| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,794,877 | A→G | 9.5% | I209V (ATC→GTC) | gabP → | gamma‑aminobutyrate transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,794,877 | 0 | A | G | 9.5% | 234.4 / 3.7 | 106 | I209V (ATC→GTC) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/51); new base G (7/4); total (51/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.14e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TTACCCTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCGAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCA‑CCATGTT‑CTCGTTTATGGGCGCAGAAA‑TTGTCACCATTGCCGCCGCGGAATCCGACACGCCGGAAAAACATATTGTCCGCGCCACCAACTCGGTTATCTGGCGTATTTCTATCTTCTATTTATGTTCTATTTTTGTCGTCGTGGCATTAATTCCGTGGAATATGCCCGGACTAAAAGCCGTCGGTTCTTATCGCTCGGTACTGGAATTGCTCAATATTCCCCATGCGAAATTAA > NC_000913/2794650‑2795114 | ttACCCTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCGAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCA‑CCATGTt‑c < 1:965898/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |