| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1226035 | 90 (1.270) | 3 (0.040) | 3/434 | NT | 2.9% | coding (46/696 nt) | minC | inhibitor of FtsZ ring polymerization |
| ? | NC_000913 | = 1226307 | 110 (1.570) | intergenic (‑227/‑293) | minC/ycgJ | inhibitor of FtsZ ring polymerization/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGCCAGGCTTTCTTAACTTTCCATTTTTTGCGGCATCATTAAAGAACAGATACCCGTTATCTTAATATCCGCCACAGAATTGCTCTATCATAGAAACCGCAGAAGACGTCTGATACTTCTGTCAGGTCATCGTAACTCGTCCAGGTCAGCGGTTTTGATTA > NC_000913/1226073‑1226543 | tttGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCCTTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTcc > 2:757556/1‑238 (MQ=255) tGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCAGCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCa < 1:752682/239‑1 (MQ=255) aCTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCATTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTAACCTTCCTTTTTCCGCCCCCCAATCTTGaac > 2:536292/1‑236 (MQ=255) atccaTTGGCTATTTATCATCGCCAGCGCGCTATTGTGGTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAAGCAAGTCATCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGGCTTTTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCTTAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCACCCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACTCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGc < 2:787458/235‑1 (MQ=255) aTTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTATTCGTGACAGcctt > 1:673593/1‑235 (MQ=255) ttAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATCAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGAACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTCCCTTTTTCCGAACCCTAATCGTGAcgggctct > 2:504120/1‑231 (MQ=255) ttAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTTCGCTTCCTTTTTCCCCACCCTAATCGTGACAGCAtct > 2:688202/1‑238 (MQ=255) gCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGATTAAAAAATACCCTTGTCAATCAAACCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTTACAGAATCCCCAg > 2:606328/1‑239 (MQ=255) aacGCCAGCGCGCGATTATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTaa < 1:326293/237‑1 (MQ=255) cagctcttgattatGTTCTGAATGCTTTAAGGCAGTTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTGATTCAGAGTAAAATGCTATTCTGTGATAAAGATCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTTCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATc < 2:287721/231‑1 (MQ=255) cAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATc < 1:90194/239‑1 (MQ=255) cAGCGCGAGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGGCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATc < 1:693246/239‑1 (MQ=255) gcgcgATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCa < 1:656098/237‑1 (MQ=255) ttCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATAATGAGGCAAGTCCCCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGGCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAg < 1:896685/239‑1 (MQ=255) aaGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCC‑AATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGAATTGAGGCAAGTGAAtt > 1:738537/1‑239 (MQ=255) tataAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTAttttt > 1:656361/1‑238 (MQ=255) taATGCATGTTTTTTTCTGGATTTTATTGAGGCAAGTCCCCCTTCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCTTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTca < 2:519911/239‑1 (MQ=255) ttttttattttGGTTTATTTTTAGGCAATTCACCCCCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATGCTGGGATAAATTGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTTGCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACATCATCTCCAGGCCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGTATTTTTTCACCACGcc < 2:194309/229‑1 (MQ=255) tGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGAATTTTTTcaccaccca > 2:718028/1‑236 (MQ=255) tGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCAGACCTGTTTAAATATCCAGTATTGAGGCAAGTGAATTTTTTCACCACTcc > 1:124448/1‑239 (MQ=255) gTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTTTTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATATACGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCATTGTCAATCAATCCATTGCCGCCGTATTCTTGATTGGTTTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATTTCCAGACCTGTTTTAATATCCAGTATCGCGGCAAGGTCACTTTTTcaccaaccaa > 1:59173/1‑234 (MQ=255) gTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCATTGCCGTCGTACTTTTGATTGTTCTTATTTACGCTTCCTTTTTCCGCACCCTAATCGTGACAGCATCTCCATACCTGTTTAAATATCCAGTATTAGGGCAAGTGAAttttttacacaagcca > 2:218074/1‑229 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |