| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,759,640 | T→C | 10.3% | L219S (TTA→TCA) | yfjI → | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,759,640 | 0 | T | C | 10.3% | 109.1 / 2.7 | 36 | L219S (TTA→TCA) | yfjI | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (18/14); new base C (2/2); total (20/16) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACTTGGCAACAAATGAAAGACTTAAAGAACTACTTACGACAAACCCGAAAGCTCCAGTGAGATTCAAATTTTTATTTAACGATGCCACACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGAAATTGTTAATGAGAGCATCATTAAAATTAATGAAAATAATCGCATCTGCCTCCGATTCTCTGCAGA > NC_000913/2759382‑2759916 | aCTTGGCAACAAATGAAAGACTTAAAGAACTACTTACGACAAACCCGAAAGCTCCAGTGAGATTCAAATTTTTATTTAACGATGCCACACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCACGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTc > 1:470074/1‑286 (MQ=255) gAAAGACTTAAAGAACTACTTACGACAAACCCGAAAGCTCCAGTGAGATTCAAATTTTTATTTAACGATGCCAAACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTa < 2:441083/289‑1 (MQ=255) ctactTACGACAAACCCGAAAGCTCCAGTGAGATTCAAATTTTTATTTAACGATGCCACACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGtt > 1:359755/1‑289 (MQ=255) gACAAACCCGAAAGCTCCAGTGAGATTCAAATTTTTATTTAACGATGCCACACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGAc > 1:27375/1‑289 (MQ=255) aCCCGAAAGCTCCAGTGAGATTCAAATTTTTATTTAACGATGCCACACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGaa > 1:143299/1‑289 (MQ=255) aaGCTCCATTGAGATTCAAATTTTTATGTAACGATGCCAAACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGgaga < 2:470074/289‑1 (MQ=255) aaGCTCCAGTGAGATTCAAATTTTTATTTAACGATGCCACACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTTGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGgaga < 1:328077/289‑1 (MQ=255) aTTCAAATTTTTATTTAACGATGCCACACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGa < 2:455997/269‑1 (MQ=255) aTTCAAATTTTTATTTAACGATGCCACACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGa > 1:455997/1‑269 (MQ=255) aaCGATGCCACACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCAc < 1:89909/289‑1 (MQ=255) acacgtccACACCTGCAGCTATTAAATCTCATCTCTTTGGGCACTGGCGATCAGGCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATCAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACg < 1:488911/283‑1 (MQ=255) aTTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCt > 1:81276/1‑288 (MQ=255) tctcTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGa < 1:170457/182‑1 (MQ=255) tctcTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGa > 2:170457/1‑182 (MQ=255) tgtgGGCACCGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATCAATTAGAGATGCAATAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGATTATATCGACAGGAATGGAGATCTGGCCAAGGGGATTGGATTTTTTACATGGTGCCTCATCTTCCTGCCTGCTTCAGCACAATGTa > 2:371984/1‑289 (MQ=255) aCTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGaaa > 2:514289/1‑289 (MQ=255) aCTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGaaa > 1:346118/1‑289 (MQ=255) tCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAAccc > 1:384987/1‑289 (MQ=255) gCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACAtt > 1:467726/1‑289 (MQ=255) gagATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGc < 2:166777/287‑1 (MQ=255) tAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATCAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCa > 2:472825/1‑288 (MQ=255) aTGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCa < 2:467726/289‑1 (MQ=255) ttAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGa > 2:247728/1‑289 (MQ=255) tAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGaa > 1:87728/1‑289 (MQ=255) gAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGAAATTg < 2:384987/289‑1 (MQ=255) cTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGAAATTGTTa > 2:39770/1‑289 (MQ=255) gggATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGaaa < 2:423452/261‑1 (MQ=255) gggATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGaaa > 1:423452/1‑261 (MQ=255) tACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGAAATTGTTAATGAGAGCATCATTAAAATTAATGAAAATAATCGCa > 2:422281/1‑287 (MQ=255) tACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGAAATTGTTAATGAGAGCATCATTAAAATTAATGAAAATAATCGCa > 1:78088/1‑287 (MQ=255) aCGGTGGAAAGGAAAAACGAGGCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGAAATTGTTAATGAGAGCATCATTAAAATTAATGAAAATAATCGCATCt < 2:240067/289‑1 (MQ=255) aCGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCGATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGAAATTGTTAATGAGAGCATCATTAAAATTAATGAAAATAATCGCATCt > 2:277521/1‑289 (MQ=255) aCGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGAAATTGTTAATGAGAGCATCATTAAAATTAATGAAAATAATCGCATCt < 2:143299/289‑1 (MQ=255) aaCGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGAAATTGTTAATGAGAGCATCATTAAAATTAATGAAAATAATCGCATCTGCCTCCGATTCTCTg < 1:514289/289‑1 (MQ=255) aaCGAGCCCGAGAAATCAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGAAATTGTTAATGAGAGCATCATTAAAATTAATGAAAATAATCGCATCTGCCTCCGATTCTCTg < 1:472825/289‑1 (MQ=255) gCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGAAATTGTTAATGAGAGCATCATTAAAATTAATGAAAATAATCGCATCTGCCTCCGATTCTCTgcaga < 1:422281/288‑1 (MQ=255) | ACTTGGCAACAAATGAAAGACTTAAAGAACTACTTACGACAAACCCGAAAGCTCCAGTGAGATTCAAATTTTTATTTAACGATGCCACACCTGCAGCTATTAAAGCTCATCTCTGTGGGCACTGGCGATCAGTCGGCATCATGTCTGATGAAGCTGGGATCATTTTTAATGGTTACACACTTAACGAGCTGCCGTTTATCAATAAGATGTGGGATGGTTCAATATTTACGGTGGAAAGGAAAAACGAGCCCGAGAAATTAATTAGAGATGCAAGAATAACACTGTCGCTGATGGTCCAGCCTAATGTTTTTAAGGGTTATATCGACAGGAAAGGAGATATGGCAAAGGGGATTGGATTTTTTGCACGGTGCCTCATGTGCCAGCCTGCTTCAACACAAGGTAACAGAAAAATTTCCAACCCAATTTTTTCAAATGAACATTTGCCGGTATTTCACCAACGTCTTATGGAAATTGTTAATGAGAGCATCATTAAAATTAATGAAAATAATCGCATCTGCCTCCGATTCTCTGCAGA > NC_000913/2759382‑2759916 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |