| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 45 (0.690) | 36/278 | 1.0 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 75 (1.160) | 61/276 | 0.0 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/458930‑458790‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCAC > NC_000913/608008‑608140 GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCC < 1:1149467/143‑1GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCC < 2:789992/143‑1 CAAGACGGGGATTGCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCC < 2:50142/143‑1 TTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAAC > 1:877287/1‑143 AATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCC < 2:883406/128‑1 AATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCC > 1:883406/1‑128 TGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGGTGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAG > 1:640662/1‑143 GCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTGAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGTATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:202981/143‑1 TTCACAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT < 1:78210/143‑1 CAGAACGCTCAGGAGTCAGAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 1:1090692/143‑1 cgaaccgTCAGTATTCATAGATCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACTCCATCTATTAACATTTACGTCAGTATATGGGTATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAATGGTTGTG < 1:367736/136‑1 TCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTATGTCAGTATATGGGGAGGTTTTCCCATAAGCTCTATCTTGAGGCGTGTTGTATTtg > 1:337204/1‑141 TCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC > 1:966383/1‑143 TCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAAGGTTGTGTTGTTAC > 2:1017489/1‑143 GGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTCACATGTACGTCAGTATATGGGGAGGTTTCGCCATACGCGCAAGCTTACGGGATGCGGTATTCCGCC > 1:474121/1‑143 ATTCAGAGAGCTCTCACTTAGTTTAATTTCCGCCGGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTG < 1:448791/143‑1 cTAGAGCTTGCTCTTAGTGTAATTTCCGCCAGTGAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCAGCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGTGTTGTGGTATTACGCCTGATAT < 2:1034990/142‑1 ATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATAT > 1:221534/1‑143 AGCTCTCTCTTAGGTTAATTTCCCCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATT < 2:363051/143‑1 gCTCTCTTAGGTTACTGTCCGCCAGGCAATCAGTGGGCACGACTCTGCTCCACGCCATCTATTGACATGTCCGTCCGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTGAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:294140/142‑1 TCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATAAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCGCATAAGCGCTAACTTAAGGGATGCGGTATTACACCTGATATAGTTTAAgc > 2:1047826/1‑141 AATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATCTGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACCTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGCAT > 2:533837/1‑143 TTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGAGGCTGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGTGATTAGACAGGATAGGATTAAACATGCCGATGgaaga > 2:315676/1‑138 CAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGGTGTTTCCCCATAAGCGCTAACGTAAGGGTTGGGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGACGATGAACTGCTCTCAC > 2:557619/1‑143 CAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAC < 1:616018/143‑1 AGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACG > 1:941777/1‑143 GATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGT > 1:1152273/1‑143 ACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCCCGATAACTGGTCAGCAA > 2:505321/1‑143 ACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGCGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAA > 2:1072824/1‑143 TGTGCTTCATGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTG > 2:222657/1‑143 TGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGCTGAATTACTCTCACGATAACTGGTCCGCAATTCTG > 1:1035552/1‑143 GTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGG > 1:509955/1‑143 TGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 1:163204/143‑1 TGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGGCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 2:665264/143‑1 GCTTCCCGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCC < 2:641826/143‑1 GCTTCACGCCGTCTATTAACAGGTACGTCAGTATATGGGTATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCC < 1:907936/143‑1 ACGCCATCTATTAACATGTACGGCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAGAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:777895/143‑1 CGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATT > 1:596105/1‑143 CCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATACGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAGTACTCCCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGACCCACATTGG > 2:385864/1‑143 CCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATACTGG > 2:840834/1‑143 ATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCCGATCTGCATTTACATGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCCGCAATTCTGGCCCATATCGGTACGCC > 2:1039345/1‑143 TTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCACTTCTGGCCCATATTGGTAAGCCC > 1:421163/1‑143 TTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCC > 2:558733/1‑143 ACATGTACGTCAGTATATGGGGGTGTTTCCCCATAAGCCCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAA < 1:931717/143‑1 ACATGTACGTCAGTATATGGGGCTGTTTCCCCATAAGCGCTCACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCTGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGGCCATATTTGTATGCGCGAA > 2:395684/1‑143 ACATGTACGGCAGTATGTGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTACCGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAA < 2:625136/143‑1 ATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGGAGA > 1:1026242/1‑143 TATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATCTGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTAGTACGCCCGAAGAACTGGctcctc > 2:631698/1‑137 GGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGCAGAACTGGATACTTCGGCA > 1:183372/1‑143 GGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTCGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCAC > 1:828687/1‑143 GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/458930‑458790‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCAC > NC_000913/608008‑608140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |