| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,293,032 | IS1 (–) +8 bp | intergenic (‑110/‑488) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 53 (1.380) | 46/284 | 0.0 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1293039 | 0 (0.000) | intergenic (‑117/‑488) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1293032 = | 0 (0.000) | 44 (1.150) | 36/284 | 0.1 | 100% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
ATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGC > NC_000913/1292891‑1293172 | cgctgatgtccggcgctgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacctt > 2:447851‑M1/142‑143 (MQ=255)aTGTTGTTCATAATTTTAATTGCTTCGCTCATTGTAGTAAACACAAACTTAAATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAAGAATAGAGCCTGAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAtttt < 1:114716/143‑1 (MQ=255)aTGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTAAgttt > 2:637941/1‑143 (MQ=255) ctgatttgcggcggtgctgttgctgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactatttctgtaagttggcagcatcaccTtgt > 2:359656‑M1/140‑143 (MQ=255) ctgatgtgcggcggtgcttttgccgttacgctgcaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccaatggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTtgt > 1:170839‑M1/140‑143 (MQ=255) ttCAGAATTTTTAGTTGTTCGCTTATTGTAGTAATCTCAAACATATAATGGGGTGGTATGGGGAGGTAATAATAGAGCCGTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccg < 1:34940/143‑1 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTCTTTTGTGCCGgg < 1:498025‑M2/143‑3 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGACGggt < 2:103801‑M2/143‑4 (MQ=255) gAATTTTAAGTGCTTCGCTCAGTGTAGTAATCTCAAACGTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTTTGCCGggta < 1:153532‑M2/143‑5 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGATCTTTATTTTGTGCCGggtaa < 1:410380‑M2/143‑6 (MQ=255) cggtgcttttgccgttaagcaacacgccgtcagtagatgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCaataa > 1:445388‑M1/129‑143 (MQ=255) tttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatga > 1:67708‑M2/1‑135 (MQ=255) ttactttcttcgctcATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTTGTTTGTTGAAGTAATAATAGAGCCTTACATTCAGTTGTGCAATAGCTATAAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgac > 2:85686‑M2/8‑134 (MQ=255) ttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgac < 1:677579‑M2/143‑10 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggcgcacctcaaaaacaccctcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacaTTATGCAGCCAAAAAATATCt < 1:356204‑M1/21‑1 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCt < 1:356134‑M1/21‑1 (MQ=255) gtgccggtgcgcacagccgcgtcagtagctgaagaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactagatcagtaagttggcagcatcaccTTGTTCCGCCAATAAATATCttt > 2:177793‑M1/121‑143 (MQ=255) cTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCATTATCCAGTAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactacaact < 1:163425‑M2/143‑17 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaaatt < 2:519508‑M2/143‑18 (MQ=255) gccgtgacgctccaccccgtcagtagctgaacatgaggtacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTc > 2:509592‑M1/119‑143 (MQ=255) gttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaacaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcatcatcaccTTGTAACACCAAAAAAaatcttttaaaa < 1:505427‑M1/28‑5 (MQ=255) acgcaccaccccgtcagtagctgaacagtagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaaaa > 2:266509‑M1/113‑143 (MQ=255) gcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccgtcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAAtt < 1:630478‑M1/33‑1 (MQ=255) gcaccaccccgcgagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAAtt > 2:260706‑M1/111‑143 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAg < 2:569091‑M1/35‑1 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcaccacaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTCCCCCCAATCAATATCTcttcataacctcag < 2:349450‑M1/35‑7 (MQ=255) taATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 1:355185‑M2/1‑112 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTTAGGTAATAATATATCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt > 1:67675‑M2/1‑107 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 1:697516‑M2/143‑37 (MQ=255) cagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTCTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGa > 2:724623‑M1/99‑143 (MQ=255) agcttATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcag > 2:327511‑M2/3‑104 (MQ=255) tgatattgGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGATTTTTAAATTTAGTTGTGAAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAGGTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata > 1:396854‑M2/3‑101 (MQ=255) ctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCAGCCAAAAAATATATTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGc < 1:143836‑M1/51‑1 (MQ=255) tgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCa < 1:593328‑M1/52‑1 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCat < 1:433609‑M1/53‑1 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTATGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCatat < 1:55883‑M1/55‑1 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACACGGCAaata < 1:506327‑M1/56‑1 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGcc < 2:275005‑M1/59‑1 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGAATATAGcc > 2:227356‑M1/85‑143 (MQ=255) tggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatga > 2:167954‑M2/1‑90 (MQ=255) ggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTTAGTTGTGCAATTGGTAGGAGTGTAAGGAATTCAAAATTGTGCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgac > 1:609313‑M2/1‑89 (MQ=255) gtTTGTTGATGTAATAATAGTGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgact > 1:618938‑M2/1‑88 (MQ=255) ttttgagGTAATAATAGAGCCTTAATTTCAGTTTTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttg > 2:498025‑M2/3‑85 (MQ=255) tgttgAGGTAATGATAGCGCTTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttg > 2:340109‑M2/1‑85 (MQ=255) gttgACGTAATAATAAAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttatatgttcagataatgcccgatgactttgt > 2:291249‑M2/1‑84 (MQ=255) ttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc < 1:423958‑M2/143‑61 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCAGATAGCCCTATTTaca < 2:722832‑M1/68‑1 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTCCCGCCCACACATATCTTTTCATAAAATTCGCCATAAAAGACGCAGCATATAGCCCTCTTTaca < 1:198123‑M1/68‑1 (MQ=255) tgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtcagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac < 1:620965‑M1/69‑1 (MQ=255) tgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTGGGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac > 1:578769‑M1/75‑143 (MQ=255) gAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAACTTGTTCTTTATTTTGTGCCAggtaataactccaaataatagatagagttttatgttaagataataccggatgactttgtcat < 1:624234‑M2/143‑63 (MQ=255) gAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgacgccaacatattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat < 1:162179‑M2/143‑63 (MQ=255) aGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgctagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatt < 1:50724‑M2/143‑64 (MQ=255) tagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGTCAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCga > 2:255302‑M1/72‑143 (MQ=255) ggTAATAATATAGTCTTATATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc > 2:732529‑M2/1‑79 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgat > 1:571347‑M1/71‑143 (MQ=255) taataaTAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAACGTAAGGAATTCAAAATTGCTCTTTAATTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgacgactttgccctgcag < 2:126580‑M2/143‑67 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTTTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTACCCAGAAAAGACGCCGCATATACCCCTATTTACaccgaaga < 1:149536‑M1/75‑4 (MQ=255) ataataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagct > 2:677579‑M2/1‑75 (MQ=255) aacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaatttagcaacatcaccATGTGCAGCAAATAAATATATTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgatgat < 1:88930‑M1/76‑1 (MQ=255) ataGAGACCAAAACCCAGTTGTGCCATAGCCAGGAATGTAACGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttatcgataccgttttacgttccgctcatgcccgatgactttgtcatgcagctcca > 1:537911‑M2/1‑72 (MQ=255) gCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatccagctccatcgac < 2:263586‑M2/143‑77 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttcttgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcgtgccgctccacccatt < 2:358125‑M2/143‑78 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttgtatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccggtt < 1:659445‑M2/143‑78 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt > 2:163425‑M2/1‑64 (MQ=255) tAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGagtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaaccattttg < 2:690979‑M2/143‑81 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGGGGgaaaaaaactctgtcttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatagctttgtcatgcagctccaccgattataccaa < 2:151314‑M2/143‑85 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaa < 1:260877‑M1/96‑1 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCACAATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaa < 1:174819‑M1/96‑1 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAAACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGAGAGGTTaa < 2:176999‑M1/96‑1 (MQ=255) ttttGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATACAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgacttcaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaca > 2:587287‑M2/1‑54 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGATaaa < 2:256747‑M1/97‑1 (MQ=255) gtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgctcgaaatcgttgacattcagctccaccgattttgagaacgacagc < 1:689782‑M2/143‑92 (MQ=255) gCAAAAGCCAGTAATGTAAGGAATTCGAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcga > 2:426152‑M2/1‑50 (MQ=255) caccatcatacactaagtcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCt > 2:336048‑M1/40‑143 (MQ=255) aTAGCCAGGAATTTAAGTAATTCAATATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgacaccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt > 1:609343‑M2/1‑47 (MQ=255) aTAGCCAGGAATGGAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt > 1:721554‑M2/1‑47 (MQ=255) tAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTTTTCTTTATTTTTATCCGtgtaatgactccaacttattgatagtgtttgatgtgcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactta > 1:689413‑M2/1‑46 (MQ=255) aGCCAGGAAGGTAATGAATTCAAAGTTGTTCTTTATTTTGTGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc > 2:240099‑M2/1‑45 (MQ=255) catacactaagtcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTCAAACTTCCTGATTCa < 2:248874‑M1/110‑1 (MQ=255) tacactaaatctgtaagttggcagcatcatcTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATg > 1:364558‑M1/32‑143 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCCGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTAAAACCGATGATTAAGCAGCACATGAGGTTAAAACTTCCTGAGTCATGt < 1:344123‑M1/113‑1 (MQ=255) taaagcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAAAAGGAATATAGCACTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGGTAAAAATTCCTGATTCATGTaaca < 2:225619‑M1/117‑1 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGTTCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggt > 2:330625‑M2/1‑27 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaccttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatacaactccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggt < 1:172047‑M2/143‑117 (MQ=255) aagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATggg < 2:109682‑M1/126‑1 (MQ=255) aaaaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgtcaggtgct > 2:423958‑M2/1‑24 (MQ=255) aaaaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgct < 1:513068‑M2/143‑120 (MQ=255) aaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgc < 2:43158‑M2/143‑122 (MQ=255) tGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattcatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctgcaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctc > 2:697516‑M2/1‑19 (MQ=255) gTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctca > 1:103801‑M2/1‑18 (MQ=255) cagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCTCTATTTACACCGCTGCTTTCGCAGCATGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACACTTTATGGGGAgatga < 2:504541‑M1/133‑3 (MQ=255) gcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATc > 2:593328‑M1/9‑143 (MQ=255) tttATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttattttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagatt < 1:498748‑M2/143‑130 (MQ=255) tttATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgaatttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccgggtgctgcctcagatt < 2:101908‑M2/143‑130 (MQ=255) tttATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtgttatgttcagataatgcccgatgactttgtcaagcagctacaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcgaggtgctgcctgagaat < 1:385124‑M2/143‑130 (MQ=255) tcagcttGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACGCCGATGATTTCGCAGAACGTGCGGTTAAAACTTCCTGATTCAGGTCACAGTTTATTGGAGGAGTCTCGTa > 2:381964/6‑143 (MQ=255) caccTTTTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAg > 2:356134‑M1/5‑143 (MQ=255) caccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAg > 2:356204‑M1/5‑143 (MQ=255) ttttGGGCCGggtaatgactccaacttatggatagtgttttatgtgcagataaggcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcagg > 1:263586‑M2/1‑10 (MQ=255) | ATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGC > NC_000913/1292891‑1293172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |