| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,049,991 | Δ12 bp | noncoding (93‑104/109 nt) | spf → | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4049991 | 4050002 | 12 | 60 [0] | [0] 60 | spf | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4049990 | 0 (0.000) | 58 (0.850) | 45/282 | 0.5 | 100% | noncoding (92/109 nt) | spf | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
| ? | NC_000913 | 4050003 = | NA (NA) | noncoding (105/109 nt) | spf | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent | |||||
TTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAA > NC_000913/4049850‑4050132 | ttACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATtt > 2:325467‑M1/1‑141 (MQ=255) tACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTTGCTGAATATTTTAGCCTCCCCAGTCCATAATttt > 1:433991‑M1/1‑140 (MQ=255) cAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTATTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATtttta > 1:1242654‑M1/1‑138 (MQ=255) aaaaaGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCCGTCAGTAATttttat > 2:397078‑M1/1‑137 (MQ=255) aaaaaGTACTTGCTCAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCATAGAGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGTCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATttttat < 2:33708‑M1/143‑7 (MQ=255) aaaaGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATttttatt < 1:826152‑M1/143‑8 (MQ=255) aaaaGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTAACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCACCAGTGAGTAATttgtcat > 2:995939‑M1/1‑136 (MQ=255) aaGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATttttattgg < 1:837794‑M1/143‑10 (MQ=255) tCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGGAATttttattgggcgaaagg > 1:323614‑M1/1‑126 (MQ=255) 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tttttagtgggcgaaagaaaagatccttaatgcctgatgcgctatgtttatcaggccaacggtagaagtgtaatctattgaatttacgggccggatacgccacatccggcacaagcattaaggcaagaaaattattcgccgtc < 1:397078‑M1/143‑143 (MQ=255) | TTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAA > NC_000913/4049850‑4050132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |