| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | intergenic (+254/‑485) | ychE → / → oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499–1300693 | 1300697 | 5–1199 | 84 [0] | [0] 85 | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 80 (1.190) | 65/276 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑1684) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+1453/‑484) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
AAATTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1299356‑1299498‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACG > NC_000913/1300698‑1300838 AAATTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACCGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCTTTTGGTAGAGGAAAGTA‑CTAA > 2:244245/1‑143 TTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTTTGTTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTGTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATA < 1:454641/143‑1 TTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTATCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATTATAATCCTCGGCTTGCTCAAGAATAATTGAAATGATATTCTTAATTACACTGCCCTTGGAAGAGGAAAGT‑‑CTAAAata > 2:65870/1‑140 CAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATA < 2:466250/143‑1 AGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCTTCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAA < 2:341512/143‑1 AGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATACTCATGAGCTTCCGCCAGGATCATTGACATGATATTATTCAGTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAg > 2:441885/1‑142 AGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAA < 1:782563/143‑1 TTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATC > 2:221134/1‑143 TAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCA < 2:777043/143‑1 TTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGACATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATT < 1:716756/143‑1 TTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATT < 1:826977/143‑1 TTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCGCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATT < 2:285798/143‑1 TAAGGATTTGCTTAACTGCTTCTGCTCACCATCATGTTGTTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTACTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCATTTGGTAGAGGAAAGGG‑ATAAATAATAATCAATTGTT > 2:395697/1‑143 CCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGACTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGACTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATATTAATCATTTGTTAAATTATTG > 2:228832/1‑143 CTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGT < 1:221134/143‑1 TGCTTCTCCTCACCGTCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTT < 2:818890/143‑1 CTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCA < 1:850909/143‑1 TTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAACTGTTAAATTATTGTGCATTTCAC > 2:576201/1‑143 CTCACGATCCTGTTATTTTCGCCACCTCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTG < 1:567422/143‑1 CTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATACTCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTG > 2:568196/1‑143 CTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTG > 2:480973/1‑143 GTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATC > 1:421353/1‑143 GTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATC < 2:732068/143‑1 TTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCA > 1:1142296/1‑143 TTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTAACTACTGGAACTGTAATCA > 2:541345/1‑143 TTTTCGCCACATCATAATCCTGAGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCAACTGCCTTTGGTATAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACT‑GAACTGTAATCAGAAA < 2:1017365/143‑1 TTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAA > 1:1006126/1‑143 TTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAA < 2:388349/143‑1 TTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAA > 2:328165/1‑143 TTCGCCAAATCATAATCCTGGTCGTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGTAACTGTAATCAGAAAA < 2:220570/143‑1 TCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAG > 1:956895/1‑143 GCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGAT < 1:545489/143‑1 gCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATA < 2:389611/142‑1 CCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATA < 2:1063178/143‑1 CATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGAC < 1:217939/143‑1 TCATAATCCTGGGCCTGCTAAAGAATTATTTAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGACAAACTTC‑CTAAATCACAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACAT < 2:82121/143‑1 cgCCTGGGCGTGCTGAAGAAGAAGTGAGATGATATGATGAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGGTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTA < 1:194850/141‑1 CTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCC < 1:115241/143‑1 CTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCC < 2:662356/143‑1 GGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAA > 1:1020237/1‑143 GGCCTGCGGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAAT < 2:640481/143‑1 TGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATT > 2:647445/1‑143 GAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTACACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATACACATGCTTAGCCAATCTCTATTT > 2:730148/1‑143 GAAGAATAATTGAAATGATATTATTAAGTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTT < 2:330208/143‑1 GAATAATTGAAATGATTTTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGAT < 2:488909/143‑1 AATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATT > 1:342972/1‑143 ctggAATTATATGACTAATCCCCCTGCCCGTGGTAGAGGCAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGTTAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATT < 1:646916/139‑1 AAATGATCTTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAA < 2:137753/143‑1 AATTATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAA < 2:169257/143‑1 AATGATTTTATTAATTCCACTGCCTTTGTTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAA < 1:323106/143‑1 AATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAGTAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATCTGATTGAATTGAAA > 1:143620/1‑143 TGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATGTCTATTAGATTAAAGTGAACGA > 2:1058580/1‑143 TGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGA < 1:488987/143‑1 GATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGG‑GAGTGTCAAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGAAACTGTAAGCAGAAAAGATATACATGCTTATCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGAT > 2:1091125/1‑143 ATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGCATTGAACGATG > 1:615213/1‑143 TATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGT < 1:172458/143‑1 TTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATGGAAAGATGTTT > 1:650565/1‑143 ATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGACAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTGAATTACCAACAAATTAACTACTTGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGT > 2:888369/1‑143 ATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAAATATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGATTAGCCAATCTCTATTTAATTGAATTGAAAGATGCTTGT > 2:1193126/1‑143 TTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATTAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAGGATGTTTGTT > 2:686228/1‑143 TTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAGTTCACTACTGGAACTGTAATAAGAAAAGATAGAAATGCTTAGCCAATCCCTATTTGATTGAATTGAAAGAGGTTTGTT > 2:70906/1‑143 AATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAA < 1:324695/143‑1 ATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAG < 1:480973/143‑1 ATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAAATAAAAGATGATTGTTAAG > 2:164254/1‑143 TCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGac > 2:567280/1‑141 CACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCAT < 1:69736/143‑1 ACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATG < 1:835628/143‑1 ACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATG > 2:234984/1‑143 CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGG < 2:1020237/143‑1 gcgTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCGGAAAAGATAGACATGCTTGGCCGATCTCTATTTGATGGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGAT < 1:1189814/140‑1 GCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGAT < 2:905768/143‑1 CCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAACAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATG > 1:577682/1‑143 CCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAACGATGTTTGTTAAGGCATGGCTG > 2:1121654/1‑143 GGTAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGC < 1:740660/143‑1 TAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTA > 1:589625/1‑143 TAGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGACAATCTGTATTTGATTGAATTGAGAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGAGAGCTA > 2:1047843/1‑143 AGAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTAT < 1:805472/143‑1 GAGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATA > 2:848225/1‑143 AGGAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAG > 2:1112254/1‑143 GAAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGAT > 1:793927/1‑143 AAAGTG‑CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATT > 1:190868/1‑143 ggccAAAGAATAATCAATTGTTAAATTATTCTGCACTTCACTACTGGAACTTTAATCCGAGAAGTTGGACCTGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGA < 2:442141/139‑1 TAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATAC > 1:115368/1‑143 AAATAATAATGGATTGTTAAAGTATGGTGGATTTGACTAGTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACG < 2:970216/143‑1 AAATTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1299356‑1299498‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACG > NC_000913/1300698‑1300838 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |