCGt > 2:12326/1‑228 (MQ=255) aTGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCCAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGTATTTTTTCTCAATCCGTTTCAGCa > 1:679466/1‑228 (MQ=255) aaggCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCAAGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATGCTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGTATTTATTCTCAATCCGTTTCAGCACGCGGCTaa < 1:410388/224‑1 (MQ=255) ctaCGCCCATCGCTGCTGGGCTGGCCGT‑CATGCCCTCATGGATGATCATCATCCGCGCCGTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATTCGCTCATGTTGGCCTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGTATTTATTCTCAATCCGTTTCAGCACGCGGCTAATCAGAc < 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cgcTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGTATTTATTCTCAATCCGTTTCAGCACGCGGCTAATCAGACTGAAGTGAGTCTGGCGAc > 1:385972/1‑228 (MQ=255) cTT‑TATGCCGTTAATGATGTTCATCAGCCGGGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATTCTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGGGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGTATTTATTCTCAATCCGTTTCAGCACGCGGCTAATCAGACTGAAGTGAGTCTGGCGACTGACCAg < 2:631689/228‑1 (MQ=255) tt‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGtttt < 2:402473/157‑1 (MQ=255) tt‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGtttt > 1:402473/1‑157 (MQ=255) cATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCgg < 1:685527/158‑1 (MQ=255) cATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGGTTTCgg > 2:685527/1‑158 (MQ=255) cGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGCCGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTCCTAGTGACAGACTTAAACTTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTTCCGCCAGTTGCTCGACGCTCCAGCTTTCGGTGTATTTATTCTCCACCCGGTTCAGCACTCGCCTAATCCGACTTAAGTGATTCTTGCGACGTACCACTGCCAGt > 2:294646/1‑227 (MQ=255) tGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGTATTTATTCTCAATCCGTTTCAGCACGCGGCTAATCAGACTGAAGTGAGTCTGGCGACTGACCAGCGCCAGTAAcgcg > 1:527673/1‑228 (MQ=255) gatCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTAAGGTTTTCGGTGTATTTATTCTCAATCCGTTTCAGCACGCGGCTAATCAGACTGAAGTGAGTCGTGCGACTAACCAGCGCCAGTAACGccccgc > 1:43451/1‑227 (MQ=255) | CTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTT‑CATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGTATTTATTCTCAATCCGTTTCAGCACGCGGCTAATCAGACTGAAGTGAGTCTGGCGACTGACCAGCGCCAGTAACGCGCCGC > NC_000913/3154184‑3154632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |