| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 526,982 | A→T | 6.5% | N1241I (AAT→ATT) | rhsD → | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 526,982 | 0 | A | T | 6.5% | 218.1 / 4.5 | 61 | N1241I (AAT→ATT) | rhsD | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (23/34); new base T (2/2); total (25/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
CCGGAATACACACCGGCGCGAAAAGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGATACTAATGGAAAA > NC_000913/526696‑527229 | ccGGAATACACACCGGCGCGAAAAGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGACTGGGGCAACCAGCTTAATGAGGACAACCCGCATCATGTGTATCAGCCCTACCGTCTGCCCGGGCCGCCGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAA‑CGTCACCGGTACTACGATCCGTTCCAGGGTCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGTTTGCAAGGGGGATGGAAttt > 2:192269/1‑289 (MQ=255) cGGAAGACACGCCTGCGCGAAAAGCTCATCTTTATCAGTGCGAGCACCGGGGACTTCCGCGGGGGCTTATCAGCTAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGaagt < 2:618859/288‑3 (MQ=17) acacCGGCGCGAAAAGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCGTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGt < 1:627906/289‑1 (MQ=255) cacCGGCGCGAAAAGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTa > 1:731799/1‑289 (MQ=255) 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aGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGc > 1:64243/1‑103 (MQ=255) aGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGc < 2:64243/103‑1 (MQ=255) aGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACg < 2:7416/212‑1 (MQ=255) aGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACg > 1:7416/1‑212 (MQ=255) gACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGaa > 1:147861/1‑240 (MQ=255) gACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGaa < 2:147861/240‑1 (MQ=255) | CCGGAATACACACCGGCGCGAAAAGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGATACTAATGGAAAA > NC_000913/526696‑527229 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |