New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3169154 | 65 (0.780) | 4 (0.050) | 3/492 | NT | 5.5% | coding (78/483 nt) | ygiV | transcriptional repressor for mcbR biofilm gene |
? | NC_000913 | = 3169350 | 74 (0.910) | coding (327/393 nt) | ygiW | hydrogen peroxide and cadmium resistance periplasmic protein; stress‑induced OB‑fold protein |
TGCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCACAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACGCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACAGAATTCCAGTCTTTATCGACTTCACCCTGAATCTCAACCGTATCTTTCGGCGTCACCGTCACGCCGTTCCAGCGTTTGTGGTCGATATCAACATTGATAGTACCGCTGGCATC > NC_000913/3168880‑3169439 | tgCCCCATACCGTGTGTGAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGCGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACAGGATAAATTTGCCCACGCTGTCGTTGAGACATTGCGGGCTACAGCGGTGCg > 2:538517/1‑288 (MQ=255) gtgtgtTAAATGTCGTCCAGCTGGCCAACGTGGCTGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTTACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCTGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGGAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCca < 2:429384/289‑1 (MQ=255) tgtgtgAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACCTGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGtgaagtcgatacagcctggaat > 1:349393‑M1/1‑263 (MQ=255) tgtgtgAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCca > 2:312164/1‑288 (MQ=255) tgtgtgAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCca > 2:372523/1‑288 (MQ=255) tgtgtgAAATATCGTCCAGCTCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGAGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGTGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCcac > 1:284889/1‑289 (MQ=255) gggggAAATATCGTCCAGCGCGCCAACGTGGCGGGCCACGGCATAACGTCCACCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCAGAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCcac < 2:200/284‑1 (MQ=255) 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aCCGGTAAGTTCACCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCAGGCTTTGGTTAACAGGCGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTAGCCCCGCGGTAGTTGAGCAATTCCGGGCTACAGCGGTTCGTCAACCTCTCCACAGGTCTTGATGGGAAATCGATACTGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCttt > 2:758895/1‑289 (MQ=255) aCCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACa > 1:643243/1‑204 (MQ=255) aCCATTGCTCACACCATAACGATTATCGGGAATCGGTTCGCTAACGCTGCCGCAGATATCAAAGCGAAACGCTTCCGGTGCGGTGGTGGCAGGGTCGTCCCAGGCGACGCCAAAAGTCTGGCTTTGGTTAACAGGAGAAAGCCCCGTCTCTTTACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACa < 2:643243/204‑1 (MQ=255) 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ttACGCCACATGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCACAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACGCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACAGAATTCCAGTCTTTATCGACTTCACCCTGAATCTCAACCGTATCTTTCGGCGTCACCGTCACGCCGtt > 1:462814/1‑288 (MQ=255) caTGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCACAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACGCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACAGAATTCCAGTCTTTATCGACTTCACCCTGAATCTCAACCGTATCTTTCGGCGTCACCGTCACGCCGTTCCAGCGttt > 1:99163/1‑289 (MQ=255) aTGATAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCACAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACGCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACa > 2:732564/1‑211 (MQ=255) 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tAAATTTCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCACAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACGCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACAGAATTCCAGTCTTTATCGACTTCACCCTGAATCTCAACCGTATCTTTCGGCGTCACCGTCACGCCGTTCCAGCGTTTGTGGt < 2:462814/289‑1 (MQ=255) ttCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCACAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACGCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACAGAATTCCAGTCTTTATCGACTTCACCCTGAATCTCAACCGTATCTTTCGGCGTCACCGTCACGCCGTTCCAGCGTTTGTGGTCGata < 2:664669/289‑1 (MQ=255) tCGCCACGCTGTAGTTGAGCAATTCAGGGCTACAGCGGTGCGGCAACATCGCCACAGGTATTGATGGGAAATCGATAATGTTTACATCCAGTGTCAGGTTTGTCATTTTGCCTCCCTGCGAAATTATTCCCGGGAACGCGTCCCGGGAGCGGTAACAATTACGGATTTACTTTGCGGATCTGTTTGACGTCAATTTCAACAGAATTCCAGTCTTTATCGACTTCACCCTGAATCTCAACCGTATCTTTCGGCGTCACCGTCACGCCGTTCCAGCGTTTGTGGTCGatat < 1:312164/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |