| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,293,032 | IS1 (–) +8 bp | intergenic (‑110/‑488) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 78 (1.180) | 58/284 | 0.1 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1293039 | 0 (0.000) | intergenic (‑117/‑488) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1293032 = | 0 (0.000) | 66 (0.990) | 50/284 | 0.3 | 100% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
TTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCT > NC_000913/1292897‑1293181 | ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGTAATTCAAAATTGTTATTTATTTTGTaccg > 1:132835/1‑143 (MQ=255) gtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgc > 1:748397‑M1/135‑143 (MQ=255) gtccggcggtgcctttgccgtcacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagcccctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgc > 1:529271‑M1/135‑143 (MQ=255) gAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggta < 2:475706‑M2/143‑5 (MQ=255) aagtgtaagtgCTTCCCGCACTGTAGTAAGCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGTGAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTTTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaa > 2:1113163‑M2/6‑138 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaa > 1:527853‑M2/1‑138 (MQ=255) aTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTAATTTTGTGCCGggtaat < 1:531564‑M2/143‑7 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCt > 1:1030754‑M1/123‑143 (MQ=255) gTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactcca < 2:680095‑M2/143‑14 (MQ=255) tttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCtt > 2:360459‑M1/122‑143 (MQ=255) gCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaac > 1:406249‑M2/1‑128 (MQ=255) gCTTCGCTCATTGGAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTGGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCTggtaatgactccaac > 2:1009939‑M2/1‑128 (MQ=255) cTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaact > 2:1175735‑M2/1‑127 (MQ=255) cTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGgggaatgactccaact < 1:622088‑M2/143‑17 (MQ=255) cTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAAAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAACCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaact < 2:594903‑M2/143‑17 (MQ=255) cTTAGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaact < 2:487542‑M2/143‑17 (MQ=255) cGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGCGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAANGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacgtgt < 1:652398‑M2/143‑20 (MQ=255) gCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttatt > 1:302440‑M2/1‑123 (MQ=255) tacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaaa > 2:138341‑M1/114‑143 (MQ=255) gcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAGAAtt < 1:558731‑M1/33‑1 (MQ=255) caccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTa < 2:1091286‑M1/34‑1 (MQ=255) caccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGcc < 1:648097‑M1/37‑1 (MQ=255) taATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttt < 1:131609‑M2/143‑32 (MQ=255) aagCTTGTATTGGGGTGGTTGGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAAGGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgcctccaacttattgatagtgttttatgttca > 2:147013‑M2/1‑105 (MQ=255) aaaCGTATATTAGGGTGGGTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttca > 2:871901‑M2/1‑105 (MQ=255) tagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgc > 1:221636‑M1/96‑143 (MQ=255) ctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaaacagtaagttggcagcatccacTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAACCAGAAAAGACGCGGc < 2:76767‑M1/51‑1 (MQ=255) tatTGGGGGGGTTTGTGGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCTATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatg > 2:1085000‑M2/1‑98 (MQ=255) ttGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcc > 1:829797‑M2/1‑96 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAg < 2:327323‑M1/57‑1 (MQ=255) gggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatgatagagtaaagcagtacgttggcccgaccgccTGGGGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCt < 1:276920‑M1/61‑1 (MQ=255) ggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTa < 1:1105020‑M1/62‑1 (MQ=255) acagccggcagaaacggaaggcacggcggcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAACAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAtt > 1:93889‑M1/80‑143 (MQ=255) gtcgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgt > 1:88640‑M2/1‑84 (MQ=255) tgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac < 2:936252‑M1/69‑1 (MQ=255) atagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCg > 1:781506‑M1/73‑143 (MQ=255) aGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatg > 1:416784‑M2/1‑80 (MQ=255) ggTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc > 2:458443‑M2/1‑79 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTTTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgca < 1:169768‑M2/143‑66 (MQ=255) gaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgatg < 1:808163‑M1/74‑1 (MQ=255) aataatAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCGGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGGGCCGggtaatgagtccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagc > 2:592082‑M2/1‑76 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgatga < 2:1147284‑M1/75‑1 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgatga < 1:562309‑M1/75‑1 (MQ=255) taGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgctgctccac < 1:704849‑M2/143‑73 (MQ=255) gatgccactggagcccctcaacaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCg > 1:1146621‑M1/64‑143 (MQ=255) agagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccacc > 1:117598‑M2/1‑70 (MQ=255) aagccactggagcaccttcaaaaaaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgc > 2:86397‑M1/63‑143 (MQ=255) actggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCAc < 2:722600‑M1/86‑1 (MQ=255) actggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTCACACCGATGATTTCGCAGCAc < 2:933154‑M1/86‑1 (MQ=255) tttAATTCAGTTGGGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt > 1:88865‑M2/1‑64 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGTCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt > 1:1049738‑M2/1‑64 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt < 2:33764‑M2/143‑80 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacagcatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATAAAGCCCAACTTACACCGAAGATAtcgcagcaag < 2:921616‑M1/87‑3 (MQ=255) aaaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtactgacttcttctttttgatttttttttatgttcagataatgcttgatgactttgtcatgcagctccaccgattttga > 2:532667‑M2/1‑62 (MQ=255) aaaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttga > 1:1101426‑M2/1‑62 (MQ=255) gagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggctgcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCGAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGa > 1:792209‑M1/54‑143 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtcatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 1:601289‑M2/1‑59 (MQ=255) gcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAgg > 1:500279‑M1/52‑143 (MQ=255) gcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGAGGCATATAGCCGTATTTACACCGAGGATTTCGCAGCACGGGAgg < 2:111572‑M1/92‑1 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaa < 2:575788‑M1/96‑1 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTGGCAGCACGTGAGGTTaaa < 1:7129‑M1/97‑1 (MQ=255) tgtgCACTAGCGAGGAATGGAAGGAATTCAAAATGGTGCTTTATTTTGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag > 1:92841‑M2/1‑53 (MQ=255) gtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc > 1:478230‑M2/1‑52 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGGGGTTAAAAc < 1:536013‑M1/99‑1 (MQ=255) tgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattggtagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgccgctccaccgatgttgagaacgacagag < 2:268437‑M2/143‑93 (MQ=255) aacaccatcatacactaaatcagtaagttggaagcatcaccTTGTGCCGCCAATACATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATGTCGCAGCACGTGGGGTTAGACCTTc < 1:1143076‑M1/102‑1 (MQ=255) acaccatcatacactaaatcagtaacgtggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTcc > 1:1162074‑M1/41‑143 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaccgacagcgact < 1:896263‑M2/143‑96 (MQ=255) ccatcatacactcaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATAGCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGa > 2:830020‑M1/38‑143 (MQ=255) aGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc > 1:680095‑M2/1‑45 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgt > 1:588498‑M2/1‑43 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgt < 1:703158‑M2/143‑101 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATACAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGAtt < 2:293295‑M1/108‑1 (MQ=255) cAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtc < 1:108289‑M2/143‑102 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCCAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaaataatgcccgatgactttgtcatgcagttcctccgattttgagaacgacagcgacttccgtcc > 1:332952‑M2/1‑41 (MQ=255) taccctaaaccagtaagttggccgtctcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTCTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCTAGGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATg > 1:146163‑M1/32‑143 (MQ=255) tGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagcc > 1:580907‑M2/1‑36 (MQ=255) tGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatcactttgtcatgcagctccacagattttgagaacgaccgcgccttccgtccccgcc < 2:872805‑M2/143‑108 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTcatggcg < 1:689528‑M1/115‑4 (MQ=255) taaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTcaca < 2:1003849‑M1/117‑1 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgcctcccacttcttgatagtgttttatattcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgccttccgtcccagccgt < 1:8469‑M2/143‑110 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagctaatgcccgatgactctgttatgcggctccaccgattgtgagaacgacagcgacttccgtcccagccgt < 1:270985‑M2/143‑110 (MQ=255) gAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagcacgacagcgacttccgtcccagccgtgcca < 2:640079‑M2/143‑114 (MQ=255) aaTTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccag > 1:32770‑M2/1‑29 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgattgtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatgttgaggacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggt < 2:1145626‑M2/143‑117 (MQ=255) taagtgggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATgg > 1:861962‑M1/19‑143 (MQ=255) tCAAATTTGTTTTTTATTTTGTGATGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtg > 2:399220‑M2/1‑26 (MQ=255) gagttggcggcagcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATggg > 1:468991‑M1/18‑143 (MQ=255) tggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATACAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGgaga > 1:293295‑M1/14‑143 (MQ=255) tGTTCTTTATTTTTTGTCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctc > 2:915072‑M2/1‑19 (MQ=255) tGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctc > 2:54723‑M2/1‑19 (MQ=255) gcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGAtt < 1:240911‑M1/132‑1 (MQ=255) tCGTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacgttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcaga > 2:517147‑M2/1‑16 (MQ=255) gcatcaccTGGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATc > 1:53622‑M1/9‑143 (MQ=255) catcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCg < 1:95862‑M1/136‑1 (MQ=255) ttATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagcagtgtcaggtgctgcctcagctgc < 2:626316‑M2/143‑131 (MQ=255) tgCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatg > 2:759752‑M2/1‑5 (MQ=255) ccgccAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGTGAGATTATCGTCGGCTgacgac > 2:195572/1‑143 (MQ=255) ccgccAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTgacgac > 2:494153/1‑143 (MQ=255) gccAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCt < 1:1091286/143‑1 (MQ=255) | TTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCT > NC_000913/1292897‑1293181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |