| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,712,474 | 0 | A | G | 6.7% | 337.3 / 2.4 | 130 | L154P (CTC→CCC) | yhjY | autotransporter beta‑domain protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (63/49); new base G (9/3); total (77/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TTAAAATCTGGCGCTAACCCCCATCGTATACAGATAGTCGCTATTATTAGTGGTATTTTCTGCCTGAGTTAGCGCGGCATAGGCGGCAATATTTTGATTGAGCAACATATCAGCGCCTACGGTGACATCCAGCCAGTTGCCGTTCTGGTTTGTCGCCGTCATCCGGCTCAGGCCTGATTGCGCCTTCCAGATATTCTCGCCAAATTGCTGGTTATAGCTGATTTGCGCCCA‑GGGTCGGAGATCGCCAAGCCGGGAGTCAACACGCCAGCCTAAGGTACTCACGCTGGCATGCCATAACGGATCGGTCAGCGTGGTAGTACTGTCGCCAAACTCGTTATACATCGAGGTGGTTGTGCCATCGTAATGTAATGCCGCGACCGGGCCGGTTGTAACCTGTTCATATAAAGGAAAATTCCAGCCCATACTCATACTGCTGGTCACATCCACAGGGGTTTCTTCCGCCAGATT > NC_000913/3712236‑3712703 | ttAAAATCTGGGCTTAACCCCCATCGTATACAGATAGTTGCTATTATTTGTGGTATTTTCTGCCTGAGTTAGCGGGGCATAGGCGGCAATATTTTGATTGAGCAACATATCAGCGCCTACGGTGACATCCAGCCAGTTGCCGTTCTGGTTTGTCGCCGTCATCCGGCTCAGGCCTGATTGCGCCTTCCAGATATTCTCGCCAAATTGCTGGTTATAGCTGATTTGCGCCCA‑GGGTCGga < 2:300881/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |