| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,196,305 | C→T | R395C (CGT→TGT) | icd → | isocitrate dehydrogenase; e14 prophage attachment site; tellurite reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,196,305 | 0 | C | T | 97.9% | 270.0 / NA | 94 | R395C (CGT→TGT) | icd | isocitrate dehydrogenase; e14 prophage attachment site; tellurite reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base T (57/34); total (60/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTT > NC_000913/1196167‑1196444 | gACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCt > 1:161233/1‑143 (MQ=255)gACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCt > 1:701436/1‑143 (MQ=255) cAAAGGAAGTCCGGGCTCTATTAGTCGCGTCGCTGGGAGGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTga < 2:896095/143‑1 (MQ=21) aaaGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTgat > 1:413531/1‑143 (MQ=255) aaaGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCGGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTgat < 2:572133/143‑1 (MQ=255) aaaGCACATCCTGGCTATATTATTCCCGCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTgat < 1:214282/143‑1 (MQ=25) aGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAGGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTgatgg > 1:380659/1‑143 (MQ=255) gTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCGCATGGGTTGGACCCAAGCGGCTTATTCCAGTGTTAGAGGTATGGAAGGGGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGCGCGCCTcatgga > 2:1028923/1‑143 (MQ=255) gTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTGAAGGTATGGAGGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCCACGACTTCGAGTGTATgatgga > 2:1133821/1‑143 (MQ=255) gTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTCTGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTAGAGAGTCTgatgga > 1:1080014/1‑143 (MQ=255) aaTCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGatggatgg < 1:900636/143‑1 (MQ=255) gccTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGgcg < 1:867718/142‑1 (MQ=255) cTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGAATTCGAGTGTCGGGTGGAGGGCGCt > 1:1201607/1‑143 (MQ=25) ggCTCTTTTGTGCTGTCCGGTGAGATGATGCTGCGCCACATGGTTTGGACCGAGGCGGCTGACTTAATTGTTAAGGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTaa < 2:411431/143‑1 (MQ=18) ctctATTGTTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAAc < 1:1248560/143‑1 (MQ=255) ctctATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGACGCGGCTGACTTCATTGTTCAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGCTGGAAGGCGCTAAAc > 2:1223593/1‑143 (MQ=21) attattCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGGTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTACGAGTGTCTGATGGATGGCGCTACActgca > 2:496964/1‑142 (MQ=255) ttattCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAActgctg > 1:539851/1‑143 (MQ=255) attCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGaa < 2:1249874/143‑1 (MQ=255) ttCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTACTTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGaaa > 2:552573/1‑143 (MQ=255) ttCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGaaa > 1:495560/1‑143 (MQ=255) tctcCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGAACGGCCCGGAGCGGCGGGCGGAGTTGGTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGACATGt > 1:615102/1‑143 (MQ=21) tGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAACGGCTGACACTAATGCTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGt > 2:1415542/1‑143 (MQ=18) agaTGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGttt < 1:952740/143‑1 (MQ=255) gatgatGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTg < 1:64987/143‑1 (MQ=255) atgatgCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTgg < 1:1141351/143‑1 (MQ=255) tgctgcGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATCGATGGCGCTAAACTGCGGAAATGTTCACAGCTTGGTGAc > 2:1218114/1‑143 (MQ=18) gctgcGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGCAATGTTCAGAGTTTGGTGAcg > 2:202718/1‑143 (MQ=255) gctgcGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGACATGTTCAGAGTTTGGTGagg > 2:416577/1‑141 (MQ=255) ctgcGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAcgc < 1:1035080/143‑1 (MQ=255) ctgcGCCACATGGGTCGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAcgc < 1:861740/143‑1 (MQ=255) tgcGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGTGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAcgcg > 1:823432/1‑143 (MQ=255) tgcGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAcgcg > 2:1430336/1‑143 (MQ=255) ccACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAAGTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGatca < 1:960543/143‑1 (MQ=255) ccACACGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGatca < 1:1145195/143‑1 (MQ=255) cacaTGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGatcat < 2:836671/143‑1 (MQ=255) cacaTGGGTTGGACCGAAGCGCCTGACTTAATTGTTCAAGATATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACCGCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGCTAGGTGACGCCatcct > 2:711364/1‑141 (MQ=255) acaTGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGGGTTTGGTGACGCGatcagc > 1:1158028/1‑141 (MQ=255) ggggTGGAGCGGAGCGGCTGGCTTAATGGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGaaa < 2:1083693/143‑1 (MQ=18) ttGGACCGAAGCGGCTGACTTACTCGATAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGCGAACCGTAACCCATGACGTCGAGTGTCTGCTGGATGGCGCTAAACTGCTGAGATGTGCAGAGGTTGGTGACGCCGTCACCGagacca > 2:1035467/1‑138 (MQ=18) ttGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACa > 1:188018/1‑143 (MQ=255) ttGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGGTTTGTGACGCGATCATCGAAGACa > 2:795334/1‑143 (MQ=255) tgcgccGAGGCGGCTGACTTAATTGTTGAAGCTATGGAAGGCGCAATCAACCCGAAAACCGCAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAACCAt < 1:403094/139‑1 (MQ=17) tGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGACGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGCGGGCGCTAAACTGCTGACATGCTCAGCGTCTGGGGACGCGGTCATCGCAAAGAt > 2:438284/1‑143 (MQ=255) gagcGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAGAGGTATGGAAGGCGCAATGAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGt < 2:981641/140‑1 (MQ=255) aCCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGACAACATGTa > 1:177445/1‑143 (MQ=255) aCCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGGCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGtc > 2:1173522/1‑142 (MQ=255) ccGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTaa > 2:66470/1‑143 (MQ=255) gaggCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATg < 2:380659/140‑1 (MQ=255) caagtgtcTGACTTAATTGTTAAAGGTATGTAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGACTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATg < 2:531488/136‑1 (MQ=17) gCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACAGGTAATGCCGTAg > 2:35981/1‑143 (MQ=255) gCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTACGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAg > 2:911067/1‑143 (MQ=255) cTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAATCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGt > 2:758699/1‑143 (MQ=255) tGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGtt > 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ttAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGGTGGtt > 1:1078803/1‑143 (MQ=255) ttGTTAAAGGTATGTAAGGCGCAATCCACGCGAAGACCGTAACCTATGACTTCGTGTGTCTGATGGAGGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAAt < 2:1302367/143‑1 (MQ=17) ttGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAGCCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAAt < 2:126880/143‑1 (MQ=255) ttGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGGAAACACGTAATGCCGTAGTTTGTTACAt > 2:379615/1‑143 (MQ=255) tGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAAtt > 2:174233/1‑143 (MQ=255) ttAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTTGTTTGTTCAAtttt > 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tGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTACGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGa < 1:911067/143‑1 (MQ=255) cggAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGa < 2:613625/142‑1 (MQ=255) gAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATTACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGACAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGc > 2:1267309/1‑143 (MQ=255) aaGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTAATGCATTCGTCAGACAATCAGAAGGCGGTCTTCGAAATCATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCg < 1:672687/143‑1 (MQ=255) ggagcAATCAACGCGATGCCCGTAACCGATGCCTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGTGGTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTa < 2:691900/140‑1 (MQ=21) cgcAATCAACGCGAAAACCGTAACCCATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAAc < 1:1239092/143‑1 (MQ=255) gcAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACg > 1:1274825/1‑143 (MQ=255) gcAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTAATGGATGGCGCTAAACCGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATAAACAAAAACATGGAATGACGACCTTTTTGAAATTTATTAAGGGGACCCTAACg > 2:1085513/1‑143 (MQ=18) tCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCTCAGTTTGGTGACGCGCTCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTCGTTCAGTTTATTAACGGGGGCGTAACGCTcc > 1:1091733/1‑143 (MQ=255) cAACGCGACAGCCGTAACCTATGATTTCGGGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTCTGGTGACGCTATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTccc < 2:579541/143‑1 (MQ=25) aaCGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTTACGCTCCCg < 1:851413/143‑1 (MQ=255) aCGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTGCAGAGGTGGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTGTGTTAAATGTATTAACGGGAGGGTAACGCTCCCgt > 1:102239/1‑143 (MQ=25) cgcgAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCAGCGAAAACATGTAATGCCGTCGTTTGTTAAATTTATTAATGGGAGCGTAACGCTCCCgct > 2:124892/1‑141 (MQ=25) gcgAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGAACATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCgttg > 2:989711/1‑143 (MQ=255) gAACACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCgttgtt < 2:449957/143‑1 (MQ=255) aaCCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGttttt > 1:288648/1‑143 (MQ=255) tATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGgctg > 1:861204/1‑143 (MQ=255) aTGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGgctgc > 1:1355434/1‑143 (MQ=255) tGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGgctgct > 1:557327/1‑143 (MQ=255) tGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGgctgct > 1:1267482/1‑143 (MQ=255) ttCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTACCGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACg > 1:49087/1‑143 (MQ=255) ttCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGAAATGCCGTAGTTTGTTAAATCTATTAACGGGACCGTAACGCTCACGTTGTTTTCTGTTCGgctgcgcagg > 2:706483/1‑138 (MQ=25) ttCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCAGAAAGGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACg > 2:880872/1‑143 (MQ=255) gAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTGTTTTGTTAGGCTGCTAACTGtt > 2:629738/1‑143 (MQ=255) | GACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTT > NC_000913/1196167‑1196444 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |